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  1. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S1...'

Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S139.g04292.01.t

Possible name(s)

WNT2; WNT6; WNT8A

Location

S139 [128,188 / 134,226]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 486

>Harore.CG.MTP2014.S139.g04292.01.p
MIVSSLYCYPRKVITFKLNIKAKLIIKHHKYAITASNLVFNGFYEQCLGEPRSPEALICP
YTRETSYLSAVTSAAVTYTITYACSTGAIEECGCGDERVGSYHLLKQEAIKRNMKVNESD
LLRAASTFKWGGCSDNIDYGYRMSRLFLDNFGRQKQPERGELKNLVEKHNYEAGRLVIKN
HMIRQCRCHGISASCALETCWNKMQKWQNIGNIMRKRYDGAIRVHLGNDGRSLLPSRRQR
KHFKQYWFNRKAHATDVTLNRRYKRAAPMRPGIYPPDMGTASLKVVKDRADSGRDTLQTR
GPVLRLLRSRRRHRRGGADRKLVITGEHLIYSQESSNFCKRSRRQGSLGTRGRRCIPHVS
GPGNCDYLCCGRSYTQHQIRVTKSCNCRLKTDYCCELICDDCSLCFVSAHSARITRGSVI
LKRCLPLGHITYQSRGCIPYNSTHTYMFGLRFVNGIFVGKRILGVVLLRVKECSPIWIGN
RLRLWN

