Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Clone 'cign070n03'
  2. Transcript 'Mooccu.CG.ELv1_2.S68...'
  3. Transcript 'KH2012:KH.C3.246.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C3.246.v1.A.SL2-1

Possible name(s)

MIEN1; SELENOT

Location

KhC3 [2,523,332 / 2,524,543]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 146

>KH.C3.246.v1.A.SL2-1
GYRRAFEEYAQIINQRYSEVRIDGGNYPPPKFNQMAAMVLSVIKFMLIGCILTGVNPFEK
VGMETPQIYHWARENMIYACIMLFFFSNAIETQLTSTGAFEILLNDVTIWSKLKSGRVPR
VDELMQIIDSQINVGKMNPTDNFVQS

Nucleotide sequence

Length: 1,211

>KH2012:KH.C3.246.v1.A.SL2-1
CATGGCCAATTTTAGCCTTGTGAGTTTATTTATAGTCGGTGCAATTTTTATGTCATGGAA
AGACTTGAGTCGTAACGTGGAAGTTGAAGCTGGCAGTGCAAGTGAAGATGCTCCTATACC
AAAACTGAAAAACCAGTTCACTGTACCAGTGGTCAAGTTTCTTATCTGCCAATCCTGAGG
TTACCGTCGTGCCTTCGAAGAATATGCGCAGATTATTAATCAGCGCTATTCGGAGGTACG
CATTGATGGGGGAAACTACCCACCCCCTAAGTTTAACCAAATGGCTGCTATGGTATTGTC
TGTAATTAAGTTTATGTTGATTGGTTGTATTCTCACTGGTGTCAACCCGTTCGAAAAAGT
TGGCATGGAAACACCTCAGATTTATCACTGGGCGCGTGAAAATATGATTTACGCTTGCAT
AATGTTGTTCTTTTTCTCCAACGCCATTGAAACTCAACTCACATCTACTGGTGCGTTTGA
AATATTACTAAATGACGTCACAATCTGGTCAAAGCTGAAATCAGGAAGAGTGCCCCGTGT
GGACGAATTGATGCAAATAATCGACTCCCAAATAAACGTCGGAAAAATGAATCCTACGGA
CAACTTTGTGCAATCATAAACTGAAGATGGTGTTTCGAAACTTTTCAACTTTAGCAATAG
TTGTTAAAAAACTATGTGGTGTTGGTGTCATTAGCTGGCATTAATCATTTCAACTTCTAA
CAGATGTTTTAAGATTCGAAATAGAAAGGTCATGGAATTTTACAGGATTTCATTTAAAAA
ATAAAAACTGCAAACTGTCATTTCACATTTATATATATTTTGTTAATTTGTTTTATTTGT
TAATCTTATGTCCTCATTGGTATGTGATTTTTTTCCATTTATTGCATTGTGTCTTCATAG
TTTATTTATGATTCACTATTCAGATATTATACATGGGTTTAGGCAAATTTGTAGTACGGT
AGCAGGAGCTGGTACTTTCGTGAACATTTCTGTTGTGGGATTTTAATCAAATTTATGATG
GTTTTATGTCGAAAGTTGAATGACTGACATAAACTTGATGTAGCTTATTGGGTAGATAAG
CGTATTGATTATATTTCATTTGCAGTTTAATGATTTTTCGTTGTGCTCGTTCTGTGCTAC
TTTACAAATTTTATGGACTGTATAATTTGTGCACGTGGTAACATCAGCTTCATTCTATTG
TTTGTCTTCAG

InterProScan

TIGRFAM
Selenoprotein_Rdx-typ (IPR011893) - T[1-129] 2.3E-20
SUPERFAMILY
Thioredoxin-like_sf (IPR036249) - T[1-29] 4.47E-13 - T[96-134] 4.47E-13
PANTHER
Selenoprotein_T (IPR019389) - T[1-134] 2.3E-54
Pfam
Selenoprotein_Rdx-typ (IPR011893) - T[2-129] 3.0E-12

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SELT_HUMAN 52.239 % 157 1.49E-49