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Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S221.g03677.01.t

Possible name(s)

YIPF4; YIPF5; YIPF7

Location

S221 [121,387 / 125,475]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 340

>Harore.CG.MTP2014.S221.g03677.01.p
MPCTNFLMNAFILVCYNLNLYVILTLKFQTVFLFLSISQSTKDPTRTDKSVYYSSFFNNI
CSLRMAFDQSSDGFYQTNYGHGGGQYYEQHQGYGQQGNQYEYGQPQGYGGGYGHAPMVPD
PSLSHRQGAYTGQIMHPQVSGEPLNDTYDGGFEDEPPLLEELGINFDHIWKKTLAVLNPF
TNTDSSIINETDLAGPFCFCLALGGTLLLGGKVSFGYIYGIGGLGVAALYTLLNLMAING
VSVGCVASVVGYCILPMVLLSSFSLVLSLKGLLGIILTFLTVGWCSLSASKLFVCGLNME
SQQLLIAYPCAMLYGVFALLTESACAMICVSLLLLISKLY

Nucleotide sequence

Length: 2,232

>Harore.CG.MTP2014.S221.g03677.01.t
ATGCCTTGTACTAATTTCCTTATGAATGCTTTTATACTAGTTTGCTATAATCTCAATTTG
TATGTGATCTTGACACTCAAATTTCAAACTGTTTTCCTTTTCTTATCCATTTCTCAATCT
ACCAAAGATCCAACCAGAACAGATAAATCAGTCTACTATTCTAGTTTTTTTAACAATATC
TGCTCATTAAGGATGGCGTTTGACCAATCCAGTGATGGATTTTATCAGACTAATTATGGT
CATGGTGGTGGACAGTATTACGAACAACACCAAGGATATGGCCAACAGGGTAACCAATAT
GAATATGGACAACCGCAGGGATATGGTGGCGGATATGGTCACGCACCGATGGTTCCCGAC
CCATCTCTTTCTCACCGACAGGGTGCATACACAGGACAGATAATGCACCCACAAGTTTCT
GGTGAACCTCTCAACGACACGTATGATGGTGGATTTGAAGACGAGCCACCGCTACTAGAG
GAGCTCGGAATTAATTTCGATCACATTTGGAAAAAAACTCTGGCGGTTTTGAATCCATTC
ACGAATACGGATTCCAGTATAATTAACGAAACCGATTTGGCTGGTCCATTTTGCTTTTGT
CTAGCGTTAGGAGGAACACTTTTGCTTGGAGGAAAAGTTTCATTCGGTTATATATATGGT
ATCGGTGGACTTGGAGTTGCCGCTTTATACACTCTTCTCAATCTAATGGCAATCAATGGA
GTATCAGTTGGATGCGTGGCTTCAGTAGTCGGTTATTGCATTTTACCGATGGTCCTGCTC
TCTTCTTTTTCACTTGTCCTATCATTAAAGGGTTTGCTTGGGATCATTTTGACGTTTTTA
ACAGTGGGATGGTGCAGCTTATCTGCTTCAAAACTTTTCGTATGCGGACTCAATATGGAA
TCGCAACAGTTATTGATCGCGTACCCTTGCGCTATGCTGTATGGAGTCTTTGCTCTTCTC
ACAGAAAGTGCATGTGCGATGATTTGTGTATCACTATTGTTACTGATTAGTAAACTATAT
TAAAGATCAATTTGCCAGACATGTATATCTATATATAGTTAAGAGAATGTCTAACCTTAT
ATCAAGCCTATTGTACAGTAACTATCTGTTTATAACATGCCTGGTATTATTTATTCATTG
GAATGACTCGGTTCAGTGAAGCTCTAGGTCTAGGATGTAGTGGATGGTTATTAGTTAAGA
TAATTAAGTGTGATGAAATGTAACTTTCAAATAGTATTGTTTTAACTCCTTGGGAGTACT
TCGAATGTTTAATATTACCCTGTACATTTCAGCGAGTAAAGTTGTCTTGCCATTTGCTTT
CTACCAGTAACTGTACTTCTGGTATAGCCTCGATGTATATACAGTAATTTGCTTATAGTA
GAGCATAAAAAGAGACATAGTTTTCAAAGTTGTCACTGGAGTGCATAGATTTATAGGAAG
AAATGATATCCATTGTAGGTGAAGTGAATCAGATTATCGCAAAGAAGTTGAAGTAACCTG
GATCTTTGATGGTCAATTGAATATGCATTTTACAGAATAACTCGCTTGTACTTGTAAGAA
ACTACGCTTTGCAGAGAGATTTGATAATCTTGAGGTTTAATAAGAAATACGGCCTCTATA
TACCGACTACACTTACACTCTTGCAAGTTCACACATGTGGAAATTTTTTCAACCGAAATA
TTATGAGCTATATCATCAGAGCTGTTGTACGTTTTTAGGATTTATTTCGGCTTTAGGCTT
CTGCGCTCTGATATCTGTTGATCCTACATCCTACGCTACATGATAATTTCAGAAAAGTGC
ATACGTGGTTTTTAGAATACTCTTTTTTGGTATGCGTCCAGAGTCAAAAACGTTAACCTC
CGGAATCGATCCCACAACGAATTCTTGGGTTTGGTACGAGTCCGCGCTTGCGATACTGAC
CCGACGCTTGTTTAATTGACTATCAGAGATTGTGAAAGGCTCAGAGTCTGTGCATTTTAG
ACTCCTGGTCAGTTCAGCGTAATCGATGCTGTATTTCCTTTGTCCGTTTACTCGACTAGT
TTGTCCTATGCTTCGTGCGCTGTGAATTTTGTATGCGACTTCTGCATCGGAAACCCTCCC
TTTCCATCGGGCTTTAATAGGAAGATCACCATGCAAAAAGCACTGCTCCCGTAGATCGCA
GCATTTCTCCGCCACACATCCCATTGCCACCAGCCGTGGTGGCTAGTCGATTGTTTCAGA
AGCGTGTATTTG

InterProScan

Pfam
Yip1 (IPR006977) - T[163-305] 5.5E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
YIPF5_HUMAN 54.688 % 268 2.24E-89
YIPF7_HUMAN 50.19 % 245 3.95E-80