Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S147.g05655.01.t

Possible name(s)

ABHD6; EPHX2; MEST

Gene model

Harore.CG.MTP2014.S147.g05655

Location

S147 [8,547 / 10,786]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 343

>Harore.CG.MTP2014.S147.g05655.01.p
MNLFNAVIFGVIAYLMWLYLDNDVPLPEEIPLDTWPSHIREWHNKGQYTKINGRQMFYIV
EKCQNKNLKTVPTFALIHGYPSSSFEYHKVLHDLSQHGDVILNDHIGFGFSDSPSENYTY
SVSEAAENILALWKFLGLKKAHIVSHDMGDSILTEILSRRHRGMLPNYFDNFFQSVTFTN
GGMNIRLANLRITQKLSMYKGLAKLLVNLVERLGIMEWMVAKELGRIWSPVEDPIVRNKD
IQDLVFVNKCKNALRNLLNSMYYLWDRYHFEYKWYDALKELDIPSQFLWGDSDAVAPIAI
AKSFERMVPGFDLTLIKNGGHFWMLEKPDVWVKEIVKILNKVK

Nucleotide sequence

Length: 1,728

>Harore.CG.MTP2014.S147.g05655.01.t
CATCGGGTGGTAAGGACGAAAATTACAGAACGGTTAAATAGTCAACAGTGGTTAATGATA
AACTAAAAAAAAAAATAATAAAGCAACCTTTGGCTCAATTTCGCAAAATGTAGGTTAAGT
AAATAAATCGTTGTTTACCGGTTTGTGTGGTGGAATCGTTCACGAACGCCGGCGTAGTTT
TCAGTGGAGCGTATCCTGATATAAGAGGAGGAACTCGACGAGAAATTATGACTGTAGTAG
TAAGACATTTGTGCTTAAAGCTTTCTAGTATCCGCCATTGACATTTGTTCAGCGAGAAAA
GAGTGCTAAACTTTAGTTAAAATATAATCTCAACCACCAAGGATCTATTATGAATCTATT
CAATGCTGTTATCTTTGGGGTAATTGCTTATCTCATGTGGTTGTACCTTGACAACGATGT
CCCACTTCCAGAAGAAATACCGTTGGACACTTGGCCAAGCCATATTAGAGAGTGGCACAA
CAAGGGGCAATACACAAAGATTAATGGACGTCAGATGTTCTATATTGTTGAAAAGTGTCA
AAATAAGAATTTGAAAACTGTTCCGACCTTTGCGTTAATCCATGGTTATCCCTCTTCAAG
CTTCGAGTATCACAAGGTGCTTCATGACCTCAGTCAACATGGTGACGTCATTCTTAATGA
TCACATCGGATTCGGGTTTTCTGACAGTCCCAGTGAAAACTATACATACTCTGTCAGTGA
GGCTGCAGAGAATATCCTTGCTCTGTGGAAGTTTCTTGGATTGAAGAAAGCTCACATCGT
GTCACATGATATGGGAGATTCCATTTTGACAGAGATACTTTCCAGAAGACACAGAGGAAT
GTTACCGAACTACTTCGACAACTTTTTCCAAAGTGTCACATTTACAAATGGTGGTATGAA
CATAAGGCTTGCTAACTTGAGAATTACCCAGAAATTATCTATGTACAAGGGCCTCGCAAA
ACTTCTTGTCAATCTCGTGGAGAGACTCGGAATCATGGAGTGGATGGTGGCGAAGGAACT
CGGAAGAATTTGGAGTCCAGTCGAAGATCCCATAGTGAGAAACAAAGACATCCAAGACCT
GGTATTTGTCAATAAATGCAAAAATGCTCTACGCAATCTTTTAAACTCAATGTATTACCT
GTGGGACCGATATCACTTTGAATACAAGTGGTACGACGCACTGAAAGAGCTTGATATACC
CAGCCAGTTTCTTTGGGGTGATTCTGACGCAGTCGCCCCTATTGCCATCGCAAAGTCTTT
TGAACGAATGGTTCCTGGTTTTGATTTGACTTTGATTAAAAATGGTGGCCATTTCTGGAT
GCTAGAAAAACCTGATGTTTGGGTGAAGGAAATAGTTAAAATTCTTAATAAGGTTAAATG
AATTACAAGAAATGTGGAGCGGTTAATTCCTCAGGTTAACTTCATGCTATTATTGATTGT
CTTGCAGTGTTCCCTGAATAAAAAAACAATAAAAATTTGTCTACATTTTAATCCTGTGAT
GATTTTTGCTATCAGATTCGGCTAAAGGACGTAGCGTCAAATGCTTGAATGCTGCAGTGG
TGGAAATGGGTTCTAGGAGCTAGGGGGATGTTAAAGTTTGTGAGGCTTAGGTAAGATGGG
AGGGTAGTCTCTACTTAACCTCGTGTGTCCGAGAGCACCCATGAGCACAGACACGTGGGA
GGTAAACTATTACTATTGGTTACTTTAAAATATGGAAAAGTGCAGGAT

InterProScan

SUPERFAMILY	AB_hydrolase (IPR029058) - T[28-341] 1.04E-43
Gene3D	AB_hydrolase (IPR029058) - T[40-343] 4.6E-40
Pfam	AB_hydrolase_1 (IPR000073) - T[76-333] 1.4E-9
PRINTS	Epox_hydrolase-like (IPR000639) - T[78-96] 1.9E-7 - T[143-156] 1.9E-7 - T[283-299] 1.9E-7 - T[316-338] 1.9E-7

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value