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  1. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S1...'

Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S1.g01439.02.t

Possible name(s)

CCDC22

Location

S1 [1,065,655 / 1,073,811]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 677

>Harore.CG.MTP2014.S1.g01439.02.p
MEEVDKIILNSLTECGCDFAENVKSVCELTTENVVEAAVRCLRIINPELKMSHALPPGMS
ARFRVGTTLAQACQTAGYRGDIGYQTFLYSSETEIRRLLMFLVEKLPRRKDENLEQTSGK
TSVLERNIAKVVKNQLANLWLPPYCKKHGIRWMGNEFSLEGAKGFHSFITEPLTIPECVG
DRTNPVPKGVLEFYRNRLPFVHKQVSCHDNLTPSLLERNSADLYLNPEQERDLASKRIRA
EDQKQKLEKVMMKYGKGTATNNVKKNSRNNLNTTVGGIATDSSFAEVIRAVSQQVTTAKD
LPDKNSLSPSDDNPQIKRNNITANRKPVRQKPALPKKPDLSVIVNHKKENSTVTPASEPA
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KVKLQEKTIGLLPNAEENIAKLKAMVETYENRMVNLTQQWDKHRVPLVEKYENLKRDTAT
KEIKSERKLKELKLVRERLKESTEEIKRKEQLEKQLTGEYGDLVKDVSRQAYTKKIFEIV
ANIRKQKEEIERALADMRALQKEINQLQGRVERTFMAADDAIFQDAKRDDCVRQAYKYLV
ALQTNCTQLLNTVEDTGGVMREIRDLEEQIATESQKNTAENLKKILADYKVMKKENIEMM
KELKSSPSPSNRRKKKS

