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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S3...'
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  4. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S1...'

Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S154.g08307.01.t

Possible name(s)

SLC10A2; SLC10A3; SLC10A5

Location

S154 [167,415 / 184,325]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 480

>Harore.CG.MTP2014.S154.g08307.01.p
GSNMFHYQALFLSLYLLNCSSKLAYGGTNTQTDANIVNDVNLLVSGNFPKVETFEDFTFN
MTLNCSKYLAIMEQLFSNKTFTKPSTFQLVLHINDSDIANFCEANGSASSYSIKCRDNTS
KVVALNAGHLGITGMWMEVLRDDNLHVKLDDVQIRVKREFTLFDKLSFFILGPLVLLNKC
AFGAKIEINVMKHIFTQPLALTLCLLMQFVAMPLLAVLYSKLFLLSQDMALALFVGAVCP
GGGGGYVISYLVGGDVTLAISASLLSTVVAMGAMPGVVGVYTYIFQIPDNIAIPYIKILL
MLLAIAIPISTGMFINYKWPKFAKKFVRIIHPLSLFLIFSGLAYLAVSSKYIIHGPVIGW
ALAVCLPMSGFILSILFARALGLSWPFSKAISLESGMKNTVLGIAVIELSYPQPEADLAS
ILIIMVTLGHTTLAMLWYFVHLMRIRCCKTTEVRFSKLTSLDADDDEDSMETARFLTSKN

