Aniseed - Transcript Card

Sequences

Amino acid sequence

Length: 870

>KH.C6.43.v1.A.SL2-1
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NTVSEPLSQSALTTDLVNLDLDPKTEPKLVNVSKDDPPASIMHLDNSGQKYPDLPRPKSS
SFVSYISPTAPKPMEIVTNQNNINSSDSSRAGMHDVGRSAFSNFEGSTGKNELTSHLLER
DKLMPLYMAKRQDDYTSTAPFNVFVGTWNVNGQLPTEPLDAWVSSEATPPDVYAIGFQEL
DLSKEAFVFTESSREEEWMRAVKQALHPGASYKLVKHIRLVGMMLLVFAQDRHLQDITAV
ASHHVGTGLLGKMGNKGGVGIRIMLHNSSLCFINSHLAAHLEEIQRRNQDYEDICSRMKF
PDPEGQSISVFSNDVLIWLGDLNYRIDKLPLETVKERIEKGQYEKLKEHDQLTNQRREGN
VYPDFEEGDLTFRPTYKYNPGTDEWDTSEKCRCPAWCDRILWKESAKAKPRKTKRKDLVQ
LLKYQAHLSLKISDHKPVSAVFKINVKVINRELYRKVYEEEIRRLDRMENEWLPTMVLNQ
HSLEFGTVKFQQAVQRTVEILNTGQTPCHFEFIGKLGEKAFCKPWLTVGKPKGYVLPGDK
LVIEFEVYVNKNTAPSLNKEEDKIEDILILHLVGGKDFFITVNGKYSPSCFGTSIEALCW
MKKPIEQMDRKELTRLSCTESRDWQVNNEKHHSSQMLNVPKELWRLLDHLYQYARHQPDL
FQQPGLHEELKMIQENLDSQLPTVGTPLPGSNHSVAEALLIFLEALPEPVIPFEYYNMCL
QLYNNYDQGQELIHKMPPHHVNVFNYIISFLQELPKYEENGLNLHLLATIFSGLLLRPSS
VQRKQNTEGRMDRMKATSFIEMFLKKKLIE