Nucleotide sequence

Length: 4,714

>Harore.CG.MTP2014.S1.g01439.02.t
ATTTGACCGGGTGCATTTCACCTTCTGCATTGCTAGGTTGTTAGCGGTGGTGAGAGGTCC
GAAATAATATGAGAAAAAACCTTGACTTGAAATTAATGACTTGATTTTAACTACGCGTTT
GGTATGCGTGGTATCTGATTGGTTATACAATTCCAAAAAGATGGAAGAAGTTGACAAGAT
TATTCTCAATTCTCTTACGGAATGTGGATGTGATTTCGCCGAGAATGTCAAAAGCGTTTG
CGAACTAACGACTGAAAATGTTGTTGAAGCAGCGGTACGATGTCTGCGTATCATCAATCC
TGAGTTGAAGATGTCTCATGCCCTCCCTCCAGGAATGTCAGCCAGGTTTCGAGTCGGCAC
AACACTCGCTCAGGCTTGTCAGACTGCTGGATACAGAGGAGATATCGGTTACCAGACATT
TCTGTATTCGTCAGAGACAGAGATCAGGCGTCTCTTGATGTTTTTGGTCGAGAAGTTGCC
CAGAAGAAAAGATGAAAATTTGGAGCAAACTTCTGGAAAAACTTCAGTTCTGGAGAGGAA
TATAGCAAAGGTTGTCAAAAATCAACTCGCCAATTTGTGGCTGCCACCTTATTGCAAGAA
ACATGGGATTCGATGGATGGGCAATGAATTTTCACTAGAGGGAGCCAAAGGATTCCATTC
GTTTATCACAGAACCGCTCACGATTCCTGAATGTGTCGGAGACCGAACAAATCCTGTTCC
TAAAGGCGTCCTTGAATTTTATCGTAACAGATTACCGTTCGTCCATAAGCAAGTCAGTTG
CCATGACAACCTCACTCCCTCTTTATTGGAGAGGAATTCAGCCGATTTATACCTCAACCC
GGAACAAGAACGTGATCTTGCTTCAAAGAGAATTCGTGCAGAGGATCAAAAACAGAAACT
TGAGAAAGTCATGATGAAGTATGGCAAAGGAACTGCGACCAACAATGTAAAGAAGAATTC
CAGAAATAATTTAAATACAACAGTCGGAGGGATAGCGACTGATTCTTCATTTGCTGAGGT
TATCCGTGCAGTATCCCAGCAAGTGACGACTGCTAAAGATTTGCCTGATAAAAATTCACT
TTCCCCTTCTGATGACAATCCACAGATAAAGAGAAATAACATAACTGCTAATCGTAAACC
GGTACGTCAAAAGCCAGCATTGCCGAAGAAACCAGACTTGTCTGTAATCGTAAATCACAA
AAAAGAAAATTCTACTGTCACTCCGGCTAGCGAACCAGCCACAGAAGAAACAGAAGAAGA
GAAAATTAAGAGCGAAGTGAAAGATCTAAAAACTGATTTTGTGAGAGCGATTGAACAAAT
GGAGTCGATTGAAATGGAAGTGAAAAGATTTCAGGATGAGATTATTGAGGCAAAAGAAGA
ATTGCAATCTTGCGAAGAGTCGAGCAAGAAAGTGGAAGAAAAAGTGAAATTGCAGGAAAA
AACTATTGGATTGTTGCCAAATGCAGAAGAGAATATTGCTAAGCTCAAGGCAATGGTGGA
AACTTATGAAAACAGAATGGTCAATCTGACACAACAGTGGGATAAACACAGAGTTCCATT
AGTCGAAAAATATGAGAATTTGAAACGAGACACTGCAACTAAAGAGATAAAGTCGGAAAG
AAAATTAAAAGAACTAAAACTCGTCAGAGAACGATTGAAAGAAAGTACGGAAGAGATAAA
ACGAAAGGAGCAACTCGAAAAACAGCTAACTGGAGAATATGGTGACTTGGTGAAGGATGT
ATCTAGGCAAGCATACACCAAGAAGATATTCGAGATTGTGGCAAATATTCGGAAGCAAAA
GGAAGAAATCGAGCGAGCCCTTGCTGATATGAGAGCATTGCAAAAGGAGATTAATCAACT
ACAAGGAAGAGTTGAAAGAACATTTATGGCAGCGGACGATGCTATTTTCCAGGATGCAAA
AAGAGATGACTGTGTTCGACAAGCTTATAAGTATCTCGTTGCATTGCAAACTAATTGTAC
TCAACTTCTCAACACTGTTGAAGATACCGGAGGAGTCATGAGAGAAATTCGGGACTTGGA
GGAGCAGATTGCCACCGAGAGCCAGAAAAACACGGCTGAAAACTTGAAGAAGATTCTAGC
TGATTACAAAGTGATGAAAAAGGAAAATATTGAGATGATGAAAGAGCTCAAATCTTCTCC
GTCACCTAGCAACAGAAGAAAGAAAAAGAGCTAATGACATTCAAAGTGAGTCTTATCTGT
ATTGTTGTGATAATCAAATCTTATCCTATTCTGTCAGTATATAGAAACAGGGCATTGTCA
ACTATTGATTCCTCATGTTACTGCTAAGTTCATGGATATTTCTGCTAAGAGTGTGAGTAA
GTAATTATTACAAAGTGAAGGCGGTTGATTTGATGAATTCTTACCACCAATTTCTATTTC