Nucleotide sequence

Length: 7,926

>Harore.CG.MTP2014.S154.g08307.01.t
GTTAAATTTAACTGACCCCATCATCATGAGCGTGACGGGGTTTGATGTTGAGCTGCTCGG
CAAACCATCCCATGATAGTCTCATCAAGCTTCAGGAATATGAATTGAAATTGATGGAGGT
CATCAAAAAGACAGTAACTGCGAGAATGAAATGTGACAGAGATTATGCTCAAGCACTCCT
CAATGTGGCATCAACCGGTGGAAAAATTGAAGCACCTGCACATTTTAGTCCTATGTATAA
TGTCAAAAATCAGCCTAGCAGCTTGTCTACTTCGCAAAAATCCTTCATCTCCCACCCCAC
CAATAACTTATTACGTAATTTGCAACAGGATGTATTGCTATGCAAAATTAGTTTAGTCTG
GGTAATCATGGTCTGGCAAGAATTGATCCGTTGTACAAGCACTTTTGGTCAAGCAGTTCG
AACGCACGCAGAGCAATTGCAAACATCAACCATAGATAAAATCGCAAATCTAATCAAAGA
CAAACAGTCACTGAAAAAATCATATGCCGAACAGAGAGACAGACTCGATAATCAATTGCT
GCAGATCATTTATACTGAACTCGAGAAGAAACGTAATTACTATGTGAAGTATGAGCAAGA
AGCAAGCAATGCAAAGCGTGCCTACGATAGTTCTGTGGATAGAGGTAAATTCCATAAAAA
ATCAATATTTGACTTAAATTTAATAGAAGCAGTGCGTTACCTAAGAGCTTTAGATGAACA
TTAAACTGCATTGCTGCCTGAACTTCTTGGGAACCTGTACTACATGCAGACAGAGTCCGT
CGAAGTCTTGAGAAACATATTACTCGAATTCGTTTCTGCAACTTCTCCTTGCACAGAAGA
GATTGTATGCAACCACAGAGAAGCAGTCAACAAGATAACAGCTCTGAACCCTGACGAAGA
ATATATTGACTTCATAGAAGCTAAAAGGTCTCCGTTGGAAAATGAAGCAAACATCCAATT
CGATACAAATCTGTTGCGGAATGAATCTTTAAATCTCCCTGAAGGCCAGCTCGTACTTAA
CAGTTTAAAAGATCTTGAAACTGTTCAAGAACGTTTAAATCAGGACAGAGCATCTTTAAA
CGCTCTCCATGAAGAAATTCAACAGATTTCTGATAATCTTGGTGACCTGAGGCTTTTACA
AAAGAAGATGGAATACACAACGCTTAAGCTTCAACTTGTCGAGAATGATGTCAGTGTTAA
GAAGTTGCAGGAACAATACAGCATTACTTCAAATTGTTTGCAAGAACTCGGAGATAAGTC
ACCACCTTTAGGTCTTAATCTACCCACACTTGACAGCATGTCAGCCGGTGAACCAAGAAG
TCCGGTTAACAAGGTAAAGAAATGAGGTGGAAGCATGAGACCATCCGGACTGATTAAACA
TTTAAAACAATTGACAAACAAGACTCATGAAGATGCGAAGCCGAAAATCTTTGATCACTC
AAAAGATGTTCGCGATCAGGAGTGGTTTCATGGAATGATCTCACGCATAGAGGCAAACGG
ACTTCTTTCAAACGAAGGAGAATTTCTTCTTCGTGAAAGTAGTAATGCTCCCGGGGAACT
CGTTTTGTCGGCATTCTCTGGTAAAAAGCAAAAGCATTTCAAAGTACAAAATGTTCAGAA
CCGTTTCAAGTTTGAAGTAGAAATTCATGATACGATTGTCGGACTTATTGAAGCACATTA
TAACAAAGGAATTTACATTACAAAGAGTTCCGGTTGCCTCATAACAAAACCTGTTGTAAA
GGACAAGTGGAGTCTTAATCATACTGACTTGGAAATGGGTGAGCGTCTCGGTCGTGGGAA
CTTTGGTGACGTATTCCGAGCGCATCTCAAATCCGACAACATAGATGTGGCAGTAAAAAC
ATGCCGTGAATCAGTCGATCAGAGAACGAGGGATAAATTTTTAATGGAAGCAAAAATTCT
GAAAGGTTACGATCATCCAAACATTGTACGATTGATCGGAGTTTGCACTGAAAAGCAACC
AGTTTATATAGTTATGGAGTTGGTCACAGGTGGAGATTTGGGAAAATTTCTAAAAAAGAA
