- Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S10...' >
- Transcript 'KH2012:KH.C1.313.v2....' >
- Transcript 'KH2012:KH.C4.254.v1....' >
- Transcript 'Boschl.CG.Botznik201...' >
- Transcript 'KH2012:KH.C4.254.v1....'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C4.254.v1.A.SL1-1
Possible name(s)
ATP8B1; ATP8B2; ATP8B4
Gene model
Location
KhC4 [3,374,342 / 3,392,391]
Amino acid sequence
Length: 1,235
>KH.C4.254.v1.A.SL1-1
SQMDKLPWFKKREKEEQRDIKANDVEYNANFQYAVNKIKTSRYTWYNFILVNLWEQFHRV
VNVYFVCLLILQFIPEISSLNPTTTLIPIITVLLITAIKDAVDDIKRHRSDDSVNNRKSS
VVKDNALVQEKWMDIKVGDVIQLKNNDHVTADLLLLSSSEEHNLVYIETAELDGETNLKV
RQALNVTGGMNEDLKALHSFDGVIKCEAPNNYLHKFTGNLYWNNETHSIDNEKILLRGCT
LRNTEWCFGLVIFAGPETKLMQNTGKSVLKRTSIERLLNKLVWLIFAFLLFLATVTAIGN
TIWERFVGVYFQAYMPWATFSPNEYMSGFLMFWSYIIILNTVVPISLFVSVEFIRLGQSW
FIDWDRLMYYEKKDLPAVARTTTLNEELGQIEYIFSDKTGTLTQNIMEFNKCTINGICYG
DVYNEDGIAIVPDDVCFQLATKLQNTPIADFSFNADAEKDFRFFDQRLINCITSGDAKSH
DFFRLLAICHTVMPDVTPEGNLIYQAQSPDEGALVTAARNFGFVFRERTFDTVTVSELGK
DVTYQVLAILDFDNVRKRMSVIVKDPSGNIRLYCKGADSVIYERLGNSREDEDLKNTTTQ
HLDEFAGHGLRTLCLAVKNLDEHAYNVWKDAHFKASTALEDREDKLSAVYEEIERDLDLI
GATAIEDKLQDGVPETIANLSKANIKIWVLTGDKQETAVNIGYSCNMLTEEMKNVFVISG
YTFDEVAAEIKQAYDDIENERSHASPMSSRDDANFPNVVVHTSKVANGRAVVFQSDQDNK
FGLVINGHSLVHALNEELELKFLDLASLCTSVICCRVTPLQKAKVVELVKKNKKAVTLAI
GDGANDVSMIKAAHIGVGISGEEGTQAVLSADFAFGQFRYLERLLLVHGRWSYMRMCKFF
GYFFYKNFAFTLVHFWFGFFNGLTAQSAYDDLFVTLYNIVYTSMPIFMLAIFDQDLNDKY
CIKFPKLYLPGQKNELFNVKIFFKSIIRGILTSLVLFFVPYGAFAEGMSPSGADMTNLQT
VSTVISTCLIIVVTLQVALDTSYWTPVNHFFTWGSIFIYFLLTFAMYSDGLFQLSTTFQF
IGVARNSYQLASLWFTMFLVCAICILPVLASRVLCTILWPTYTEKIMKLQLDEEKKARQR
KMKAAESLHAITEKIRSTFQLQRRGSRPRSGYAFSHERGFGDLITTGRMSMRRKSYHPQP
GRSKPEETSPPQSSSQPPPTNGVSTNTELYRQLPV
Nucleotide sequence
Length: 4,915
>KH2012:KH.C4.254.v1.A.SL1-1
TCCTCACTCGTGTCTAGTGTTGGAATAATGTGGAATTAGGTAACAAACTGCTGAAGCCAA
ATGGATAAGCTGCCATGGTTCAAAAAACGTGAAAAGGAAGAGCAACGAGATATTAAAGCC
AATGATGTTGAGTACAATGCAAATTTCCAATATGCTGTGAATAAAATTAAAACATCAAGA
