Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C9.169.v1.R.ND2-1

Possible name(s)

ECHS1; ECI1; EHHADH

Gene model

KH2012:KH.C9.169

Location

KhC9 [306,364 / 307,730]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 302

>KH.C9.169.v1.R.ND2-1
LSPGQQVPVLKLSIFINLVSIFYCKMLSRACFRQFSASIRRMSSTNIVETNIDSGTGFAT
VTLSQPPVNSLDKNLLTAITDRFKKLSDDSSVTGAILTSKFDGKVFSAGLNIVDMFQKSD
DHLGEFWGMVQEWYLTIQGFPKPLVSAINGHAPTGGCAMALMSDYRVMVEGKTIGLNETL
LGIVAPFFFADLMIAAVGRRHAEFALNNGYLYTSDEALKIGLVDEVVNLDQVVPTALKIL
TKMTKTPQPAYQVCKNFLRKETMDTLRNDRAGDIAHFVGFVQQPNVQKAIGGYLQALKQR
KK

Nucleotide sequence

Length: 1,366

>KH2012:KH.C9.169.v1.R.ND2-1
TTGTCGCCAGGGCAGCAAGTTCCCGTTTTAAAACTTTCGATCTTTATAAATTTGGTGTCG
ATTTTTTATTGCAAAATGTTGTCAAGGGCATGTTTCAGGCAGTTTTCCGCTTCAATTCGA
CGAATGTCGAGTACAAATATCGTGGAAACCAACATTGATAGCGGAACTGGCTTCGCAACC
GTAACTTTATCGCAACCACCAGTAAACAGTTTGGATAAAAATTTACTTACTGCAATTACG
GACAGATTTAAAAAACTTAGCGATGATTCTTCGGTTACTGGGGCCATTTTAACTTCCAAA
TTCGATGGTAAAGTATTTTCTGCTGGCTTAAATATCGTTGATATGTTCCAAAAGTCGGAC
GACCATCTCGGCGAGTTTTGGGGTATGGTGCAGGAGTGGTATCTTACTATACAAGGGTTT
CCTAAACCCTTGGTATCCGCCATTAATGGGCACGCACCTACCGGCGGTTGTGCAATGGCT
TTAATGTCAGATTACCGTGTGATGGTTGAAGGGAAAACAATTGGATTAAATGAGACATTG
TTGGGGATTGTTGCCCCTTTTTTCTTCGCTGATTTAATGATTGCTGCTGTTGGTAGAAGA
CATGCTGAATTTGCACTAAATAATGGCTACCTGTACACCTCAGATGAGGCATTAAAGATT
GGCTTAGTTGATGAAGTTGTAAACCTTGACCAAGTTGTTCCAACTGCATTGAAAATTCTT
ACTAAGATGACCAAAACACCTCAACCCGCTTACCAAGTTTGTAAGAATTTCCTTCGTAAA
GAAACAATGGACACATTGCGCAATGATCGAGCTGGTGACATTGCTCATTTTGTTGGTTTT
GTTCAACAACCTAACGTTCAAAAAGCGATTGGAGGTTATTTGCAAGCTTTGAAACAAAGG
AAGAAATAATCCAAACACAAGCTACATTAAACAAAGTTCTTTAAATTGCAATTAATTTTG
TGTTCAATTGAAATGAACATGTTGGTATGGTTCGTTGTTACAATCATGTAGTCATGTTGT
GTGAGTGTGATGGCTTTAAATAAACAATTAAAGGGTCAATACAATACATGTTTAAAAGAA
ATAAATTTACATTGCATATTTAGAGTTTAGCTGATGTACAAATACATAAAATGAGCCTTT
GTGTAGGTGCTAGTGAAGAAACACATAAGCTGTAATGCTGTATACCTCTATCAAAACTTT
AGCATTATCGGAACTATATTCCAAACATGTTGCCTGTATCGTTACAGAAGGTTCTTTTCT
ATCACTTATGATCTACATATTTCATAATTGTTTAAAACCCATAATAATATTGAATGATTT
TATTTTGTTGATGTTTCTTTGATTCTAATTTTGTTTCCACATCCAG

InterProScan

SUPERFAMILY	ClpP/crotonase-like_dom_sf (IPR029045) - T[46-299] 4.02E-51
Pfam	Enoyl-CoA_hydra/iso (IPR001753) - T[56-298] 3.4E-53

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
ECI1_HUMAN	41.288 %	197	1.49E-61