GATAAACACATTGACATCAAAGGAATTAATTAAAATGTGTCTTGATGCTTGCTCAGGGTT
GAACTATCTTGAAGAGAAGAAATGTATTCACAGGGATGTAGCTGCCAGGAATTGCCTTGT
TACTGATTCCGGTGTCGTTAAAATAACGGATTTCGGGATGTCGCGTGAAGAAGAAGACGG
AGTTTACAGTGTATCAGGAGGAATGAAGCAAATTCCAATCAAGTGGACAGCACCAGAAGC
TATGAATTATGGAACATACACTCATGCGAGTGACGTATGGAGCTTTGGAATTCTCGTCTG
GGAGATCTTCTCGTTCGGAAAAGTACCCTACCCTGGTTTAACCAATCAGCAAGCGAGGGA
GCATATCGAATATGAGAGAAGAATGGATAATCCAGATGGATGCCCAGAACGAATGTACAC
TGAGGTTATGCTGAGGTGCTGGGAGAAAGACCCACAGAGACGCCCAAGGTTTTACGAACT
TCTCAAGTCAATCAAGTCGATTAAATGTTAAACCCTGTTTGCTGTTGCATCATGGAGGTT
ACAATTTTTTGTTCATTCTGGAGCAGTGATGAGCCACCTTTTTGTGCCACTTTTTGATCA
TAATTTTCTCTAGAAATCTCTGTGTAACATCAGTAACCATAATTCATGAACCAAAAATAC
TTCTCCCTATTTTGGACAAGTTGGGCACTCACAGAATTTAGAGAAATTTGTCAAAATAAT
GACATTTTGCTGTGGAAACTCCATAAATGGTCACCATAGGTCCATAAATGTCAATTGAAA
TATTGGTAACACTCAGTTTCACCCAGAAACCCGTGCACCCCGAAAAGTCTTTGGAGCCCA
AGTTGCGCTTCACTGCTCTTTATATTATATACACTATGCTACTGAGTTCAAGACGAATCT
TAAACTGTGTGTGATAAAATTGATCGAACACTAAAGGTTGGCTGTTACCGATGTAGCTGA
ATTATTTTGTATTCTAAATATGTTTTAGCTTTGCTATGAGGAAACACATAGAAAACATTG
TTTTCCTTCCCTAGAACTGTTCTTACGGGATGTTTATTACACTTCCAGTTTCAACTTGAA
ATTTACCCATGCTTTGTTTATGCAAATCTACGGCAGCATATATGAACTTGAATGGCATTT
CGTTTTTTATCTGTCCAAAAAAGCCATTTATTGATGATCATATTATTTGGCTCAGCAAAA
ATTCTTTGCTGCTGTTCGGCTCTTCATTTTTTCATTAACTGGCTACCCTGGTACTGTTGG
CACCAATTGATTCATTATCTGCTGGTGTTTCATCACCAATGTTGATCATAGCCAAATAAT
TTAAGAATAATATGACTTCTTGGCTCAAGCTTAGGTTATAGTAATGCAGGCAGTTCTCAA
TTAACGACCACTCACACTTGTTCCTTACGAATGTTATATAGTGTTTTCATTACTCCTTCA
TGAATTTAGTTATCCAGATAATTCACGCTCACGGACTCCATTACCCGTCAGGTTACATTA
AAATATTATTTAAAGATATTTTCCAGGTCGTTAGAGAACGGATTCTGGTCGTTAAGTGAG
GAGTCTGTACTAACGTAGCATTGGAAGGGCTGTTGCCTTTCACCATGCTATGTAAAACAT
GTATCTAATAATGTAATGGCTGAATTTACAGTCACTGTGATAAAAAATAGTGGATTTTTT
TCCCTTAGCTATCGGCAAGTATGAAGCAATACATTAAGCAATAAGCAATACATATTATTA
AAGTAATAAGCACTACATTAAGAAGTGAATTTTGATTAAAGACAAATATTTAACTTACAT
TTTGTGTAGCCTGAATAGAAACATTTTTGGTTGGAATATATAGCAAACATTCGCAGTGAA
GTTCAATGCTTCCAGAATGTTAATAAATGAAGGTAAAATGAGGTAAATGTAGTATACAGA
TGCTCATTATTGTGAGCAATCCACTCACTGAATCTGATTGTGGATACATGTTGTGTTACT
AGTAAAGATTTCAAATGTAAATTCTTCATTTTATTCATTACGTATATGCAAAGCATAGTG