TATACCTGGTACAACTTTATTCTCGTTAATCTATGGGAACAATTTCATCGAGTTGTCAAC
GTTTATTTTGTTTGTCTTCTTATTTTACAGTTTATTCCCGAAATCTCTTCGCTCAATCCA
ACCACAACTTTGATTCCTATAATTACTGTGTTATTGATCACTGCCATTAAAGATGCTGTG
GATGATATAAAACGACATCGAAGTGACGATTCAGTTAACAACAGAAAATCTAGTGTTGTA
AAAGATAATGCGCTGGTGCAGGAAAAATGGATGGATATTAAAGTTGGAGATGTAATTCAA
TTAAAAAACAACGACCACGTAACTGCAGATTTGTTGTTACTTTCAAGCAGTGAGGAGCAC
AATCTTGTCTACATTGAAACAGCTGAATTAGATGGAGAAACAAATCTTAAAGTACGCCAA
GCTTTAAATGTAACTGGTGGAATGAATGAAGATCTAAAAGCCCTGCATAGTTTTGATGGT
GTTATTAAATGTGAGGCACCAAATAACTACTTGCACAAGTTCACGGGCAATCTTTACTGG
AACAATGAAACGCACTCGATAGACAACGAGAAGATTTTATTAAGAGGATGCACACTCAGA
AACACAGAGTGGTGTTTTGGGCTTGTTATTTTTGCCGGGCCAGAGACAAAACTGATGCAA
AACACAGGAAAATCGGTTTTGAAACGAACAAGCATTGAAAGATTACTGAACAAACTTGTG
TGGTTGATTTTTGCATTTCTCCTATTTCTTGCCACTGTCACGGCGATTGGAAACACAATC
TGGGAACGCTTTGTTGGAGTGTACTTTCAAGCATACATGCCATGGGCAACCTTCTCCCCC
AATGAGTATATGTCTGGATTCCTAATGTTCTGGTCATACATCATCATCCTTAATACAGTT
GTGCCTATCTCTCTATTTGTAAGTGTGGAGTTTATAAGGCTTGGCCAGAGTTGGTTTATA
GATTGGGACAGACTGATGTATTATGAGAAGAAAGATTTACCTGCTGTTGCACGAACCACC
ACATTAAACGAGGAACTTGGTCAGATTGAATACATCTTTTCTGACAAGACAGGGACACTC
ACACAAAATATTATGGAGTTTAATAAATGTACGATTAATGGAATATGTTATGGAGATGTT
TATAATGAAGATGGAATTGCTATTGTACCAGATGATGTATGTTTTCAATTAGCTACCAAA
TTACAGAACACACCAATTGCCGACTTCTCGTTCAACGCTGATGCAGAGAAAGACTTTCGA
TTTTTTGACCAGCGGCTAATAAACTGTATAACCTCCGGAGATGCAAAAAGCCATGATTTT
TTCAGACTGCTTGCAATTTGCCATACAGTCATGCCAGATGTAACTCCAGAAGGAAACCTG
ATTTATCAGGCTCAATCTCCTGATGAAGGTGCATTAGTTACAGCAGCTCGAAACTTTGGT
TTTGTATTTCGTGAGCGAACTTTTGACACAGTAACAGTATCAGAACTCGGCAAAGATGTA
ACCTATCAAGTTCTTGCTATTCTGGATTTTGATAACGTTCGTAAAAGAATGTCAGTCATT
GTGAAAGATCCATCAGGAAACATCAGGTTGTACTGCAAAGGTGCTGACTCTGTGATTTAT
GAACGACTCGGGAATTCTCGCGAAGATGAAGATTTGAAAAACACAACTACTCAACATTTG
GATGAATTTGCTGGTCACGGACTTCGAACTCTGTGTCTTGCCGTCAAGAATTTGGATGAA
CATGCTTATAATGTATGGAAGGACGCTCACTTTAAAGCAAGCACAGCATTGGAAGACAGA
GAAGATAAACTTTCTGCTGTGTATGAGGAGATAGAAAGAGACTTGGATTTGATTGGTGCG
ACTGCTATTGAAGACAAGTTACAGGATGGTGTACCAGAAACGATCGCAAACTTATCGAAA
