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  5. Transcript 'KH2012:KH.C8.418.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C8.418.v1.A.SL2-1

Possible name(s)

MFSD3; SLC33A1

Gene model

KH2012:KH.C8.418

Location

KhC8 [4,327,623 / 4,335,291]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 517

>KH.C8.418.v1.A.SL2-1
ENNLESQNSNSLDMPFNSERDINSTRTPTSKMHWWYEDRSSVLLLLFLYVLQGIPLGLAG
SIPMLLASKSVDYKQQALFSFVFWPFSIKLLWAPIVDGAYIQSIGRRKTWLVPTQYVIGT
IMFILSYKLDAIMGGPEPDVWNLTVCFFILNFCAATQDIAVDGWALTMLSKKNVGLASTC
NSVGQTAGYFLGYVVFLALESADFCNKYFRSADSHKEEGLVNLSGFMYFWAIVFIITTTL
VMIFKKEDAQNTSEINDTASKGVVSTYKLLFKIICLPNVLQYVVILLTAKIGFASESIVA
LKLIECGIHKETLALLAIPLTPLQIALPVIIAKYTSGPRPLDIFLKAIRYRLIFTLLFAA
FVHYTPSFKLEDGTFPYYYFAAVLIMYCFHQVTLYSMFVAVMAFNAKISDPHIGGTYMTL
LNTVANLGGNWPSTLALWYVDALTTTNCVGGTSNLVYCSKEDKAVCETAGGLCVTTVDGY
YVEAVLCLILGILWLIWKSDSTRKLQNVDPERWRCPR

Nucleotide sequence

Length: 2,089

>KH2012:KH.C8.418.v1.A.SL2-1
AGAAAATAATTTAGAATCCCAAAACTCAAATTCACTGGACATGCCTTTTAATTCTGAACG
AGATATAAACAGTACCAGGACACCAACTTCGAAAATGCACTGGTGGTATGAAGACAGGTC
CAGTGTCCTACTTTTGCTGTTCCTGTATGTTCTGCAGGGAATTCCTCTTGGACTAGCTGG
CAGTATTCCAATGCTATTAGCGTCGAAAAGTGTAGACTACAAGCAGCAAGCTCTCTTCAG
TTTTGTGTTTTGGCCATTTAGTATAAAGCTGTTGTGGGCACCTATAGTAGATGGAGCTTA
TATACAAAGTATTGGAAGACGAAAAACATGGCTAGTTCCAACTCAATACGTGATTGGTAC
AATCATGTTCATTCTCTCATACAAATTAGACGCCATAATGGGAGGTCCTGAACCTGATGT
ATGGAATCTTACAGTTTGCTTTTTTATTTTAAACTTTTGCGCCGCCACACAAGATATTGC
AGTCGATGGATGGGCACTTACAATGTTGTCTAAGAAAAATGTTGGACTTGCTTCAACTTG
TAACTCAGTGGGACAGACTGCAGGTTATTTCCTTGGTTATGTTGTTTTCCTTGCATTGGA
ATCTGCAGACTTTTGTAACAAGTATTTTAGATCGGCAGATTCTCATAAAGAGGAAGGTCT
TGTTAATTTATCTGGGTTTATGTACTTCTGGGCAATTGTGTTTATTATAACCACCACGCT
AGTAATGATATTTAAGAAAGAAGATGCTCAAAATACATCAGAAATAAACGATACTGCTTC
AAAAGGTGTTGTGTCTACTTACAAGTTGCTTTTTAAGATCATTTGTTTGCCAAACGTGCT
TCAATATGTTGTTATCTTATTAACAGCAAAGATTGGTTTTGCATCTGAATCAATAGTTGC
ATTGAAGCTAATAGAATGTGGAATACACAAAGAAACTTTAGCTTTGCTTGCAATACCCCT
TACACCATTACAAATTGCCCTACCTGTTATCATTGCAAAATATACCTCAGGCCCACGACC
ATTGGACATTTTTCTGAAAGCAATTCGTTATAGGCTCATTTTTACCTTGTTGTTTGCTGC
ATTTGTTCATTACACTCCTTCATTTAAGCTGGAAGATGGTACATTCCCATATTATTATTT
TGCTGCAGTGCTAATTATGTATTGTTTCCACCAGGTTACATTGTACAGTATGTTTGTAGC
AGTAATGGCATTCAATGCTAAAATTAGTGACCCTCATATTGGTGGAACATATATGACTTT
ACTCAACACAGTTGCAAATCTAGGAGGTAACTGGCCAAGTACATTAGCACTCTGGTATGT
TGATGCTTTAACAACAACTAACTGTGTTGGAGGAACTTCAAATCTTGTTTATTGTAGCAA
GGAGGATAAAGCAGTTTGTGAAACAGCTGGTGGTTTGTGTGTTACCACGGTTGATGGTTA
TTATGTGGAAGCGGTTCTATGTCTTATACTTGGCATTCTATGGTTGATATGGAAGTCAGA
TTCAACTCGTAAATTACAAAATGTTGATCCAGAAAGATGGCGTTGTCCAAGATGATGAAT
TGTATTTTAACTGAAACTGTTTACACTTCAGTGTAGATTTTATAGAAAGCAAAATAGTAA
ACAAGTAAATAGCAAAATGTGGAATATTTGTTTAATATTTTACGTTTCAACATTTAACCT
GCATTGCAGTGTATAATGTTCACTGCAAAATATTTTTTGTGCTGCAAATGTTTCAGCTAA
CATTTTTATTTAAATTTTTGGTGAGCCTATTGCAATAAAAGGTAAATGCAGCATCAGTGT
ATGTTGTACAAATCCCCTGCCTTTGATGTATGGTGTGACTTCCATGACAATTTAATACCA
AGTGATATTTTTTACTATGCACTGCCCATGTGTATGAAGTTAAGATTTGTTGTGTTTGAG
CTGCTAGAATACCTGTTTTCATGTCCTTAACGTTTAGTGCAATGTTTTTAAAGCTTTGGC
ACTGTTTCAACAAAAGAAGAATTTAAGTTTTTGTTCTTATTAGTGATAAAGTTGTTACAT
AGTATTGTTCCAATTTTATATTTGCATAATAAAAGGGTGTGGGAATATA

InterProScan

SUPERFAMILY
MFS_trans_sf (IPR036259) - T[39-447] 9.94E-20 - T[479-499] 9.94E-20
Pfam
Acetyl-CoA_trnpstr_1 (IPR024371) - T[43-252] 7.5E-70 - T[363-515] 4.7E-31

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
ACATN_HUMAN 57.537 % 538 0