TGGCTGCCTTATAAATGACATAAAATACAGACAATACATATGTATTCGCTTAACTGAGAA
CAGTTTTTTAAAAATATTTGCACACCCAGATCTTGCATTTGATGCAATGCATGTCCAACA
CATTAAAAATGTCTAGCAATATCCCTGTGAGATTTATAATTTAGAATATACAGTAGTGAC
ATTCCAAAATGTAAAAAATTCTGGTCCGGGATGGATTTTGGCAACCGTTGGGGATTCTAG
CACCCTTGGTTATTGAACTGTGTTCTGGAAATGGTTTACATGCAGTTGAAAATTATGCTG
TAGTTAATTGTACAGCCTACTTGTTCAAGTTGCTGCCTTATGTGTGTTAATACTTGGCTA
AAAGCCTGTTCTTATGCATTAACTCTAGTTACTCATTTTTACATTGGTTAAGATTTTACT
GAAAATCAAACTTCTTCATTAATTTTAATGCCGCACTTTCTTCATAATCCGTAGCTTTTT
ATCTGATATTGGCTGTGTATCTGTTATTGTCTTTTTCTTTCCTATATGCAACATATTAAC
CCTCCCCCTAATCAAGATTATTTCTATTTGTAATTCTATTCCAGATTTTGTAGCCATGTG
ATGCATTTTAATTATTACCACATATCAACAATGTATGAATGTACACGTTTAGAAAATAAT
TTTTGATTTAAGATTTTCATTCTGATATTTGTATTATATCATCTCGGACAAGAAAGTTCC
TTCATCACGCTATAAATTTTTTGCTAGGATAGAGCAATCTGGCCCCTTTCAGTATCTTAT
TTTGTATGGCATTATTTTTTACACTTGCTCTAATTTGTGCGAGGCCACGAGGTCGCTGTA
TTGTTTTCAAGCACATCAAAATGTTGCTGCACACTATACCATTGTTTTTGGCACCTCAAG
CTTGTATCACCTCCCAAACACAGGATTTGTTCCATCAAAAATAATGAGATCATGCTTTTT
CGGCTTCGCTGCATGAAAGTTTGAATGCCGTGCATTGAATTTAAAATATATTTTCTCGAA
GCATCAAAAGTTAGTTGGAAAAATTAGAGAGATCATTGCTGAGGGCTGGCCATGTAACAT
ACTCTGAAAACCTTTGATTCAGAGCAATGATTTTCAAATATATTTTAAACATGTGCTTTT
GTAATCAAGTTGTAACTTTGTAATAAAAATGCTAGCATCATTATTTAGAAAATTTGGCAG
TACACCAGCAGCTGCCTTGCGACAACACAGTTTGTGGTTGATGTTTCTAATGTTACTGAT
CATTACCGCTAGATATACCGCTTATTATACAAGATAAATTTTGTGCACTTGTAGTGATCC
AAGTGCTCCAGCACTCTCAGTCTCCCAAAACTTTTGTTATCAACAGTTTGTACCTAGAGT
GATGACATCAATTGCACTCACTTACACTGCCTTGAGCTCTTAAGACAATCCACTGAAGGT
AAATGGTACGTACAAAATTCTATGTTGAATTTTAATTTGTTCTAGATACTGCAAAGTTCA
AACCTTGAGTTATAAAAATGGGCCACAAGACAAAAAATGTATGTTGGAATTTAATTTTTC
ATTTCGCAAGTGCTTGTTATCATCATATTTAGTAATAATATCTTATCATACTACTTTATT
CAAAGTGATCAAGCTAGCAATGCTCACTAGAATCACATTTTGCACAACATATGGGTTTCT
TGTGCCTACTGAAGGGACAATATACTGACATTCATGAACATTTAATTCACGCCACTGGCA
ACATCTGTGATTACAAGAATCAATACATTTATAAAATAATAATGAGCACCATTACGAAAC
AACATGAGAAATCATTGGTCTTGGTCTGAAAATCAAAATAAATTGTGCAAATTAGAAATA
AAACTCCATTCTATTCTTTTGCATAGGATATTGAGCGAGTAATGCAAAATAAATAAGGTT
CTCTATTCTACTACAGTGGCTACAGCTGAACAACATACTACAGGTATTACGAGAACTGTC
CTGAAAAGTAAGAATTTTAAAAATAAGAACATGTTTGAATTTCTCTTCGGTATTTTTGCC
ATTATTGAAGATTTGTCTTTTTGATTTTAGTCTGCAATTTGACTTCCCATACTCGATGTA