Nucleotide sequence

Length: 3,997

>KH2012:KH.C6.43.v1.A.SL2-1
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AGAGGTATAATACATCATGGATAACCATGCATACAACGATTCTTCTACCCCAAATAACTT
AATTGACTTACAACCAAATACTACAGAACATTTGTCAGAATTTGACCCGTTTGCACCAAC
TGTGCAAAAAGTGACACGAAAACCGAGCAGGCCACCACCCCCACCCCCAAATGTGCCTCC
GAGAAGAACAAATACAGTTTCCGAGCCTCTGAGCCAGTCTGCTTTAACCACGGACCTTGT
AAACTTGGATTTGGACCCAAAAACTGAGCCGAAATTGGTCAATGTCAGTAAAGATGACCC
CCCAGCGAGCATTATGCATTTGGACAATTCGGGTCAAAAATATCCAGATCTACCGAGACC
AAAGTCATCTTCTTTTGTGAGCTATATTAGCCCGACAGCCCCAAAACCTATGGAAATCGT
GACAAATCAAAACAATATAAATTCAAGCGATAGCAGTCGTGCAGGCATGCACGATGTGGG
GAGATCGGCGTTTTCGAACTTTGAAGGATCAACTGGTAAAAATGAGTTGACGTCTCATTT
GCTTGAAAGGGATAAGTTGATGCCGCTCTATATGGCCAAGCGACAAGATGACTATACCTC
AACTGCACCTTTCAATGTATTTGTTGGGACTTGGAACGTGAATGGTCAGTTACCAACTGA
ACCATTAGATGCTTGGGTTAGTAGTGAAGCTACCCCACCGGATGTATATGCAATTGGGTT
CCAAGAGCTTGATTTGAGCAAAGAAGCTTTTGTATTCACTGAGTCATCACGAGAAGAAGA
ATGGATGAGAGCTGTCAAGCAGGCCCTGCATCCTGGTGCTTCATATAAACTGGTAAAACA
CATACGTTTGGTCGGTATGATGTTATTGGTGTTTGCTCAGGATCGCCACCTTCAGGATAT
AACAGCAGTGGCTTCGCACCATGTTGGAACTGGATTGCTCGGAAAAATGGGAAACAAGGG
AGGTGTTGGGATCCGTATCATGCTCCACAACTCCTCTTTATGCTTCATCAACTCCCATCT
TGCTGCTCATCTGGAGGAGATTCAGCGAAGGAACCAAGATTACGAGGATATTTGCTCCAG
GATGAAATTCCCAGATCCTGAAGGACAATCTATATCTGTGTTTAGTAACGATGTCTTGAT
ATGGCTCGGTGACTTGAATTATCGAATTGATAAACTTCCTCTTGAAACGGTAAAAGAGAG
AATAGAGAAAGGACAATATGAAAAACTAAAAGAACACGATCAGCTAACAAACCAGCGGCG
AGAGGGTAACGTCTATCCCGATTTCGAGGAGGGTGACCTGACGTTCCGACCCACTTATAA
ATATAACCCCGGCACTGATGAATGGGACACCAGCGAGAAATGTCGATGTCCTGCGTGGTG
TGATCGTATATTGTGGAAAGAATCGGCCAAAGCTAAACCAAGAAAAACAAAAAGAAAAGA
CTTAGTTCAACTGCTGAAGTACCAAGCTCACTTATCATTAAAAATAAGTGACCACAAGCC
TGTTAGTGCTGTATTTAAAATCAATGTAAAAGTAATAAACCGTGAATTGTATCGGAAAGT
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GCTAAACCAACACTCACTCGAATTTGGGACAGTAAAGTTTCAGCAAGCAGTCCAGAGGAC
AGTAGAAATACTTAACACTGGACAAACACCTTGTCATTTTGAGTTTATCGGCAAACTTGG
AGAAAAAGCGTTTTGTAAACCTTGGTTGACAGTTGGTAAACCTAAAGGATATGTTTTGCC
AGGTGATAAACTGGTTATTGAGTTTGAGGTGTACGTGAATAAGAACACAGCCCCTTCACT
AAACAAAGAGGAAGACAAGATAGAAGATATTTTAATTCTACATCTTGTTGGGGGCAAGGA
TTTTTTCATCACTGTAAACGGCAAATACTCCCCCAGTTGTTTTGGTACTTCCATTGAAGC
TTTATGCTGGATGAAAAAACCTATTGAACAAATGGATAGAAAAGAACTAACTAGACTGAG
CTGTACAGAGTCGAGAGATTGGCAAGTCAACAATGAGAAGCATCATTCATCGCAAATGCT
AAATGTACCCAAAGAATTATGGAGGCTACTTGATCATTTATACCAATATGCAAGACACCA
GCCAGATCTGTTCCAACAACCTGGTTTACACGAAGAATTAAAAATGATCCAGGAAAACTT
GGATTCCCAGCTCCCCACTGTTGGTACTCCACTGCCAGGATCCAACCACTCGGTGGCAGA
AGCGCTCCTTATATTTCTTGAAGCGTTACCCGAACCAGTTATCCCGTTTGAATATTACAA
CATGTGTTTACAACTTTATAATAACTATGATCAGGGCCAAGAGTTAATACACAAGATGCC
TCCCCACCATGTTAATGTGTTCAACTACATTATCTCATTCCTACAAGAACTACCAAAGTA
TGAAGAAAATGGGTTGAATCTTCATTTACTTGCTACCATCTTCAGTGGTTTATTATTACG
GCCATCATCTGTACAAAGGAAACAAAACACCGAGGGTAGAATGGATAGGATGAAAGCCAC
AAGCTTTATTGAGATGTTTTTGAAAAAGAAACTTATAGAATAAAAAATGTACGAAAATGT
TCAATTTTTGTTCTGAGAACAAAATGAAAAAAGGGATTTTTTAGTCTGTTTTTAGTTTAG
TGTGTGTTTATTTTTTAATGGGGTAATTTTTACTTGACGGCAAATTTTTGGCAAGTTGCA
GTTGTTCTGGCCAGTTTTAATCTAAGGTGCTTTATGGCCAATATGTATGGGCCATATATA
TATATATATATATATATATATATCAATACAAATATACAATGCTGCGGAATCCCAGATTCT
GTCATGCGTAACTATTAAAAATTTATCACTTTTTTTGTGAAAACTTGTCTTAAAAAATTG
TCCACAGTTTTATTTAAGTTATAAATGCCACATAAATTAATATAGAATTACTACGCCCTT
TAACTCAGTGGTAAACCTTGCCAATTATGTCGTGTTAGCAATATATTTGTGTCCATTTAT
CTGGCTTTGCTTATTTAAAGCCTACTTACTTCAAAGTACAATATAGTGTTAACCCAGTAT
GTATGTAACCAGTGGCGCAGCCAGGGGGGTTTTCAGTGGGTCGTGACCCCCCCCTTTTAA
ACCCCAAAAAATATTAAAAAAAAATATTTTTTTTTAATCAAATTTTTTTTGATTGAAACT
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GCATTGTGTTTGTGTTTTCAAATAAATTTAAATACCTAATGTGCAACACTATTCATAAGT
TCCTATTTGATAAGTGGCCAAAAACATGGGAATTTTGCCTTGATAGTAATTTCCCACAAA
ATTTGGCCTACATTTATATAAGCTGTGTTGGAAGACAAGCTATAAAATCTTATACAGGTT
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CATATCATATTGTGTTTATAATATTTTCCATTTCTAG

InterProScan

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Gene3D	Rho_GTPase_activation_prot (IPR008936) - T[699-868] 6.7E-45
Pfam	RhoGAP_dom (IPR000198) - T[700-840] 4.1E-21