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  1. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S97....'
  2. Transcript 'Haaura.CG.MTP2014.S2...'
  3. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S1...'

Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S148.g02874.01.t

Possible name(s)

TGFB1; TGFB2; TGFB3

Location

S148 [19,652 / 34,665]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 336

>Harore.CG.MTP2014.S148.g02874.01.p
MYSCCWSLCFLLVFHIVAPPMTMAACGVDIQKMKTRRIEAIRGQILSKLGFTQLPRDEVP
PGRVPEEIESMYNRTRDFVEEQARLRREDCAEREEDYYAQEVVTVYTKRVQSSFEEVESY
KNRKLLYEVSEFFEFDLDSYKLDPDAITSASLRLYQVQNPSTDSRISQQIDMHQLTLPTK
EGRGPGRHFLSMRLVDTLGEGWQTFDVTSTVRDWIRYPILDNLRALLVYWFIGKTLGRNA
ILSVSDGALFAPSGFTCYILRSHGLVPNAIPNSPGCRYLLLVSLYQQHDIICKSLENQVY
PHYKSCGASGTCIIKSTTKCSGGVIKVIDTTSHNRI

Nucleotide sequence

Length: 4,053

>Harore.CG.MTP2014.S148.g02874.01.t
AGTTTAGATCACATTGAAACTGCGTAAAGTAAATTGCTGTGTATCAACTATACTGTTACT
ATCAGTATTGCTGTACTTCAAATTGTCGGCTATGTATTCTTGCTGCTGGTCATTATGTTT
TTTGCTGGTCTTCCACATCGTTGCTCCACCGATGACGATGGCGGCGTGTGGTGTCGACAT
CCAAAAAATGAAAACCCGCCGTATCGAGGCCATCCGAGGACAAATTTTAAGCAAATTGGG
CTTTACGCAACTGCCCCGAGATGAAGTTCCACCCGGTCGTGTCCCGGAAGAGATCGAATC
GATGTACAACCGTACGCGGGATTTCGTCGAAGAGCAAGCCCGGCTACGCCGCGAAGACTG
CGCCGAGCGAGAAGAAGATTATTACGCTCAAGAGGTCGTGACTGTTTACACTAAACGTGT
ACAGTCAAGTTTTGAAGAAGTTGAATCATACAAAAACCGAAAGTTGCTGTATGAAGTATC
CGAATTTTTCGAGTTTGATCTTGATTCGTACAAACTGGACCCAGATGCAATTACCAGTGC
ATCACTTCGACTATATCAAGTTCAAAATCCATCGACCGATAGTCGGATAAGTCAGCAGAT
CGACATGCATCAGCTGACATTACCGACTAAGGAAGGTCGCGGTCCGGGAAGGCATTTTCT
TAGCATGCGTCTGGTGGACACACTGGGTGAAGGATGGCAAACATTTGATGTTACTTCCAC
GGTTCGAGATTGGATCCGATACCCAATACTAGATAATCTTCGAGCTTTATTAGTTTATTG
GTTTATTGGGAAAACCTTGGGCCGCAACGCGATATTGTCTGTTTCTGATGGAGCCTTGTT
CGCGCCAAGTGGTTTCACGTGTTACATATTGCGTTCACACGGTCTTGTTCCAAATGCAAT
CCCTAATTCACCAGGTTGCCGGTACTTGCTTCTAGTTAGCCTTTATCAGCAGCATGATAT
AATTTGCAAGTCCTTAGAAAACCAAGTGTATCCTCACTACAAAAGCTGTGGCGCCAGTGG
GACATGTATAATCAAATCGACTACAAAGTGCAGCGGTGGTGTTATCAAGGTCATTGACAC
CACTTCTCACAACAGGATATAAGTTCTAACCTTGGTATGGAAATGACAGTACCGTGTCCA
GCAGAAGACAATTTTCAAGGACAAAGAAGAAGATCCTCCACGCGCAGCTTTACTGAAAAA
ATGGACATATTATTTGCAGGTTCAAATAGACTTATAAACCTTGCCAGGGCAGGACGTGGT
GACAGAATGGGCGATCACACTGAAATAGTAAGCATGAAAAAAGATTTGTATCCTCATCTG
GTCATCATGATGAGGTCGGAAGCTGCCCAGCAGCAGAACAACATCAAAGGCAACGGACGC
AGAAGGAAGAAGCGCTCGCTCGACGCCGATTACTGCTTTTCCAAAAATCCGAACGAATCC
AATTGCTGTTTGCGAGAACTCTATATAGATTTTCGTAAGGATTTAAAATGGAACTGGGTT
CACGCTCCTACTGGATACAAAGCAAATTTCTGTGCCGGTGCATGCCCCTACTTGTGGAGC
ATGGATACTCAACACGCGACCATACTCAGTCTGTATAAAAGCATGAATCCAAGAGCCTCA
TCTTCACCTTGCTGCGTGCCACATACTCTTAATCCATTAACCATCGTGTATTACAATAAA
GGGAAATTCAAAGTTACTCAGCTATCTGACATGATTCTTCTCTCGTGTAAATGCAGTTGA