Nucleotide sequence

Length: 4,900

>Harore.CG.MTP2014.S139.g04292.01.t
TGCTTAAGTTAGTTCCACATGTAAAGTCATAATTTCTAATAGACAGCATTCAGAATCAGA
ACTAGAATAGCACAATAAATTTGGCAAACGGAAAATTATCTTTATTGACATCTAGCGGAT
AGGAGTTATGCAAATAAGTTTGGTTTCAACCCTTTGGATGTATTTTCGCTTACGTAAGAC
AATTCTAAAACTATTCCCAGTAGAAATGAATTTCCAATAACCAGATTTTTAAAAGAACTT
AGTTTATTTTATTATATATTTTGATCATAATCACTTAATGGTGATGAATTCATTCCGGTT
GAAAGGTCGTATCATGATAACGAATGGCCCTGATTGACCTTCTCATCTGAATGATAGTTT
CTAGTTTATATTGTTACCCGCGAAAAGTGATCACGTTCAAATTGAACATCAAAGCAAAAC
TGATCATCAAACATCACAAATATGCTATAACTGCGAGCAATCTAGTTTTTAATGGCTTTT
ATGAACAGTGCTTAGGGGAGCCACGTAGCCCTGAAGCACTGATATGTCCTTATACTCGTG
AGACCTCCTATCTCAGTGCAGTGACCTCAGCCGCTGTGACATACACAATTACGTATGCAT
GTTCGACGGGCGCCATAGAAGAGTGCGGGTGTGGCGATGAAAGGGTCGGAAGTTATCATT
TACTCAAACAGGAAGCTATCAAACGAAATATGAAAGTGAACGAGAGCGACCTCTTGCGAG
CAGCTTCGACCTTTAAATGGGGAGGTTGCAGCGACAATATTGACTATGGTTATCGTATGT
CACGACTTTTTCTTGACAATTTCGGGAGACAGAAACAGCCCGAAAGAGGAGAACTGAAAA
ATTTAGTAGAAAAACATAACTATGAAGCAGGACGATTGGTCATTAAAAACCACATGATAA
GACAATGCCGCTGCCACGGTATATCCGCCTCCTGTGCCCTTGAAACCTGCTGGAACAAAA
TGCAGAAGTGGCAGAACATCGGGAACATCATGCGTAAACGCTACGACGGTGCTATCCGCG
TGCACCTAGGAAACGACGGTCGGTCTCTTCTGCCCTCTCGCAGACAGAGGAAACATTTTA
AACAGTATTGGTTCAATCGTAAGGCTCATGCCACAGACGTGACTCTGAATCGGCGGTACA
AGCGTGCAGCACCGATGAGGCCTGGCATATACCCTCCGGATATGGGCACGGCTTCTTTAA
AAGTAGTCAAAGATCGTGCTGACTCGGGTCGCGACACCCTGCAAACCAGAGGCCCGGTAC
TTCGCCTTCTTAGGTCGAGAAGGCGTCATCGCAGAGGTGGGGCAGACAGAAAGTTAGTCA
TTACTGGGGAGCACTTGATTTATTCCCAAGAGTCATCGAACTTCTGCAAGCGCTCGAGAC
GACAAGGAAGCTTAGGCACTCGTGGAAGACGTTGTATTCCGCACGTATCTGGTCCAGGTA
ATTGTGATTATCTTTGCTGTGGCAGGTCTTATACACAGCATCAGATTAGGGTTACGAAGT
CGTGCAACTGTCGGCTTAAAACAGATTATTGTTGCGAGTTGATTTGCGATGATTGTTCGC
TGTGCTTCGTTTCTGCGCATAGTGCTAGAATTACCCGTGGATCAGTAATTTTGAAACGGT
GCCTCCCATTGGGCCATATTACTTATCAGTCACGGGGCTGCATACCTTATAACAGTACAC
ATACATACATGTTTGGATTGAGGTTTGTGAATGGGATATTTGTGGGTAAACGTATCTTGG
GAGTAGTGTTGCTTCGGGTGAAGGAATGTTCCCCTATTTGGATTGGCAATCGACTTCGCT
TATGGAACTAACTTGACACAATGTTGGTTTTCCAGCATATGTAAGCTTTTTCAGTGAATA
ACGTTAGTAATATTGATTTAAGCTTGGTGTCGGCTGGGCCGAAATTGAATGGTTTACTCC
AGCTGGTTTGGTAGTTGAACTAAATCTGTAGAAAATGTACTTGTATTGTTAGACTGATGG
ACTTGCTGTGTGTGATTGGTTAATTAGGTAATGTATTTTGTGAAAGATTGTCAATATTAA
GTACTCCGTATATACTTAACTATAAGTCAAGGTTATTTACCTGAACATTAACAACTACTT
GTTGTCAAGTAGGTTATGAAAAACGCAGAAAACTTATTTAGTATTCTCTCTAATTTGACC
TCGTCTTATACTAAAATGAAGTATGTACCGTACTTCGTTAGTTCGTTTAGTTACTGTTAA
ATTGTTTAGGTTTTTTAAAATTACTCCATCATTTCCCACAGTGAAACAAGAAAAAATAAT
TGTAGTTCCAGTGCTAGTAATTACCCTAAATATCAATTTCTGTTTCCCAATTATTTTTCC
ACGATAAGTAGAGTATAGCGGTCATTACAGTAAGACAATTAGACCATAATTGAATCATGA
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AAAGGTGTGAAACTGGGAATTGCTTCGAGGGTGATAGTTAAAACAAATTCTTCAAAAATC
ATATGGTAAACCTATCGGAAATAACGAAAGGTTAAGAATCACAGACCTTAGCATCTCCCC
AGTTCTTAACAGTCATTTCCGACACTGTTATACATATAATTATAACAGTACAGGGTGTCT
