- Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S1...'
Transcript Model
Transcript Id
Harore.CG.MTP2014.S173.g02386.01.t
Possible name(s)
CELF2; CELF5; CELF6
Gene model
Location
S173 [168,688 / 179,998]
Amino acid sequence
Length: 584
>Harore.CG.MTP2014.S173.g02386.01.p
MCIQNCLVLAILSFVLELYLFVCCGVIVTELPRTSVSPVKDPLLSQITLTKSTTDIPVRQ
FFWHCPNLHRNQDGSSIMNGNPQGPGANLPDQPDPDTIKMFVGQIPKSWDENQLRQLFEK
YGRIYQLNILREKGLNTSKGCCFVTFYSRKSALDAQNELHNIKTLPGMHHPVQVKPADSE
GRNEERKLFVGMLSKKLTESEVRALFAPSGDIEECRLLTNAEGVSKGCAFITFAKKHMAQ
NSIRNMHHSTTMEGCSAPLVVKIADTPKDKERKKMQTQVQNQMNAFTNQWKNNMTSLAML
TPLLQGLNNSNHFGNNPVQMPNLAQLSPTQIHQALAFAAAAQSILNNNQPSLGSSPVSPN
LGNPVAGSTGAPMSTLSSPHGNNNMQINPGGGNNFRAQNHNSSPLWNQNSSHSSGSSSNN
GYNNGINNGCHANNQLSHMAASLGMNSVHHDGVMGQGASMNPTSTSNVLTGLNSNSYTPS
LLQSPNSPAGSQKEGPEGANLFIYHLPSEFSDQDLMQTFMPFGTVISSKVFIDKQTNLSK
CFGFVSYDNSASAQNAIQAMNGFQIGMKRLKVQIKRSKNESKPY
Nucleotide sequence
Length: 5,114
>Harore.CG.MTP2014.S173.g02386.01.t
ATGTGTATACAGAATTGTCTAGTACTGGCAATATTAAGTTTCGTGTTAGAATTGTATTTG
TTTGTCTGTTGTGGTGTCATTGTCACCGAGCTTCCACGTACAAGCGTTAGCCCTGTTAAA
GATCCGTTATTATCTCAAATCACTCTTACGAAGAGCACCACTGATATTCCAGTCAGACAA
TTCTTTTGGCATTGCCCTAATCTTCACCGCAACCAAGACGGATCATCAATAATGAACGGA
AATCCACAAGGACCAGGTGCAAACCTACCTGACCAACCTGATCCTGATACAATCAAAATG
TTTGTTGGACAAATTCCAAAGTCCTGGGATGAGAACCAATTGCGACAGCTATTCGAAAAG
TATGGACGCATCTATCAGCTGAATATTTTACGAGAAAAGGGACTGAACACCAGTAAAGGT
TGCTGCTTTGTCACATTCTATTCTAGGAAATCTGCATTAGATGCCCAAAACGAGCTGCAC
AATATCAAAACCCTACCTGGTATGCATCATCCTGTCCAAGTGAAACCAGCTGACAGCGAG
GGTAGGAACGAAGAACGTAAGCTGTTTGTCGGGATGCTAAGTAAAAAATTGACAGAAAGT
GAAGTCAGAGCGCTGTTTGCCCCTTCTGGAGATATTGAAGAGTGTCGGCTCCTCACCAAT
GCAGAAGGAGTGAGCAAAGGTTGTGCTTTTATTACTTTTGCCAAGAAACATATGGCACAG
AACTCTATTAGGAACATGCACCATTCAACCACCATGGAGGGTTGTTCAGCACCTCTTGTC
GTCAAGATTGCTGACACACCCAAAGACAAAGAAAGAAAGAAAATGCAAACACAAGTCCAA
AATCAAATGAATGCGTTTACAAACCAATGGAAAAATAATATGACAAGCCTTGCCATGTTA
ACACCACTTCTTCAAGGTTTAAATAATTCAAATCACTTTGGAAATAATCCGGTACAGATG
CCCAACTTAGCTCAACTCTCTCCTACACAAATACATCAAGCATTAGCCTTTGCAGCAGCA
GCCCAGTCTATTCTCAATAATAATCAGCCCTCACTAGGTTCAAGCCCCGTCAGTCCCAAT
TTGGGCAACCCTGTTGCTGGTTCTACAGGTGCTCCCATGTCAACATTATCTTCGCCTCAT
GGCAATAACAACATGCAGATCAATCCTGGAGGTGGAAATAATTTTCGAGCTCAGAATCAT
AATTCTTCACCACTGTGGAATCAAAATTCATCCCACAGCAGTGGGTCTTCATCCAACAAT
GGATACAATAATGGAATAAATAACGGTTGCCATGCAAATAACCAACTGAGCCACATGGCG