GCCAACATTAAGATTTGGGTTCTGACTGGCGATAAGCAGGAGACTGCTGTTAACATTGGG
TACTCATGCAACATGCTTACTGAGGAGATGAAAAATGTATTTGTAATATCTGGTTACACA
TTTGATGAGGTTGCTGCTGAAATCAAACAAGCGTATGATGACATTGAGAATGAAAGATCT
CACGCATCACCAATGTCATCACGGGATGATGCTAATTTCCCGAATGTAGTTGTCCATACA
AGCAAAGTAGCGAATGGAAGAGCCGTTGTGTTTCAATCTGATCAAGACAATAAATTTGGT
CTGGTTATCAATGGGCATAGTCTGGTTCACGCATTAAATGAAGAACTCGAGTTGAAATTC
CTTGACCTGGCTTCTCTATGCACTTCCGTGATCTGCTGTAGAGTTACTCCGTTACAGAAA
GCTAAGGTGGTGGAACTGGTCAAGAAAAACAAGAAAGCGGTGACACTGGCTATCGGAGAT
GGTGCAAATGATGTCAGTATGATTAAAGCTGCTCACATTGGTGTTGGTATAAGCGGTGAA
GAAGGCACACAAGCTGTCTTGTCTGCTGACTTTGCGTTTGGCCAATTCAGGTACCTCGAG
AGGTTACTTCTTGTGCATGGTCGCTGGTCTTACATGAGAATGTGCAAATTTTTCGGTTAT
TTTTTCTACAAAAACTTTGCCTTCACCCTTGTACACTTTTGGTTTGGTTTCTTTAACGGT
CTAACTGCTCAGTCAGCATATGATGATTTGTTTGTGACACTCTACAACATCGTCTACACA
TCTATGCCAATATTTATGCTTGCCATTTTTGACCAGGATTTGAACGACAAATACTGCATC
AAGTTTCCAAAACTCTATTTACCTGGGCAGAAAAATGAACTTTTTAATGTCAAGATTTTC
TTCAAAAGTATAATACGCGGCATTCTGACAAGTCTTGTTCTTTTCTTTGTTCCCTACGGA
GCATTTGCAGAAGGCATGTCTCCCAGTGGTGCCGATATGACAAATTTACAAACTGTCTCT
ACTGTCATATCAACATGCTTAATAATAGTGGTAACACTGCAGGTTGCCTTAGACACTTCA
TATTGGACACCTGTCAATCATTTCTTTACATGGGGAAGCATATTTATCTACTTCCTCCTT
ACATTTGCAATGTACAGTGACGGACTATTCCAACTTTCAACAACATTTCAGTTTATTGGA
GTTGCAAGAAATTCCTACCAACTTGCATCCCTATGGTTTACCATGTTCCTTGTGTGTGCC
ATATGTATACTACCAGTACTTGCAAGCAGAGTGTTATGTACCATACTATGGCCAACTTAC
ACAGAGAAGATCATGAAGTTGCAACTTGACGAGGAAAAGAAAGCTCGACAGAGGAAGATG
AAGGCTGCTGAGAGTCTTCACGCGATCACCGAGAAGATCCGATCCACCTTCCAACTACAG
AGACGAGGATCAAGACCAAGATCCGGGTACGCGTTTTCCCACGAACGAGGATTCGGGGAT
CTCATCACTACTGGGAGGATGAGCATGCGGAGGAAAAGCTACCATCCTCAACCGGGGAGG
AGCAAACCAGAAGAGACTTCTCCTCCTCAGTCATCTTCCCAACCTCCACCCACCAACGGA
GTTTCTACAAACACTGAACTATACAGACAACTCCCAGTATGATAAACACGTTCTTATCAA
TAATGCTTATTATGTACAGTGGCCTTATTTTTTAGTGGTTTGATGGTCTGAATCATAACA
GTTGTAGGGATTGGCCTTTTAAATCTGTCTCTCTTTGCACTATCGCATGTGTCTTTCAGT
TCAGTCTAACACTAAACTCAAATGATAAATGCGTTGAACTGAGCAGTGGTGTTTGCCCAG
GTTGTCAATTCCAGCAATACATTATCCCTTCATAACTTTTTGATAGGGTGACTTGTATCT
