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  1. Transcript 'KH2012:KH.L153.50.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L153.50.v1.A.nonSL3-1

Possible name(s)

ECD

Location

KhL153 [684,758 / 687,301]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 629

>KH.L153.50.v1.A.nonSL3-1
LYSVIRKCCEMDEIPTNFVDNVTHYTLYANKLSDCNKLEEILLKCQAIVAKETHGHIWQN
EPFQLSICKTTTPFSLKGNTNYGDSVDDEWFIVYLLHKITISLTQLVATINDSDGEFLLI
EAAEYLPKWLTPTTCNNRVFISKGLVHIVLKPASPSEIDILPIGDPTLQQALDAVSNYPW
LTQASSSIISCIQKRISGFPCQDNVFHANVYLCESIVHLLDKNPSLISPAVQAFYLRNPV
DLRACRNFTYFKPENRVWSQIPMTRCHYAQLMQQQFIADKRSGYLPSSALPPKQNKGVDL
GMKISHGLEILCSKVKPTKSAENSAETALFDEDKFNSFVSYLKETGYFRNELEGSKLYNQ
LKIEAQKFFTENCVSDRNVPTEQDVLVNMVKMLKIWGKSGFPKLETLVIKDILEELPNES
SDKWMYLDENAVEELTKEMNLGFKNLHIGKKKKKTADLSQETIKETVEKMKTFVGEVSGL
EGVETTNDISPVVFDVENFMLNVENMLGHAENMSDESSSEFLTSDEETDTDLEEEKNEIQ
EYMEKMDSELSATAVGKSFVKLKSENAGVSENISTEEQKLNEDNAPVNIDLNLVENFLQG
CHSQAGLAGPVTNVLGSLGINIPSGVDLN

Nucleotide sequence

Length: 2,543

>KH2012:KH.L153.50.v1.A.nonSL3-1
AATTAGAGATACGGAAAGTAACTTTATTCTAATTTATTCCAGAGTTTGTTGCACTTTTTC
GTTCATACCATGTATGTAGTATTTAGTATTGATTGTATTCGGTAATTCGTAAGTGTTGCG
AAATGGACGAAATACCGACGAATTTCGTTGACAATGTTACGCATTACACTTTATATGCAA
ACAAGTTATCAGACTGCAACAAGCTGGAAGAAATTCTCTTAAAATGTCAAGCAATAGTTG
CAAAAGAAACGCATGGACACATCTGGCAAAACGAGCCATTCCAATTAAGCATATGCAAAA
CAACAACACCATTTTCGCTAAAAGGTAATACTAACTATGGCGATTCCGTTGACGACGAAT
GGTTTATTGTGTATTTGCTGCACAAGATAACTATAAGCCTAACTCAATTGGTTGCTACTA
TAAATGACAGTGATGGCGAGTTCTTATTAATAGAGGCTGCTGAATATCTACCAAAATGGC
TTACACCTACAACATGTAATAACAGAGTATTTATTAGTAAAGGGTTGGTACATATTGTGC
TTAAACCAGCTTCTCCGTCCGAAATTGACATACTGCCTATTGGGGACCCTACCCTACAGC
AAGCATTAGATGCTGTGTCTAATTATCCATGGTTAACACAGGCAAGCTCTTCCATAATTT
CATGTATTCAGAAACGTATAAGTGGTTTCCCATGTCAAGATAATGTGTTTCATGCAAATG
TGTACTTGTGCGAAAGTATTGTGCATTTATTGGACAAGAACCCATCCCTAATTTCTCCAG
CTGTGCAAGCGTTTTATTTGAGAAATCCCGTTGATTTAAGAGCTTGTAGAAACTTCACTT
ATTTTAAACCGGAAAATCGTGTATGGTCTCAAATACCAATGACGCGATGTCATTATGCAC
AGCTAATGCAACAGCAGTTCATTGCAGACAAGCGTAGTGGGTATTTACCCAGCTCTGCCC
TACCCCCTAAACAAAACAAAGGTGTTGACTTAGGTATGAAAATATCTCACGGTTTAGAGA
TACTTTGCTCTAAAGTAAAACCAACAAAAAGTGCTGAAAATTCTGCCGAAACTGCTTTAT
TTGATGAAGACAAGTTTAACAGTTTTGTTTCTTACCTTAAAGAAACCGGTTATTTCCGGA
ATGAACTGGAAGGGTCCAAACTTTATAATCAATTAAAAATTGAGGCACAAAAATTTTTCA
CTGAAAATTGCGTTTCGGATAGAAATGTACCTACTGAGCAAGATGTGCTTGTAAATATGG
TGAAAATGCTTAAAATTTGGGGAAAAAGTGGGTTTCCGAAATTAGAGACACTTGTCATTA
AAGATATACTGGAAGAGCTACCTAATGAAAGTTCTGATAAATGGATGTATTTAGACGAAA
ACGCAGTTGAAGAGTTAACCAAAGAAATGAATTTGGGGTTCAAAAATCTGCATATTGGAA
AAAAGAAGAAAAAAACTGCGGACTTGTCTCAGGAAACTATAAAAGAAACTGTGGAAAAAA
TGAAAACTTTTGTGGGTGAAGTCTCTGGCCTCGAGGGCGTAGAAACTACAAATGATATAT
CCCCAGTGGTTTTTGATGTCGAAAATTTTATGTTAAACGTTGAAAATATGCTTGGTCATG
CTGAGAATATGTCCGATGAATCCTCAAGTGAGTTTTTAACAAGCGATGAAGAAACAGACA
CAGATTTAGAGGAAGAAAAAAATGAAATACAGGAATACATGGAAAAAATGGACTCCGAAT
TGTCTGCTACCGCTGTTGGAAAAAGTTTTGTAAAACTCAAGTCTGAAAATGCTGGCGTTA
GTGAAAATATTTCTACAGAAGAACAAAAATTAAATGAAGATAACGCGCCGGTTAATATCG
ATTTGAATTTAGTTGAGAACTTTTTACAAGGGTGTCACAGCCAAGCTGGGTTAGCAGGTC
CCGTTACAAATGTTTTGGGAAGCCTTGGCATTAATATACCTTCAGGTGTAGATTTAAATT
GACTTTTATATTCCAGGTTCTAAAAAACTATCGTTTTTGGCATATCGTTTTTAGGCAGAA
AATATCGTTTTTGTTTTGTTGAATCTGTGCCCCAAATTTTTTGTGGAATCATAAATTATT
ACTTAGAATCATAGGCCCAAACCTAGGCAGGCCTACCCGGAAATTTTCTGCATTGCATTA
ATCGAAAATTAGCACCAAATTTGTTGTAAAGTTATGCATGTCTAACTATTCCTGCATTCA
AAAGTTGGGTGCCTATGCGTAATACAACCATAACTGCAATGCAAATGAGTGACATTTTTT
AAAAGGTGTTTTGGGCATATGACACCTATACCTTGTGAATGTGCAATTGTTTGCAGATAA
AACAGGCATTGTATTATTATGTTAACATGTTTATTGAATTTTATCATGATCCAAATTTTA
ATATATATTTCAAAATTCTAATGCAATTAAAAAACGATGTAAATTTTCTCTTCTGGTAAA
ATTATGCCTCTTAACAACAACAGTAAAATTAAATAAACGTTTTTTTACCGCCTACTGCCA
ATTTATACTCTTGTTTTTTGCAG

InterProScan

PANTHER
Ecd (IPR010770) - T[17-624] 1.6E-174
Pfam
Ecd (IPR010770) - T[25-590] 4.0E-182

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
ECD_HUMAN 35.023 % 352 4.96E-113