GCATCACTCGGTATGAACTCTGTCCATCACGATGGCGTCATGGGTCAAGGTGCAAGTATG
AATCCTACCTCGACATCAAATGTTCTCACTGGGCTTAATTCAAACTCGTATACCCCATCG
CTCCTTCAATCACCTAATAGTCCAGCTGGAAGTCAGAAAGAAGGCCCTGAAGGTGCTAAT
CTTTTCATTTACCATCTACCATCGGAGTTCAGTGATCAGGATCTGATGCAGACTTTCATG
CCATTCGGTACAGTGATCTCTTCTAAGGTCTTCATTGATAAACAGACAAACCTAAGCAAA
TGCTTCGGTTTTGTGAGCTATGACAACTCTGCCTCAGCTCAGAATGCAATCCAGGCTATG
AACGGATTTCAAATTGGTATGAAGCGTTTGAAAGTTCAAATTAAACGTTCAAAGAATGAA
AGCAAGCCATACTGATAGGCATTGTAAAGTATCAGGTTGTTTACATTAGTTACTGTTATG
ATCTTTTTCGTCTTCTTCACGTTGTCGTCGTTCTGATCCGTTCGAAACTTCGTCAAGACA
CGGGAAGGTGCTTCTGTAGTAAGTAGCTAGCTTCCTCTTTGTGATACAACAGCCAAATGA
AAGACGCGAGCACCCTGTGCAGTTTTTGTATTGAGTATCGATGATTGTCCTTTTATGGCT
TAGATAGTTTACGCCTTTTCCGGTTACAAATGCAGAATACATGAATTGGTTTCGCGGTGA
TGAGTTACTTCTCCTGTCATTTGCTCGTCTGTGTATTTTTGGAAAAGATTTTGCTTCTAA
CTTAGACTTGTGTGTACTTTAATATATTGCATTCGTTGCTACTTCCCTTGCGGAGTTTAT
GCTGTTTAGGTGATTGTAGCTTACTGAATCCTCCTTGCCAGTAGTGTTTTGACGTTGTTC
AGCATTGTTTAAATACACCAGGTTTCGTAAGTTCCATGATATAACTACCTTGTTTTGAAG
TCCATTCGTTTTCTAAGAATGATTGAATTTTGCTGTTTAATATCCATCACCAGTGTTACT
AGTGTTCTTTTATGAACGCTTCGGTTATTCGAATTTTTAATAGGTTTATTTAACATGTTC
GAGTTTTTACTCCAACCAGTTTGTTGCAACTGAGTTGCTATTCGATGGTGATAAGCTCAG
TGATGATAGCCGTACATCTGTTGTATCAGTCAGAGCTATTGTATCAGTCAGAGCTATTTG
TGAGTCCACACTTCCTTTTCCTTATATCTGGTTTCACATCTCAGGGTAGTAAAAACGTTT
CTGTAATCTAGGTTGTTTCAAGATCACCTTGTATGCGAGATTTAAATCCTGTATTGTACG
TCATTGTCCATCCCAAGTTGATTTAATTACTGTAGTTCTTGTTCTGGAGTTTTATTTTTT
GAAGTTGATTTTCTATTTATTCTAAGTTCCCGTTCTTTCTTGTGGAAATTCTAACGACTG
CGATCCATGATAATCCGCCATACGGAACAGTATTTATTTATGATAGCCCGTCTCTGTAAA
AATCGAAATCTAGTGTGTCTATCTGTCATATCTGTACGTTTGTCCAGTTGTATTCATCAG
TTTTCCTTACACTTAATCTTTTTTAGACTACTAATTCACAGATTATATATAAATATATCT
ATATTATAGTATATCTACAATATAAATATTCTATTTTATTTCCTTAGAGAAGAATGGTGA
CGTTTTCTGCTCTGTATAGTTTTCTGACGAAATATTAACAGTTGACATGCGTTTTCAACC
GATTTCTGTAATGCTTTTTATTTATACATCGTATGATGGTTGGTGAGAGAATTCATTAGG
TCTTTTCTTGTATGTTGTTCTGTTTGTTGCATACGTCATGGTTGTTTATGTTGGGGAATC
GCCGTACTCATTCAAATACGTATCATTTATATTCCTCTTTGCTAAATTAAAGGTTGATTA
GTTGGCTGATTAAGGAGGTTGTCTATGTTTTTCTTAGCTTTCAAACTCCTAATACTAGTC
ATGGGAGATTGGCCTATTTTATGTAGGTGCAAATTTGAAGCCCTTTCGTGTTCTCTATTT
CAAGAACGGAGTTCGAAGTTCTTTTATAAGCGCCATTCACTTTTTTGTTAATGAAAAATC
AGAATGTAAGTAAATTCTGTTTAGTGAGTGCCAGAAACTTGTCTATATTCTAGTGTGATG
TATACTTGTTTATTGTATTTGTTTTCCTAGTCTTCTAAGTAGCGAGGTATGTTTGGTGGA
