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Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C9.709.v1.R.ND1-1
Possible name(s)
CLVS1; CLVS2; TTPAL
Gene model
Location
KhC9 [1,922,965 / 1,924,742]
Amino acid sequence
Length: 278
>KH.C9.709.v1.R.ND1-1
KMACERYQCNLRPDLLEKAVRELNEPRDNDERLKAIDQLRDSFNIEKYGPLIRSDDGFIL
RFLRARKFNQERALKVLQNYHTIRKDFRECFSRVEDPMSLKAVMDTGMMYAAEGKVKNGE
SVIIYRPGLLSQEVKIHEVIAYGVLCVEELLKDEEYQISGSITVDDLTQFNLRILAQFSL
HGAKRMNQVWQDCMPVRMKSIYIFNEGRVFDIIYTMMRPFMKEKTKKRIKVCGDNYKLMH
EEIPPSMLPPCLGGSGLPIEDACKVWVEKLCKQLKKKG
Nucleotide sequence
Length: 1,777
>KH2012:KH.C9.709.v1.R.ND1-1
ATAGCCGTTTGCAGCTTTGAAATTCGCTTTAGTTTGTTCTTGCTACAGGTTTGTTAATAG
AAGATGGCGTGTGAACGATATCAGTGCAATTTACGCCCAGATTTATTAGAAAAAGCTGTT
CGGGAACTAAACGAACCTCGGGATAATGATGAACGATTAAAAGCAATTGATCAGTTGCGG
GATAGCTTTAATATTGAAAAGTATGGGCCACTTATTCGTTCCGATGATGGATTTATTTTA
AGATTTCTCAGAGCTCGTAAATTTAATCAAGAACGGGCGTTAAAAGTTCTGCAAAATTAT
CACACAATACGGAAGGATTTTCGGGAATGTTTTTCGAGAGTAGAAGACCCCATGAGTTTG
AAAGCCGTGATGGATACGGGTATGATGTATGCTGCTGAGGGGAAAGTGAAGAATGGAGAG
TCTGTAATTATATACAGGCCTGGCTTGTTGAGTCAAGAGGTAAAAATACACGAAGTTATT
GCTTATGGAGTTTTGTGTGTGGAGGAGTTATTAAAAGATGAAGAATACCAAATATCAGGA
AGTATTACTGTTGATGATTTGACACAATTCAATCTTCGTATCTTGGCTCAGTTTTCCCTG
CATGGAGCTAAGCGTATGAATCAGGTTTGGCAAGACTGCATGCCGGTTCGAATGAAGTCC
ATTTATATTTTTAATGAAGGAAGAGTGTTTGACATTATCTATACAATGATGAGGCCTTTT
ATGAAGGAAAAAACGAAGAAGCGAATAAAAGTTTGCGGGGATAATTATAAGTTGATGCAT
GAAGAAATTCCCCCATCTATGTTGCCACCATGTTTGGGGGGAAGTGGATTGCCAATAGAG
GATGCTTGTAAAGTATGGGTGGAGAAACTGTGCAAACAATTGAAAAAAAAAGGATAAAAC
CATGCATACCTAAAGGGTTAAAGCCATATTATATATCAATTTTTCCTTCCAGAGTAAAAA
TGATATTGGAATGTTTAATTTCTTTATGTTTGGTAATAAGAAAATGGATTGAACCATATT
TAGATGTAATTTTCTTTACCCGTAAAAGTAATGATAATATGTATATGCTATAATGTTGAT
TTGTTTATGTTAATTAATGAAAAAAAGGATTAAAACCAATATCTATTTATATTATACAGT
TTCTTTACAGAGTAAAATTGATGATATAATCATATATTTAATGATCAGTTTCTTTATTTT
AAATAAAAAAAAAAGGGATTAAAAGTGAAACCATATATAGGCCTACCTAAATATAATTTC
CAATAAATAAAATAATGCTATAATGTTGAATTTATTATGTAAATTACTAAGTTATATGCT
CGTTTAATTATATTAGAATATTAAAACTGTAGCAAAATCTAATGAACAATTTAAGCAGCT
TCTTATACAAGGTTGTATATTTCACTGTTATGCGTTGAGAAATTAATAGCTATTTTGTTT
ATTATTATTATTATTTGTGTGTATTTATTTGTGGTTATAAACCATGTTTACCTTTTGTTA
AACAGTCTATGATTGCCATTATTCCAAATAGATTTTGTGTCCTTACATTTGGCTACAAGC
CTATAGTATACCTATAAAGTCCTTTTTCCAAATGCTTACATTATTTGTGCAAAAGTAATT
GCCTAAAATTGGGTTAATTACTTTATTAAAACGTTGATAGTTTCTGATTCTCTATGAGTT
ATAGCCCACTGTTGCAAGCAGCTTCTGATAAAATCATGCTGTACGTTTGAGCTATGATGC
ATATTCCATTATTTCACTAATTTCTTGTTGTTTGAGC
| SUPERFAMILY |
CRAL/TRIO_N_dom_sf (IPR036273) - T[5-88] 3.4E-16 |
| Pfam |
CRAL/TRIO_N_dom (IPR011074) - T[37-79] 1.4E-7 |
| SMART |
CRAL/TRIO_N_dom (IPR011074) - T[55-80] 5.1E-9 |
| Gene3D |
CRAL-TRIO_dom_sf (IPR036865) - T[87-263] 6.6E-48 |
| SMART |
CRAL-TRIO_dom (IPR001251) - T[96-257] 3.1E-21 |
| ProSiteProfiles |
CRAL-TRIO_dom (IPR001251) - T[97-260] 14.156 |
| SUPERFAMILY |
CRAL-TRIO_dom_sf (IPR036865) - T[100-273] 1.16E-37 |
| Pfam |
CRAL-TRIO_dom (IPR001251) - T[106-255] 3.2E-24 |
| CDD |
CRAL-TRIO_dom (IPR001251) - T[117-254] 3.59848E-29 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| TTPAL_HUMAN | 33.852 % | 148 | 1.43E-42 |
| CLVS1_HUMAN | 31.461 % | 126 | 4.94E-34 |
| CLVS2_HUMAN | 29.74 % | 120 | 4.07E-32 |