GGCTGTAGTCTCCACCTGCTATCGTGTTTATTGTAATCAGCAGACTTGCGTCACTCCCAG
ACGAGAGGGCAAATTCAATACGCTGTTCCTTTATGAAAAAGGGATTTATAAATATATCGC
CACTGTCAAACCGCATCATGATTAAAATAGTATTATAATTTACTACAATACCTTTGCTTA
AAAATTGATGGATATTTTAGTAGTTTATAAATTACGGACTACGGAAACTGCGTGACATAC
ACCAAAAATGATGCTCAGGATTTGTAAATAGACGGGCCATATGATTCCCAATATTCCACC
TTTCCCTAATTAGATCACGTGATTAGATTATTGTATTTGATTGGCTGACAGAGAAGCTGG
CACAACATTTGATGTCTCCCAACTGCATTGAAATAAAACTTTGTCTATCGCGGTTTGAAT
CAACATTTTCAGTATGGTCAATTTCACTGTTTTCACTGCAGTTCGGAGACTAACAACAGG
TATTGTCATAATTTTTCTGTCTACCAATCAACTTACCATATTCTAATCACATGATCTAGG
TATATGAAGGCGAATTTCGAGTGTTCTGTGCGTTGCCGGATCTTCACGATCCTATTGATC
AAATTGCCAATGTAAATGTAGGTCCGTAGTTCTGTAACTGATCCGCTGTTGTCAACCATA
GTTATTTTCTTAGATATTCGTTATTAGGTTCGAGGACTGTTGTAATAAATGTAAAATAAT
TTAATGCTTATTAGGTAATATTGATAAAACTTTCTTTTTATTTTCATCTTATCATTTATT
ATATTTATCACTGCAACTGGAATGCTTTACCTTCACAATTAAAATTAGGTGCAGGTATAT
CGATTTTTTCAGCAAATTCAGTATTTTATATAACTGAACAAACCATAACTGTTCCAAATT
TCAAGTACAATGGGTTAGTTGTAGAGTTCTGTATACTTCTCAAAATTATTCCTATGGGAA
TTAGACTATTCCATGCTGGCTCCTTCACTGCAGACCATATACTGTATCATTATTTGCAAA
AGTCATTCAGACTGCTCAATGTTCCCATGTATGTTCCTTACTTCCTGCAAAAACTTTATC
AATCTGGAATTCTAACGGGATTGAAGTATAGTTGCCTGAATCGTTCGACACCTCATTGCC
AATTTCTCATGTTCCTTATGTTAAGGATACGTACTCATTCATGTTTGGAATTAGGGTAAA
ATGCCCATGTGCGTGTGCCCGTGTGTTAGCTTGTCCAGCAATTATTCGACAATTAATTCA
CAGGGTAATTTTGATTAGTAATACAGTAGGGGATTTTTTTTGAATAGGTAAACCTAATGA
TTTAATAATAATTTGATAACCCAGCCCTTACTTGAATAAATATTTGTGTATTTATTGCTT
TAATATCTCTGCTTTCTCCTGTTACTTCGCCATGATAAGAATTTATGCTAGCATTTCAGT
TACAAAGTCGCTTATTGTGTTTATTAGTATTTACTCTTCATGGGATTTAAATTGGGGATA
AAATTGACCATGAGACTGAAAGTTTAAGATAATCTAGCTTGCGTCCCTTTTGTACTTATG
TACAAAAGTTTGTCTACTACAAAGTTTGTCGGGGCTTTTATTTCCTTTTGGAGACCCCAT
TCTCTTATCATTTTTGGAATTCGACTGTCATTTTCTTCTATGCTTATCAAAAACACTGTT
TGTTGGTCGACTGTATTACCGTATCTCAATGTTCATACTTATTATATTCATGTTTTGCCT
CTTTGGCGTTAGCCTATTCTGCCAGGAAACCATCAATTGATATACAGTATTCCCTTCTAC
GTACAACCTATACTAGTTGGTAGGCTCAATTTTATGGTCAGAGATACTGCTATTTGCCTC
TGTGTTTTTCTGCGTGTTTTTGTAGCAGTACCACCCGTATGCTGGGGGCAATACGGAAAT
CATATTTGATTTGTTGTTTCCTCTTGAGGCATTTGCGAATGACGTTGTTCAGAATGACGT
TATAGAAAGATATTATACACCTGTATATAAATTTATAAGCGGAATACCATGTGGTATATA
TAACCGATTCCCACCGTGAATTGCAATGCTAAGCGACCGACCTGCTTTTCATAGTTGGCT
TGTTCACAGTTTTCTCGTCGATGTTCTGTGTTTCGTCATTTATTTGTATTTATTTTTTTG
CAAATAATATTACTTTTTGACTTCTACTCTTTTCAATATTTATTCGTAATCTCCCGCTTT
TTAGCTGCAGTTAACTTTTCAACAGCATTTGAGTCATATGATTTGATATTTAAGGCATCG
CAACTTCTGGCTTTTTGCTAACAATTCACCCGA

InterProScan

PANTHER
TGF-beta-rel (IPR015615) - T[4-222] 4.3E-55
PRINTS
TGF-beta (IPR016319) - T[10-29] 2.5E-7 - T[63-75] 2.5E-7 - T[165-179] 2.5E-7 - T[202-216] 2.5E-7
Pfam
TGF-b_propeptide (IPR001111) - T[28-218] 1.9E-23

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TGFB2_HUMAN 33.333 % 99.4 2.17E-23