Aniseed - Transcript Card

Sequences

Amino acid sequence

Length: 870

>KH.C6.43.v2.A.SL1-1
YIMDNHAYNDSSTPNNLIDLQPNTTEHLSEFDPFAPTVQKVTRKPSRPPPPPPNVPPRRT
NTVSEPLSQSALTTDLVNLDLDPKTEPKLVNVSKDDPPASIMHLDNSGQKYPDLPRPKSS
SFVSYISPTAPKPMEIVTNQNNINSSDSSRAGMHDVGRSAFSNFEGSTGKNELTSHLLER
DKLMPLYMAKRQDDYTSTAPFNVFVGTWNVNGQLPTEPLDAWVSSEATPPDVYAIGFQEL
DLSKEAFVFTESSREEEWMRAVKQALHPGASYKLVKHIRLVGMMLLVFAQDRHLQDITAV
ASHHVGTGLLGKMGNKGGVGIRIMLHNSSLCFINSHLAAHLEEIQRRNQDYEDICSRMKF
PDPEGQSISVFSNDVLIWLGDLNYRIDKLPLETVKERIEKGQYEKLKEHDQLTNQRREGN
VYPDFEEGDLTFRPTYKYNPGTDEWDTSEKCRCPAWCDRILWKESAKAKPRKTKRKDLVQ
LLKYQAHLSLKISDHKPVSAVFKINVKVINRELYRKVYEEEIRRLDRMENEWLPTMVLNQ
HSLEFGTVKFQQAVQRTVEILNTGQTPCHFEFIGKLGEKAFCKPWLTVGKPKGYVLPGDK
LVIEFEVYVNKNTAPSLNKEEDKIEDILILHLVGGKDFFITVNGKYSPSCFGTSIEALCW
MKKPIEQMDRKELTRLSCTESRDWQVNNEKHHSSQMLNVPKELWRLLDHLYQYARHQPDL
FQQPGLHEELKMIQENLDSQLPTVGTPLPGSNHSVAEALLIFLEALPEPVIPFEYYNMCL
QLYNNYDQGQELIHKMPPHHVNVFNYIISFLQELPKYEENGLNLHLLATIFSGLLLRPSS
VQRKQNTEGRMDRMKATSFIEMFLKKKLIE