ACACTTTGGAGTGTGAATTTGGCCAGTAACCTTGATCAATTTTTGAGTTTAGTTCATTCA
AGCATTTTATTTCAACATCCTCTCATTGTCATGAGTATTGTTATCAGTATGAATCAATGC
ATGATTCTTTTATTCTGTACTGACTATTACTGTAATTTCTCAAGAGTATCATTTTATGTC
TTCAAAATTATTTAAGTTGGGGTGCGTACTAGATATGAGAATTCGTAAAATTTTAAATAC
AAAGAGCAATAGCGAGCTGCTGTGATGTAAAACATAGCTACGTTATGTAAGAGACAGCGT
ACAGCGGTCACAATACCCTTCAAATGAGACGTTTCTCAACCTTAGCCATCTCAACTGGAG
TGCGTATTTTACTGGTAATATCAAGGNGTTAACACTCTCGATGTCAGCTATGTATTCAGC
GATACTTTGTCAGCTATCTGGACATCATAGTTAGGGTGCGTAATATAGATGAGTGCGTAT
TATATTCGGAAAATTACAATGATATATGAGCAAATGTTCCAAGTCGAAAACACCTTATCC
AAAGAATTTTTTCTTATGCTACTAATGCTTATCTGGAGGAGTTCCTGTATTTTGGGTTTG
TTTTAATTCAAAAAAACTATTAAGTGACAACTTAGTTCAGCTCACATTAAATATAAATCC
ATTATTCTAATTCATATATCCGTTAACTATGAACTACATTATGACTCGAGCCTGCTATGA
TGCCATATTCAATTGTTATCTTTATCTTAAGAAGACTATACTATCAGTTATTTAATGTTA
TTGTGCAATCTGATTTTACATTTATTCACTCTATTATTAAATTTCAGTCGAGATTGAACT
AGCATTGTAACAGGTATAACCCGAATACCTTATTTTTTCTGTCTAATATGTGTGAGATGA
GCTAACGGTATTTACGAAGGAAGTCAGTATTGAGGTATTGCTTCAATTCCACAAGCTTTT
ATGGAGCCTTAGCATGAAAGATGGAAATCTCGAAAGAAACAGTACAGTGACCAGCTGAGT
TGTTTTATTGATGTTCACATTTTAATATTTCATATACAGTATAATAACGGCAGTGAAAAA
TGTTTAAAATAAAATTAGTACTGTCATGAAATTGATAACATAATACCGACAACAAATTTG
CAGTTACAAATTAGAACAAGTAAATTGTGGAAGAATTTTTGTGTAAAATCAATTCATCAA
AAATAAAATGGAAGGAAACCTAATAACATAATTGGATAAAACAATGTATTTCATGATTCA
AATTATAAAAATGGCATCTACTGATTTGTGTAATCTATTGTAATTTAGTTTGTTGTTAAA
TTGTCAAGGCAAGACACAGGCCAGAGTCTGACATACCAAAATAAAAGTTAAAAGCTTTTA
ATTGTGGCTGAACTTTATTGCATTATTTATATTGTGATCATGATTTGAAGTATAGATTCA
ATGCCTTTTTCTTTGAAGCAAACATTTTCTGAACGTACAAAGCATCTTGTTTGTCGATAT
CCGTCGAAAACAGGAAAATGGTGAATGCTAAAGCCAAAAGAAGTCGGTCTAACGTCAAAG
ACGGAACGAGCCACAGAATTATCATTAACCCTGAGACGGTCGGATGTCGAAAGTGACTGA
ACAATGTCTGAGCTTGAGGTGTTTTCAGAGACAATGGACACCGGAGGTTGCTTGCATTGT
AATATACCTGTTTCAATCCTATGAATTCAGCAAAATCAATCATGTAGGTGACGGAGAATG
TGTGGATCCATCCAAGCAACTGCAAAACTTGGCAGACGAGTATGAAGGCCTGGCTCGAGC
TCAAGTCCCAGATCAACAAGCTCCTTTCATGTAAGGTATTGACCCAAAATGACATCATCA
CCTGAAGAGAGAGACTCGTGAATAAAACATATATTGACCGGTGCAGATAGGAAGGGATAA
ATTTGGAACAATAATGTTTGTAGGTTTCTGATGCCATAACTGCATGTTGAGTGATGAATA
ATCCAAGAAGGCCGATATCTGTACTTATGACACTTGCCAAGTCTGCTGTTTATTTTCTGT
GATAGATTCAAAATTCCGCAGGCGTTACCGGACAGGAACCCCATTAATTGACTGACTGCG
AAGCAAGTGTAGACTGCACAAAACAGGGAAAACAGTAATGAAAAAAATGAGGCTATGTTG
TGGAAGTAAGTTGCTGAGGAAGGTTTCTTTTTTGGGTTGAGGACATCCTTGTTGTTATTA
GCTTCATCATCAGAAAACTCTGCAGTAGAGGTATGGACACGAGAACGAATTTTCATATTT
TATATGTTTGTCTAATTTCTAATGTAAAAGTTCT

InterProScan

Pfam
CCDC22 (IPR008530) - T[1-636] 1.6E-188
PANTHER
CCDC22 (IPR008530) - T[1-664] 3.3E-174

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
CCD22_HUMAN 35.155 % 384 6.45E-125