Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Clone 'cinc008a19'
  2. Clone 'cien214295'
  3. Clone 'cien201431'
  4. Transcript 'KH2012:KH.C2.393.v1....'
  5. Transcript 'NCBI:KH.XM_018816504...'

Transcript Model

Transcript Id

NCBI:KH.XM_018816504.1

Possible name(s)

NCBI:KH.108950553

Location

KhS1111 [7,575 / 12,774]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,078

>KH.XP_018672049.1
MKRYPCTKCSCDCRTACIECWSCKKWVHYACLDMTKEIIQEWENTRLKFFCNNCATKNNN
EKEYDFHLALSRITSNLSKKCTKSFCKGMATQEQLLIKTYQVQLLPPFNYNPSCQVKDEK
SELLLRKLHPSVLNTHYPIHALGDGNCMYRAASIALFGSQKFHVQLRLAVALEILKYPEF
YHINEGNFVLPDITVVTPCFKEVCISASRMNDYADLIHIYALSAAVKHKFNSYMPTIGPM
DRRGISYTREIIGRGVNLRSAFGGILMWTTTNLKTENNILKFNPNHFCFLKERSLGKPEE
ENQIIIISDDSEISDDSDKQENQHPHTEIFIADPETETFIADTETETFSADPETETFIAD
PETETFIADTETETFIADPETETFIADPETETFIADPETETFIADPETETFIADPETETF
IADPETETFIADPETETFIADPETETFIPDPETETFISDEEHKDSQKQIKQPFTKLPFKD
TFLTQQEAIEYLSVDCRKLVEPCIPCGIKENVFILVDNSDNLERAARGKGKVFSDDCGAW
IKNSMTVLKSIAQHKNIRTLQKHNGKYCTRNARQNKYTPLLKQPEDNEVITLGHYYSKLK
KDQKYKRKITWVISPGPLKVNTKVALVEYIGLFPGNMPHLNSNHGNIYIRTPVSTTKFIK
NRVKTCATPKEIYDDLVLTMDATTAPRNLQQIYNKKHATSKTEGKGFNTNYADDILRVIN
LAQSEEFVQSILHKKDSPVAIILYNEKQISDIVRFCCTGRSVLNVDKTFNLGKIHVTITV
YKNRSVKSIKSGNNPLFLGPVFLHNKSDFKTFSFFFTQLGSVIGPHHDKMIFGTDDEQAM
HKAITYAFPYCTHILCFKHLRDNLVDYLKDKVGADKQLRKQILQLMDKILDTKNEIDFAV
AEFKLIEFCETYCTSLQSYLKERFLVLLRTKVWEFRNLEPIGDRWTNNNAESYNHVIKCK
FQWKQKKIADIVTTLKSLVDVGYTDVERAILSIGPYELTNEFLHFKMGVNEWRDMDTESK
SSHLKKFRKYNGLRRGNLSTNSKLLTAPISSNAGKKVGQMKRPRGVRTRSPNKKLKKM