TGTTAATGGGAAATTACTAAAAAACTATTCCGAAAGTAAACTCTTAATATTACCAGAACA
CTGAACTTATTTTTGTCCACTGTCAAAAAAAAGTTAATTGATTTAAATCATGAGTAATCA
GTCAATTATCCTTTTGCCATGTTATTATTGTAAACATTCTTTTATCAATATCAATAGACC
ATAATGGTAATATCAAGTTACACATATATACTTCTTATAAAAAACTGCTATATATTCAAA
AAAATCTGTAATCTTGGAATCTCTTATAACTTGTGAAAATAGGGATAAAATTGGAACCAC
TTTCAATTTTTTGAAGTTAAAAACCGAGCAGTTTCCATCGAGTCTTCGTCGTCATCGGCG
TCCAGCGAAGTCAGTTTGGAAAACCTGACCTCAGTAGTTTTACAGCACCGGATTCTCATC
AGGTGTACGAAATACCAGAGCATAGCAAGAGTGGTGTGTCCGAGAGTGACCATAATGATG
AGAATGGATGCTAGGTCAGCTTCTGGTTGGGGATAGGACAGCTCAATAACTGCTATGCCC
AATACCGTGTTCTTCATTCCACTTTCCAAGGAAATCGCTTTGGAAAAAGGCCAGCTAAGA
CCGAGGGCCCTCGCAAATAATATGGACAGGATAAAACCGCTCATAGGGAGACACACCGCC
AGAGCCCAGCCGATGACAGGACCATGAATGATATACTTTGAAGATACAGCAAGGTACGCT
AAACCAGAGAAAATAAGAAACAGACTCAGAGGATGGATGATTCTGACAAACTTTTTAGCG
AACTTCGGCCATTTATAATTAATGAACATTCCCGTCGAAATCGGAATGGCGATTGCAAGA
AGCATTAGTAATATCTTGATGTATGGTATCGCTATGTTGTCTGGTATTTGGAAAATGTAT
GTATACACACCGACCACCCCTGGCATAGCACCCATCGCAACCACGGTTGAAAGCAAGCTG
GCGGATATGGCTAGCGTGACGTCTCCGCCCACCAAGTAACTTATGACGTAACCACCACCA
CCGCCAGGGCACACTGCACCGACAAACAATGCTAGAGCCATATCCTGGGACAGGAGGAAC
AGTTTTGAATAAAGGACGGCAAGTAAAGGCATCGCAACAAACTGCATCAATAAACAAAGG
GTCAATGCTAGCGGTTGAGTAAAAATATGCTTCATCACGTTAATTTCTATCTTGGCCCCG
AACGCACATTTGTTTAAGAGAACGAGAGGACCCAGTATGAAAAAAGATAGTTTATCAAAC
AGTGTAAATTCTCTTTTGACACGGATTTGCACGTCGTCGAGTTTTACATGTAAATTATCA
TCTCGAAGAACTTCCATCCACATCCCAGTAATTCCAAGATGTCCGGCGTTCAGGGCAACC
ACCTTGGATGTGTTGTCTCGACACTTGATCGAATATGAACTCGCAGATCCATTTGCTTCG
CAAAAATTAGCGATGTCAGAGTCGTTGATGTGAAGAACCAATTGAAAAGTCGAAGGTTTT
GTGAAAGTTTTGTTTGAAAACAGCTGCTCCATTATTGCCAGATATTTACTGCAATTTAAT
GTCATATTGAAAGTAAAGTCCTCGAAGGTTTCAACTTTCGGGAAATTTCCTGAGACGAGG
AGATTAACGTCGTTTACGATGTTTGCATCTGTCTGGGTATTGGTTCCTCCATATGCCAGT
TTTGAAGAACAATTCAATAAATAAAGAGAAAGGAATAATGCTTGGTAATGGAACATATTG
GAACCT

InterProScan

PANTHER
SLC10A3 (IPR030210) - T[153-448] 1.4E-67
PANTHER
Bilac:Na_transpt (IPR004710) - T[153-448] 1.4E-67
Pfam
BilAc:Na_symport/Acr3 (IPR002657) - T[174-349] 1.3E-24

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
NTCP2_HUMAN 30.417 % 124 1.52E-31
P3_HUMAN 37.452 % 159 2.68E-43
NTCP5_HUMAN 31.443 % 152 4.84E-41