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  1. Region 'REG00001285' > 
  2. Transcript 'KH2012:KH.C8.512.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C8.512.v1.A.SL2-2

Possible name(s)

SMYD1; SMYD3; SMYD5

Gene model

KH2012:KH.C8.512

Location

KhC8 [1,944,318 / 1,948,071]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 263

>KH.C8.512.v1.A.SL2-2
IKILCPSSDLIDRNALEILDETWRGCHYPPETASIQMIIRILARIKQEEKKEEFISDIEK
FCHASTNDVEQIAHKLLGEQFLVQLTTLREQLASVFFDESVQHWFTDDGFKNLFALLGTN
QQGVGTSALSVWVHNCDELDLNPQDKEELDNLIDGLYEELENVAGSFLNCEGAGLYRIQS
KCNHSCEPNAEVCFPNNNHRLAVKACRDIAAGEEITISYLSQCQIARGCRSRQQYLKENY
LFHCCCSKCSEQTDEESSSDMED

Nucleotide sequence

Length: 1,741

>KH2012:KH.C8.512.v1.A.SL2-2
TTCAATTGTAGTTTTTCAAATTAAACTGCTGCTCTAAATTTGGTCATGACTTGGTGCATC
AGACACATAGATAACGTGAAGGGCTTTGGTTTGTTTTCCACTGAAGATATCAGTAGTGAT
TCTGTAATACTGGAAGAAGATCCAATTATTAGTTGTCAATTTTCATGGAATAAGCTATAC
AAGTACAGGGCATGCGATTATTGCATGAAGTCACTGGAGACCACAGAGGAAATGTGCAAA
CGTTTAGCTCAAAATCCTGGGTTAAAACTTCCATATCATGAATGCTGTGAATCAAATCCT
GTTACATATGTACACTGCCAAAATGAAATTTACTGTTCGATGGAATGTAGAGAGAAAGCT
TACAACGAGTTCCATAAAGTAAAATTATTTTCCAAATTTCTAATATTCACCTATGAAGTA
TTTTTGTTTAACTGCGCTTTATTATAAATTTAGGCTTGTGCAATATATTTAACTTTAAAA
TTACAGTCTTTTTCTGACCTTTCTTCTTTCTTTCTTGTTGTAACTTTAGGTAATTTATTC
TTCACTATTGTAATAAAAGAAATATAAAATAAATTTAATAAAATTCAAGTTGTGTAAACT
GTTTTTTGAACCTGCATTGATTTTCTAAATCATCAAACTTTCCTGTTTATGAATAAAGAT
ATTGTGTCCATCATCTGACCTAATTGATCGAAATGCTCTTGAAATTCTTGATGAAACTTG
GAGAGGATGTCATTATCCTCCAGAGACAGCTTCAATACAAATGATCATACGTATTCTTGC
AAGAATTAAGCAGGAAGAAAAAAAAGAAGAGTTTATTTCTGATATTGAAAAATTCTGTCA
TGCCAGCACTAATGATGTGGAACAAATTGCTCATAAATTGCTTGGAGAGCAGTTCTTAGT
TCAGTTAACAACTTTGCGGGAACAACTAGCATCTGTGTTTTTTGATGAGTCTGTCCAACA
TTGGTTCACCGATGATGGTTTCAAAAATCTATTTGCTCTGCTTGGTACCAACCAGCAAGG
TGTTGGTACAAGTGCTCTCAGTGTATGGGTGCACAATTGTGATGAGTTAGATTTAAATCC
ACAGGACAAGGAAGAATTAGACAACTTGATTGATGGTTTGTATGAGGAATTAGAAAATGT
TGCTGGGTCATTTTTGAACTGTGAAGGTGCTGGTTTATATAGAATACAAAGCAAATGCAA
TCATAGCTGTGAGCCAAATGCTGAAGTCTGTTTTCCAAACAATAACCACAGGCTTGCAGT
GAAAGCTTGTAGAGACATAGCAGCAGGTGAAGAAATAACGATTTCATATTTAAGCCAGTG
TCAAATTGCTCGAGGTTGTCGCTCAAGACAACAATATCTGAAAGAAAACTATTTATTCCA
CTGCTGCTGCTCTAAGTGTTCAGAACAAACAGATGAAGAATCAAGTTCTGATATGGAGGA
TTGACTGTGGTAGTTGGTCTTGAGTGCAGAAATAAAACAAATTCGAGAAATTGTCCTAAT
ACTTGGTTATGTAGGTTGCGTTACTTTGGTCAAAGTAAATCTACAGCTGGTTTTTAAGTT
CTTTGGCTTGGTTGGTGTTTTTTACACAAAACTATTTCTCCAATTTTGGATATACTGTTG
AAGTAATTGTATGTGTGAATACTGAACATAAGGGTTTTTCTGACAAAGACAAAACACAGT
TTGTTTTCTAACTTTATTTTACATGTTATAAAAGTCGTAAAAAAGGAGCAAAAAAAAGAA
A

InterProScan

ProSiteProfiles
SET_dom (IPR001214) - T[90-220] 13.901
Pfam
SET_dom (IPR001214) - T[157-219] 2.2E-12

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SMYD5_HUMAN 52.157 % 277 4.51E-92