Nucleotide sequence

Length: 4,669

>NCBI:KH.XM_018816504.1
TTGAGAATATGTCATAATATTTAAGGCATGCGTAGCATGTAGAGTGTTAGAACGTTATCA
AAGTTGTCGAAAGGTTTGGCTACTTAAATTGTAGTTATGGGTTAGTCGTTAGTGCTTACG
TTTTTAAAGTTAGTGGTTTGCAGAAATAATGTAGTGGGTGGGTTCTTCATTAGCACCAAG
GTTTGTATTATATAACGAGCATGAATATAATCTGTTTTGAAATGTCTTGTGCTATACAAG
TTTTTTTGTGTTGGGGATAAAGAAAAAAAGTAATGCAAACCTATAAACAGTTTTAAAACA
TAATTATTTATACTTTATTTAAATTAGAACCTGAAAAAATAAGAATTTGAAAAGGTTACC
ATGAAGCGATATCCATGTACAAAATGTTCATGTGATTGTAGAACAGCTTGTATAGAATGT
TGGTCTTGTAAAAAATGGGTTCATTATGCGTGTTTGGACATGACAAAGGAAATAATACAA
GAATGGGAAAACACACGGTTAAAATTTTTTTGCAACAATTGTGCAACTAAAAACAACAAC
GAAAAGGAGTATGATTTTCATCTTGCACTTTCGCGCATTACGTCCAACCTGTCCAAAAAA
TGCACAAAATCATTTTGTAAAGGTATGGCTACTCAGGAACAATTATTAATCAAAACCTAC
CAAGTACAACTTCTCCCACCATTTAATTACAACCCTAGCTGTCAAGTAAAAGATGAAAAA
TCAGAATTACTTTTAAGAAAGTTACACCCATCTGTATTGAACACACATTACCCTATCCAT
GCTCTGGGAGACGGAAATTGTATGTATAGAGCAGCATCAATTGCATTATTTGGGTCACAA
AAGTTTCATGTGCAATTGCGTTTGGCAGTGGCACTAGAAATTTTGAAGTACCCTGAGTTT
TACCACATTAATGAAGGCAATTTTGTCTTACCGGATATCACAGTAGTAACTCCATGTTTC
AAAGAAGTTTGTATTTCCGCAAGCCGTATGAATGACTATGCAGATTTAATTCACATTTAT
GCCTTAAGTGCGGCTGTCAAGCACAAATTCAACTCATACATGCCTACAATTGGACCAATG
GACAGGCGAGGTATTTCATACACCAGAGAAATTATTGGAAGAGGAGTAAATTTACGAAGT
GCATTTGGGGGAATCCTAATGTGGACAACGACAAATTTAAAAACAGAAAATAATATTTTA
AAATTTAATCCCAACCATTTTTGCTTCTTAAAGGAACGCTCTTTGGGAAAACCTGAAGAG
GAAAACCAGATAATTATAATCAGTGATGACAGTGAAATAAGTGATGATTCGGACAAACAA
GAAAACCAACATCCACATACAGAAATATTCATTGCAGATCCAGAGACAGAAACATTCATT
GCAGATACAGAGACAGAAACATTCAGTGCAGATCCAGAGACAGAAACATTCATTGCAGAT
CCAGAGACAGAAACATTCATTGCAGATACAGAGACAGAAACATTCATTGCAGATCCAGAG
ACAGAAACATTCATTGCAGATCCAGAGACAGAAACATTCATTGCAGATCCAGAGACAGAA
ACATTCATTGCAGATCCAGAGACAGAAACATTCATTGCAGATCCAGAGACAGAAACATTC
ATTGCAGATCCAGAGACAGAAACATTCATTGCAGATCCAGAGACAGAAACATTCATTGCA
GATCCAGAGACAGAAACATTCATTCCAGATCCAGAGACAGAAACATTCATTTCAGATGAG
GAACATAAAGACAGCCAAAAACAGATAAAACAACCATTTACGAAACTACCTTTCAAAGAT
ACTTTTTTAACTCAACAAGAAGCAATTGAGTACTTATCAGTCGATTGTCGTAAACTGGTA
GAGCCTTGCATCCCGTGCGGAATTAAAGAAAATGTTTTTATTTTGGTAGACAATTCGGAT
AATCTGGAAAGAGCAGCAAGGGGAAAAGGAAAAGTATTTTCAGATGACTGTGGAGCATGG
ATTAAAAACAGCATGACTGTTTTAAAATCCATTGCACAGCATAAAAACATAAGAACATTA
CAAAAACACAATGGCAAATATTGCACTCGCAATGCACGACAAAACAAATATACACCATTA
CTAAAACAGCCAGAAGATAATGAAGTCATTACATTAGGACATTATTATTCAAAATTAAAA
AAGGACCAGAAATATAAAAGAAAGATTACGTGGGTGATTTCTCCTGGACCTTTAAAAGTT
AATACAAAAGTTGCACTTGTAGAGTATATTGGACTGTTTCCTGGCAACATGCCACATTTA
AATAGTAACCATGGAAACATTTACATCCGAACACCAGTGTCAACAACAAAGTTTATCAAA
AATAGGGTAAAAACCTGTGCAACACCAAAAGAAATTTATGATGATTTAGTGCTGACCATG
