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  1. Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R31....'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C5.486.v1....'
  3. Transcript 'Haaura.CG.MTP2014.S8...'
  4. Transcript 'KH2012:KH.C8.404.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C8.404.v1.A.nonSL3-1

Possible name(s)

TRMT1; TRMT1L

Location

KhC8 [4,628,565 / 4,631,297]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 461

>KH.C8.404.v1.A.nonSL3-1
TIKMNLLNGKLVENNAEIPLVKSYEDVMSFKRVSKVCELGLSRAIALACLEIVKLETDGV
TSALDAVNSFGAAGMQWAKHFLSENISITVNTALGLDDVCKKWLNENNCPTDSVKVVSMD
PQVLMHSSKHKFVYLEVTGTVVPYLDAAVRSVNHNGLLCVTCTDTSTLYNKCPTTAQRLY
GANLLKNEYCKEVAIRVIISNIAQSAARWNKGIKVELCASVEPGFTVVCRVLRGPKHGDI
STSSIQLLEHCQLCQARRFKPRTKYITYGNGKTLCKCSTEEAAAPLLLLGPMWSGSIFQP
EFVLKTCLTAKQMNLSLEHRKILELILLESVCCKTNEEEENLLKHTTQFNGKNQLNEKSE
PKHKKIKLDSEVSSENGPSLTKEMRSYKHIPFYCDFQHHSVKGGNPPRLLTVLNELRSRG
YNASKTHFGPRCIRTSASVEQFDEILKHLWEVTTKHNGIKV