CCCAGTCGATGTTAGAAAATATCTCGTAAAGTGAATTCCCTTACATAAAAAATTGATCGT
GGTCACTCATGAAGTAATTCATTAATAAAGTCAATATAGCATGTTTAGTAGCTGTTGGTA
TAAAATGTTAGATGTGATTCCTTGTTAATCTAATTCTTGTCAATCCATGTGCTCATAAAT
CAGCGGTTTCTTGTACAGTTGCGCTTAAACGAAGCCTGATATGGCTGAAATACAGACACC
TTATTTGGACACTGAACAGTACCGCAAATGCGCTTGCCTTTTTCGTGCGCTTTTCTCGTG
CCATGTGTAACACAGCGGTTGAGGAAATTTCTTGAAAATGAATCGAAAGCTTACGTATGA
ACCTCGAGGTTGATGAAAATTTACTAAAAAATGATTTTTTCCAAGGCCTGATAAAGAATA
GAAGAAATATAGGTATATAAGTTTTCTAACACGTAGATATGTTATTAGTTCTTCTCCAAT
CTTCATGGAGATTTTTACATTCTAAATGTTTCTACTGGTAAATTCCTTGTTTGTGGTCAC
AACTGGTTTCTAATTTATGTGATTTTCGTACCTATTTCGTTGCAGGCTTTTGCTTTGTAT
CAGTTTTACAGTATTGTGTTATATACATTGTACAAAACTGATAGCAGTATTCCACCCTTT
CCTAATTATTCCTAATTCCTAATTCCTAATCTTTATAGCCAGTTACATAACATAACTACA
ATCAGGTAACAGTGATCAGGCCCTGGACCCAAATTCTAGTCATTCGTATTCATGGTAATT
TAATATTCTGTGGTGGTATATGATAGCTACTCGTACAGCTTAATATAGTATCTAGCATCG
TTTTAATACGTACTATTCGCGACCTTATACATATTCTTGTTTAATTTTCTCTCTTGAAAT
GTCCTCGGATCTTGTATCAGGGACATTGGGAATTTACCATCATGACATTTTCGAACGTTT
ATTTATTTTATTTTCTCTTCATTTTTTTTTCCTCTTTCCTTTTCTAATATTGTTTTTAAT
ACACGCGGGGGATCTAATTTATGATAATAATAAGAGCATGGAAGCGAGAGCACTTAATTG
AAGGTAAATAGTGTAGAGAAGAAAATTTCTGTGGAGCCTCTTTATGTATTTCATATTACC
ATTTCAGTAAGTTAATTAATACCAAAGGAACTCGAGTTAAGTAACAGAAATGAGAATCAA
ATTGACTCGATTACTTGGAATAACTTGATTTGACTGTATCTAATATCTCGACTAGTCTCT
ACTCTAAAAATCCGATCCGGCTAGACTTCAGACTCAGACATTTCCAGTCTTTTATTGTTT
CTATTGATTAGATGATTATTAGCTAAAGTAAAACCATCGGATGAATTTATATCGGTTTGT
TTTAAATAATTCCACAATTTCCTATAGGGAACTAGCAGTAAAATGTTGTTATGCTGTGCA
AGACTCGACTTGAGTCGAATTAGTAATGGAAATTGACTCGATTTAACTCCAGTGACTTGA
TTGTAACACCACATTCAAAATTCCACTTGGTTTTGAGTTACAACATATGCTGAAATCTGA
GTCGCATTACACCTTGTTTGACAAGCACAACATCCTATTTTAATTTTTAATGTACATTTA
ATGCCAAGAGACAACGATAAATAATATTGAAAATCCTCAAAATATATCAATGTACAGGGT
GGGGCGTAACATTTTAAATATTACCCCAAATTTCAAACCAATACACAGAGAATTCATCAT
GTTCTCATGAAGAATAAATCTTGGAATTGATTGTAGAAGAACTTATGGCTTAAATTTAAT
GATGTGGTAAAAATTATGATCGTATGCAAACTTTGGGAGTTCTGTGTTGTTCTGTATGAG
AGAAATTTTCTTTCAGGAAGGAAAGAACAAACATGTTTTCCGGACATAGAAACAACACAT
GCGTGAAATGAGGTCGTCCCATTGTTATCTTGGTTCATCCGGCGTACATAAATGCTTTTC
AAAGTATTTTATCTCGTTCCTATCAAGTCCGATGTTTTTTCAAAATTTCGTCGTCGACAT
TGGCAATTTTGGCGTTGTTATAGTTGCGCTACTTTTTGTCGACGTGCTGCTTTGTGAGGA
CGTTGTCGAAATATGACAACACCCAGTTACAAACTTCTTAGTTGCTTTTCTCATGTTACT
GTGAGCAAAAATTGGGAATTATTTTTTTTAGAAAGATTGTGACTTGTATGATTCTCTGAT
ACGGTAAATAGATACAGATTACAACCAAACACAAATATCC

InterProScan

SMART
Wnt (IPR005817) - T[15-406] 8.2E-45
PANTHER
Wnt (IPR005817) - T[47-403] 1.6E-81
Pfam
Wnt (IPR005817) - T[61-403] 2.0E-70
PRINTS
Wnt (IPR005817) - T[63-77] 3.1E-21 - T[82-95] 3.1E-21 - T[128-140] 3.1E-21 - T[187-201] 3.1E-21 - T[328-339] 3.1E-21

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
WNT2_HUMAN 34.444 % 122 6.39E-31
WNT8A_HUMAN 34.066 % 121 9.97E-31
WNT6_HUMAN 38.547 % 139 6.5E-37