GATGCAACAACCGCCCCCCGCAATCTGCAGCAAATATATAACAAGAAACATGCTACCAGT
AAAACAGAAGGAAAAGGATTCAATACTAATTATGCAGATGACATACTACGTGTAATCAAC
TTGGCACAGTCAGAGGAGTTTGTCCAAAGCATTCTTCATAAAAAAGATAGTCCAGTCGCA
ATTATTCTTTACAACGAAAAACAAATTTCAGATATTGTCAGATTTTGTTGCACTGGACGT
TCGGTATTAAATGTTGACAAAACTTTTAATCTTGGAAAAATACATGTCACCATAACGGTT
TATAAAAACAGAAGTGTAAAGAGTATCAAAAGTGGCAACAATCCTTTGTTTCTGGGGCCA
GTGTTCCTCCATAATAAGTCTGATTTTAAAACATTTTCTTTTTTTTTCACTCAACTTGGA
TCAGTCATTGGACCCCATCATGATAAAATGATTTTTGGAACCGATGATGAGCAAGCTATG
CATAAAGCCATTACATACGCCTTTCCATATTGCACCCACATTTTGTGCTTTAAGCATTTA
AGAGATAATCTGGTTGATTATTTAAAGGATAAAGTTGGTGCAGATAAACAGCTACGCAAG
CAAATTTTACAACTGATGGACAAGATACTTGATACGAAGAATGAAATTGATTTTGCTGTG
GCCGAATTTAAATTAATTGAATTTTGCGAAACGTATTGTACAAGTTTGCAATCATATTTG
AAAGAGAGGTTTTTAGTTCTTTTAAGAACTAAAGTATGGGAATTTCGCAACCTGGAACCA
ATAGGTGACCGATGGACAAATAATAATGCCGAGTCTTACAATCATGTCATAAAGTGCAAA
TTTCAGTGGAAGCAAAAAAAAATTGCAGATATAGTAACAACACTAAAAAGTCTTGTTGAT
GTGGGATACACTGATGTAGAAAGAGCAATTCTTTCAATCGGTCCATATGAACTTACTAAT
GAATTCTTACATTTTAAAATGGGAGTAAATGAGTGGAGAGACATGGACACTGAAAGCAAA
TCAAGCCACTTGAAAAAATTTCGTAAATATAATGGTCTGAGACGAGGTAATCTTTCAACT
AATTCAAAACTACTAACTGCTCCTATTTCATCAAATGCCGGCAAAAAAGTAGGCCAAATG
AAACGACCAAGAGGTGTAAGAACAAGGTCACCAAATAAAAAATTAAAAAAAATGTAATAT
ATTTCATTAAAGTAATAATGACCTGAAACTTCTAACCTGTAAATAATATAAATTACATCA
TTAGACAGCACATGCAAAGCTGTAAATTATCAATTTCTGATACTTGATTAACTTTAATGT
TGAAATGTAGATTCTACATTGTAGAATACAAAATAAAGCGAATGATTGTAGTTTTGAACT
GCAAAAGCTGTTTGTGGTAAAATATTTTTTAGGCTCTAGTCTTTTCTACCCCCAAGTAGC
CTATTGTTTTGTGCCCGAACTGACTAGATTGAAATATTCCCACTTTGTTTTACATTATAA
ATTACCACTATTTAAAAATTGTTATTTTAGAATCGTGTTTCTTCATTTCTTCTTTATTCA
TTTCCTTTCCATTCATTTCTTTTATATATATATATTTCTAATTTTTCTATTAGAAAAGGT
TTACATAAACGTGTAGGTATACTTGTTGTAAACTGAGCCAAATATTCACAAATTGTTTAC
TGCTGCATCATATGGATGCGATTATGGAGAAGATGGTCCTGGAACTGAAGAACAAACAAG
AAAAATGAGGCAAGTATTGATGTTAGTTCCACTAAGAATAAATACTGCTACTGTGCTTCA
CATACTGCTTTCACAGGATTGTGCGGAATGATGTCTATGCTAAAAAAACACCCGGCGGTA
ACTAGGCTGGCGATGACAGAGTCCCTGACTGCTAGGCGATTCCTGATTGCTAAGGCTTGA
TTTGACTTTCGAAGCATCTGAACTATCAACAAACCATCTTCGCACCACACAATAAAAAGG
TTTACAGCTAAGATGAAGCAACCCTCTACTTATCGGAGTAGTTTCAGACATCAGCATTGA
TCCATGAAAACTATAAACCTAAATTCAGGAACAAATTGCAACCAACCTCTGACATTATCC
TTACCGTTTTTCTAAATGTTACTTAAATGTGCCCTTTTGTACTTCCGTTTTAACCGTGAG
CGTCTTTTAACGACTGTCGTTTTACCGTTAATTCTCATTGTTTTGCCTTTGTAAACTTTT
CTGAATTTTGTTAGTGTGACCAAGGAGACAAAATAAAATCATTTTGACT

InterProScan

ProSitePatterns
Zinc_finger_PHD-type_CS (IPR019786) - T[6-54] .
SUPERFAMILY
Znf_FYVE_PHD (IPR011011) - T[8-58] 5.54E-5
Pfam
MULE_transposase_dom (IPR018289) - T[762-863] 1.4E-7

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value