Nucleotide sequence

Length: 4,073

>KH2012:KH.C6.43.v2.A.SL1-1
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GCGGAGCTCTTTCAAGGCGTTTAAATGTTATTTTGAGGATATGGTTTAAGTATATGTGAT
ACATCAAAGTTTCAAAAGAGGTATAATACATCATGGATAACCATGCATACAACGATTCTT
CTACCCCAAATAACTTAATTGACTTACAACCAAATACTACAGAACATTTGTCAGAATTTG
ACCCGTTTGCACCAACTGTGCAAAAAGTGACACGAAAACCGAGCAGGCCACCACCCCCAC
CCCCAAATGTGCCTCCGAGAAGAACAAATACAGTTTCCGAGCCTCTGAGCCAGTCTGCTT
TAACCACGGACCTTGTAAACTTGGATTTGGACCCAAAAACTGAGCCGAAATTGGTCAATG
TCAGTAAAGATGACCCCCCAGCGAGCATTATGCATTTGGACAATTCGGGTCAAAAATATC
CAGATCTACCGAGACCAAAGTCATCTTCTTTTGTGAGCTATATTAGCCCGACAGCCCCAA
AACCTATGGAAATCGTGACAAATCAAAACAATATAAATTCAAGCGATAGCAGTCGTGCAG
GCATGCACGATGTGGGGAGATCGGCGTTTTCGAACTTTGAAGGATCAACTGGTAAAAATG
AGTTGACGTCTCATTTGCTTGAAAGGGATAAGTTGATGCCGCTCTATATGGCCAAGCGAC
AAGATGACTATACCTCAACTGCACCTTTCAATGTATTTGTTGGGACTTGGAACGTGAATG
GTCAGTTACCAACTGAACCATTAGATGCTTGGGTTAGTAGTGAAGCTACCCCACCGGATG
TATATGCAATTGGGTTCCAAGAGCTTGATTTGAGCAAAGAAGCTTTTGTATTCACTGAGT
CATCACGAGAAGAAGAATGGATGAGAGCTGTCAAGCAGGCCCTGCATCCTGGTGCTTCAT
ATAAACTGGTAAAACACATACGTTTGGTCGGTATGATGTTATTGGTGTTTGCTCAGGATC
GCCACCTTCAGGATATAACAGCAGTGGCTTCGCACCATGTTGGAACTGGATTGCTCGGAA
AAATGGGAAACAAGGGAGGTGTTGGGATCCGTATCATGCTCCACAACTCCTCTTTATGCT
TCATCAACTCCCATCTTGCTGCTCATCTGGAGGAGATTCAGCGAAGGAACCAAGATTACG
AGGATATTTGCTCCAGGATGAAATTCCCAGATCCTGAAGGACAATCTATATCTGTGTTTA
GTAACGATGTCTTGATATGGCTCGGTGACTTGAATTATCGAATTGATAAACTTCCTCTTG
AAACGGTAAAAGAGAGAATAGAGAAAGGACAATATGAAAAACTAAAAGAACACGATCAGC
TAACAAACCAGCGGCGAGAGGGTAACGTCTATCCCGATTTCGAGGAGGGTGACCTGACGT
TCCGACCCACTTATAAATATAACCCCGGCACTGATGAATGGGACACCAGCGAGAAATGTC
GATGTCCTGCGTGGTGTGATCGTATATTGTGGAAAGAATCGGCCAAAGCTAAACCAAGAA
AAACAAAAAGAAAAGACTTAGTTCAACTGCTGAAGTACCAAGCTCACTTATCATTAAAAA
TAAGTGACCACAAGCCTGTTAGTGCTGTATTTAAAATCAATGTAAAAGTAATAAACCGTG
AATTGTATCGGAAAGTTTACGAAGAAGAAATTCGAAGACTGGACAGAATGGAGAACGAAT
GGCTGCCTACTATGGTGCTAAACCAACACTCACTCGAATTTGGGACAGTAAAGTTTCAGC
AAGCAGTCCAGAGGACAGTAGAAATACTTAACACTGGACAAACACCTTGTCATTTTGAGT
TTATCGGCAAACTTGGAGAAAAAGCGTTTTGTAAACCTTGGTTGACAGTTGGTAAACCTA
AAGGATATGTTTTGCCAGGTGATAAACTGGTTATTGAGTTTGAGGTGTACGTGAATAAGA
ACACAGCCCCTTCACTAAACAAAGAGGAAGACAAGATAGAAGATATTTTAATTCTACATC
TTGTTGGGGGCAAGGATTTTTTCATCACTGTAAACGGCAAATACTCCCCCAGTTGTTTTG
GTACTTCCATTGAAGCTTTATGCTGGATGAAAAAACCTATTGAACAAATGGATAGAAAAG
AACTAACTAGACTGAGCTGTACAGAGTCGAGAGATTGGCAAGTCAACAATGAGAAGCATC
ATTCATCGCAAATGCTAAATGTACCCAAAGAATTATGGAGGCTACTTGATCATTTATACC
AATATGCAAGACACCAGCCAGATCTGTTCCAACAACCTGGTTTACACGAAGAATTAAAAA
TGATCCAGGAAAACTTGGATTCCCAGCTCCCCACTGTTGGTACTCCACTGCCAGGATCCA
ACCACTCGGTGGCAGAAGCGCTCCTTATATTTCTTGAAGCGTTACCCGAACCAGTTATCC
CGTTTGAATATTACAACATGTGTTTACAACTTTATAATAACTATGATCAGGGCCAAGAGT
TAATACACAAGATGCCTCCCCACCATGTTAATGTGTTCAACTACATTATCTCATTCCTAC
AAGAACTACCAAAGTATGAAGAAAATGGGTTGAATCTTCATTTACTTGCTACCATCTTCA
GTGGTTTATTATTACGGCCATCATCTGTACAAAGGAAACAAAACACCGAGGGTAGAATGG
ATAGGATGAAAGCCACAAGCTTTATTGAGATGTTTTTGAAAAAGAAACTTATAGAATAAA
AAATGTACGAAAATGTTCAATTTTTGTTCTGAGAACAAAATGAAAAAAGGGATTTTTTAG
TCTGTTTTTAGTTTAGTGTGTGTTTATTTTTTAATGGGGTAATTTTTACTTGACGGCAAA
TTTTTGGCAAGTTGCAGTTGTTCTGGCCAGTTTTAATCTAAGGTGCTTTATGGCCAATAT
GTATGGGCCATATATATATATATATATATATATATATATCAATACAAATATACAATGCTG
CGGAATCCCAGATTCTGTCATGCGTAACTATTAAAAATTTATCACTTTTTTTGTGAAAAC
TTGTCTTAAAAAATTGTCCACAGTTTTATTTAAGTTATAAATGCCACATAAATTAATATA
GAATTACTACGCCCTTTAACTCAGTGGTAAACCTTGCCAATTATGTCGTGTTAGCAATAT
ATTTGTGTCCATTTATCTGGCTTTGCTTATTTAAAGCCTACTTACTTCAAAGTACAATAT
AGTGTTAACCCAGTATGTATGTAACCAGTGGCGCAGCCAGGGGGGTTTTCAGTGGGTCGT
GACCCCCCCCTTTTAAACCCCAAAAAATATTAAAAAAAAATATTTTTTTTTAATCAAATT
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TTTAATCTCATAGTATTTATGTCTTTCAGTAACCCTTGATACACAGTTTAATTGAAAATC
CCAAATAACCTTGTCGATATTAGTTCATTTTTAAATTAAAACCTCGTTTTTTTTTCTGAA
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AACACTATTCATAAGTTCCTATTTGATAAGTGGCCAAAAACATGGGAATTTTGCCTTGAT
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TGTATGATTTACATTACATATCATATTGTGTTTATAATATTTTCCATTTCTAG

InterProScan

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Gene3D	Rho_GTPase_activation_prot (IPR008936) - T[699-868] 6.7E-45
Pfam	RhoGAP_dom (IPR000198) - T[700-840] 4.1E-21