Nucleotide sequence

Length: 2,732

>KH2012:KH.C8.404.v1.A.nonSL3-1
GCAATTAAAAACTGTTTTACAAAATTTCTAGAGTATTAGCAGAAGAAAAAATGGCGTTAA
CTGCCGAGACATTAAAAGATAAACTGACAAAGGAGCTGAGTGCAGAATACGTGGATGTAA
AGGACATTTCTCCCGACATGTGTGGAACCAGTTTCCATGCTGTTGTTGTTTCGCCCCAGT
TTGTGGGTAAAGCTCGCTTGCAACAGCAGCGAATGGTTAACAATGCACTTGCTGAGGAGA
TGCCATCAATCCACGCTTTTACACAAAAGACATACACACCAGAAGCATGGAAAAAGGCAA
ACTCTACGGACTGATTATATTTCTGAGTTAATTTAAACAATATTTGTTTGACCATTATAA
ACGTTCAGATTTCCTATAATTTTTTTTGCGTTATAAGGCCCATTATTGTGCAATGCATAA
GGCCTGCTTTCTGCACAGTTTTTACCAGACTGATTAGTTGTCAGTCTTGTCACTTTTAGA
ATATGAATAAAGTCTGCATGGTTGGAAGTGGAATAATTCTCTTCAGATTAGTAACTCCAT
GTTTTTATAATCACAAAAAGCTATTGAGTTAGTACATGTACATGATAACATTTTATAAAG
AAATTTAACCTAAAACGTTGGAATTGAAGGCATATTATTCAAACTATTTATATCTATTTA
TGACAAATTTAATTTCTGAATTCTGATTATAAGGTTTTGTTTGATTATGATATGCTTGTG
GAGTAAACAATATTGTTTTGTTACTTTAGAAAAAAAATACATGTATATATGATTTTTTAT
ATAATCAGCTCTATTGAGACTATTGCTATTTATCAATTTTTTAAACAATTAAAATGAATC
TTCTAAATGGAAAATTAGTTGAAAACAACGCTGAGATTCCTCTGGTCAAATCATATGAAG
ATGTTATGAGTTTTAAACGTGTTTCAAAAGTCTGTGAGCTTGGACTCAGTCGTGCCATTG
CTTTGGCTTGCTTAGAAATCGTAAAACTTGAAACTGATGGAGTTACATCAGCTCTTGATG
CTGTTAACTCTTTTGGTGCTGCTGGCATGCAATGGGCAAAGCATTTTCTCTCAGAAAACA
TTTCCATCACTGTAAACACAGCACTTGGACTGGATGATGTCTGTAAGAAATGGCTGAATG
AGAATAACTGCCCAACTGATTCTGTTAAGGTTGTGTCTATGGATCCCCAGGTTCTTATGC
ACAGCTCCAAACACAAGTTTGTGTATTTAGAAGTGACTGGAACAGTTGTGCCTTACCTTG
ATGCTGCTGTTCGTAGTGTAAACCACAATGGTTTGTTGTGTGTGACTTGTACAGATACTT
CAACTTTATACAACAAGTGCCCAACTACAGCCCAACGTCTCTACGGAGCCAATCTGTTAA
AAAATGAATATTGCAAAGAAGTTGCCATTCGTGTAATTATTTCTAACATTGCACAATCTG
CTGCGAGATGGAACAAAGGTATTAAAGTTGAACTTTGTGCATCTGTAGAGCCAGGGTTTA
CTGTTGTATGTAGAGTGCTACGTGGACCAAAACATGGCGATATTTCAACCTCATCTATTC
AGTTGTTAGAGCACTGTCAATTATGTCAAGCCAGAAGGTTTAAACCAAGAACAAAATATA
TTACTTATGGAAATGGTAAGACACTATGTAAGTGCAGCACTGAAGAAGCAGCAGCCCCAT
TATTATTACTGGGCCCCATGTGGTCAGGCAGCATTTTTCAACCAGAATTTGTTTTGAAAA
CCTGTTTAACTGCCAAGCAGATGAATTTGTCTCTTGAACATCGGAAAATTTTAGAACTGA
TTTTGTTGGAAAGTGTGTGTTGCAAAACTAATGAAGAAGAAGAGAACTTACTGAAACACA
CAACTCAATTTAATGGTAAAAATCAACTTAACGAAAAAAGTGAACCAAAGCACAAAAAAA
TAAAATTAGACTCCGAAGTAAGTTCAGAGAATGGCCCTTCTTTAACCAAAGAGATGAGAT
CCTACAAACATATTCCATTTTATTGTGATTTCCAACATCACAGTGTAAAAGGAGGTAATC
CTCCAAGATTATTGACCGTGCTGAATGAACTACGCAGTCGAGGTTACAACGCAAGCAAAA
CTCATTTCGGCCCAAGATGCATAAGAACATCAGCCAGTGTGGAACAGTTTGATGAAATTT
TAAAGCATTTGTGGGAAGTAACGACAAAACATAATGGAATCAAAGTCTAAGAATTTCTAG
TGTGTTCTTAAATTGATAAAAAAAGTTGAAAATTTTCAGTATAAACGTAGTAGCCAATAT
ATGTGAGACGATTGCCAGATATTTCATGTTTTTTTTGCACCCAGGATGGAATGTAAAAAC
TGTTTTCTGTTTCTGTTGAAAAGAACTATAAAACTTGTTTTGACAGTGACACTTTACTAT
ACAAACGCAAATTAAATAGCTGGGTGGGGATAACTGATACCTACATTAGTTAAGCACTAG
CTTTGTTGGAACTAATGAATTTTTTTGTTGTTTATTACTGGTATTTAAATAATGTTTTTA
TTGTTTTAGAACATGATATATTCAATATAGGCGCCAAACCATTTAAAATGCAGGGAGGGT
AGAAATAGTTAGATTTCTAAACTTGTTGAGAAAAAATCCAACATGGCTTTAATTTACTAA
TTAGTGCAAATTACAAAGTAGGCCTGCCACCAGTGCCACCCCAGAATTGGCGCTTATGGT
GTTTTATTATATATTTGAACCAAATGAACAAG

InterProScan

ProSiteProfiles
Trm1 (IPR002905) - T[1-446] 51.845
Pfam
Trm1 (IPR002905) - T[45-330] 1.7E-39 - T[397-446] 1.2E-5
PANTHER
Trm1 (IPR002905) - T[62-92] 3.7E-87 - T[111-451] 3.7E-87
SUPERFAMILY
SAM-dependent_MTases (IPR029063) - T[93-329] 5.98E-52 - T[387-447] 5.98E-52

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TRM1L_HUMAN 31.742 % 171 2.06E-46