AGTTTTAGTTGTCTTGCCTATGTGTTGTCATATAGCAGTTGTCGATTGTCTTATCAAATA
GTTGTTGGTCTTAGTTGTTGTGTTTTCTTGTGAGATATGGTTATTACATTTGCTGTCATG
TTGCATCCATTGTGCTGTACAATCAATATTTAACTCAAACCTACCAAAAAGTCTTGACTT
TCCCTACCAACAAGAAAGATCTTCTTTCAGGGTGCATTAGAAGTCGCAACTAATTGCAGT
ATGCTCAGTTTTTTATTAATTACTTTATCTGGACATTTTTAAGGTGTGAATTGCTATTTC
TAGGTTAAGTTCACATGAATATTAACCAATCAGAGGAATCCCATCCATCTCTGACATAGC
ATACTGTTTGGTACCTGGGGTGCACCTCGTCATTCCCGGATTTTTCCTTTTAATAGAATT
GTACACATGATGAATATAGCTTGTTGACATTGAATTTTTCCAACCAAAAGAATTTCTTTG
ATTGCCTGGAAACTGGCTTCCATATGATAAGTTGACGTTTGATTGTTTTGCTTGCTGCCG
CAATCCTTAGATATAGAGGCCTAATGTGCCAGACAATCTGTGGTATTCTAACATTCTTGA
CGGATAATGAGCAAAAAAATGCAAGGTCGTTGGTGGCACCGTATAATATTGATAATATAA
CCATGAATTAATCGACTACTGTAGTTCAAAAACTCCCAAGATATAAGACATGTATGCGTT
TTTTTTCTGGGAAAATGATGTTCCAATACGATTCTGTTCGCAAACATATGTTCTGACATG
TTGAAGAGATCGTCTGCGAGGACTAAACTTATTTAAAATGAAGCATATAAGAGACGTATC
ACGCCATCATCATCAGCTATAAGTTTCGTTTGTTTTTTTATTGTTGATTAAGCCTATTTA
TTGCTGAGCATGAATGTTTATTGTGATATTTTATTATTTAATATAACAACAAAAAACATT
TTAAATTCTAACAAAAGTATTAATAATAACTAAATTGTCATTGTGCTGTACTCTATTGCT
CAACTGCCTAATTTGTTGCAAGGTTTCTGCTGTCGCAAAAAAGAAAGAACATCTGCAGTG
CTGGGAGCAGTACAACCCAATAATCGTTTGTTCGTTATCATTTTATCACGGTTTTGTTAT
GGCTTTTCTGCGGTTTCATATTTTTGATCTTATCGTAGTTGAACTTGGAGGCGATATTCC
TGTCTAACTGCTGGATTTTCTATGTTTTATTGTTTTCCAAATAAACCTGTGCACGTGGCG
ATATGAACCTCAAATTTGCTCACATCCTATCTACTCTCGCAAATTATTTTGCTATAGGTT
CGGATTGAAATTTATATTCAATACATCTCATTACAGATACCCTCTAGAATAGACTTATAA
TTGGCTGGCAGGATTGAATTAGGGTGCATAGCCCATGACAACAATCTTCTTAAGGGTATA
ACATGGAACAAATATATCTGCAAAACCATCTTCGTCTACATCGCCAACCGCAATCGCTCC
CACTGTGCCCATACATTTGAATATCGTGTTCATGGTATACATCCAGTCTTTAGGTAACTC
TGAGTCGGGCATGA
| SUPERFAMILY |
RBD_domain_sf (IPR035979) - T[72-182] 2.69E-22 - T[184-276] 5.23E-41 - T[496-580] 5.23E-41 |
| Gene3D |
Nucleotide-bd_a/b_plait_sf (IPR012677) - T[86-181] 7.3E-24 - T[182-274] 2.0E-23 - T[481-583] 7.5E-28 |
| ProSiteProfiles |
RRM_dom (IPR000504) - T[98-179] 14.522 - T[186-266] 14.283 - T[499-577] 16.739 |
| SMART |
RRM_dom (IPR000504) - T[99-175] 2.3E-18 - T[187-262] 4.7E-17 - T[500-573] 2.6E-22 |
| Pfam |
RRM_dom (IPR000504) - T[101-167] 1.8E-13 - T[188-252] 1.5E-13 - T[501-571] 9.3E-18 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| CELF2_HUMAN | 51.272 % | 456 | 4.78E-156 |
| CELF5_HUMAN | 40.31 % | 335 | 3.44E-109 |
| CELF3_HUMAN | 37.725 % | 326 | 9.99E-106 |