AAAGCAGCTACATCAAAAACAGGTTAAAAACCACTTTCTCATAGAATTTTAGGCCCAATA
ATTATTTCCAGTGTAACCATCCTGTTCCCGTACTACCTTATACATGACTTAACAAGTTTC
AAAATGTGTCTTCATTCAAAGGCAAATAATGAATAACAATCGTAAAATCAAATGTTACCT
TTTTCCTATTGCTGTTTTGTTTAATCCTGTAATTGCACTTTGTGTGTTAAATGAGCACAA
TGTATGCACTAAACGCTATTTAATTCCAAGCAACAATCAATTCTAATATTCAAAAAACGT
TTTTAATTTTTTTCGCATTTTCGTTTAATGTAACATTTCTAAAAAATGAACACTTAACCC
CTAACATATAAAGCCTTTACCTCAAGTGGAAATTAACAAGTTAAGTACATTTAACTACAA
AGCGTTAATCACATCTATTGTAAGTAAACAGTGTCGTAATAATTTATCCCAACCTCACGA
GATGGTAAAAAGCCTAGTTAATTATTAACTCTAAGCAAGCAATAAGCTGACCCACCTATA
TACATATGCCTGCCTTGCTTGTGGTCCTTTAAAAGCAAACTATGACAATGTACATTGTAA
GCTTCAGCCAAGTTTCAAACTTTGTTCCATAGAGTTGCATATCTTATTAGAAATGAACTA
TTATACGTAGTATGGTGTACTAATTTATCTAAGCAAGTTTAGGAAGGTTGTAAGTGTGAA
TATAACTCTGTTTTTCTCTATGTAATTTCAAGTAGCTATCTCCTATCAGTTGTATTGTAT
AATCTAACTATATGTGATATATCTTATGAACCTTATTTATGCCAAAAATGTATGCACTTG
TCTAATCCGTCAATAAAATCAGCTAAAAAATTATTGGATTATTTGTCGAGCAGAG
| PANTHER |
ATP8B4 (IPR030348) - T[15-1208] 0.0 |
| PANTHER |
P-type_ATPase_IV (IPR006539) - T[15-1208] 0.0 |
| Pfam |
P-type_ATPase_N (IPR032631) - T[20-86] 2.7E-23 |
| SUPERFAMILY |
ATPase_P-typ_TM_dom_sf (IPR023298) - T[32-120] 7.45E-56 - T[265-389] 7.45E-56 - T[889-1116] 7.45E-56 |
| TIGRFAM |
P-type_ATPase_IV (IPR006539) - T[33-1126] 0.0 |
| SUPERFAMILY |
ATPase_P-typ_transduc_dom_A_sf (IPR008250) - T[117-187] 1.16E-15 - T[223-263] 1.16E-15 |
| SUPERFAMILY |
HAD-like_sf (IPR036412) - T[390-406] 2.48E-34 - T[601-707] 2.48E-34 - T[812-896] 2.48E-34 |
| ProSitePatterns |
ATPase_P-typ_P_site (IPR018303) - T[397-403] . |
| SUPERFAMILY |
ATPase_P-typ_cyto_dom_N (IPR023299) - T[402-436] 4.8E-24 - T[463-626] 4.8E-24 |
| Gene3D |
ATPase_P-typ_cyto_dom_N (IPR023299) - T[479-660] 7.3E-21 |
| TIGRFAM |
P_typ_ATPase (IPR001757) - T[811-925] 8.9E-33 |
| Pfam |
P_typ_ATPase_c (IPR032630) - T[868-1121] 1.9E-80 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| AT8B4_HUMAN | 54.863 % | 1328 | 0 |
| AT8B2_HUMAN | 56.412 % | 1345 | 0 |
| AT8B1_HUMAN | 50.122 % | 1138 | 0 |