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  1. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S1...'
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Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S2.g00392.01.t

Possible name(s)

FAM49A; FAM49B

Location

S2 [576,840 / 581,640]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 379

>Harore.CG.MTP2014.S2.g00392.01.p
RLGWKNMGNLLRVLHCKDEAYDDCFLDFEDARPCESEKVVYTRVSHVLSFAPGIVKGLEG
YKGAGVSIKEAIQNASSAESQKQAWDAIIPLVEQLKKFFEFSVNLEKCLHELLKELTSSD
QTPVQNLETKQALAKQFAEILQYTLKFDDLKMNNPSIQNDFSYFRRIMSRRGMNSASSAI
DYTEGEFVSTEIANKMSLFYAESTPMLKTLSAGTMRFVTENEDGETERTSEVLSTMCNIC
KVMLENPEHIKRFQMGEDTVHFCLRVMVGVIILYDHVHPSGAFCKGSKIDIKGAIKVLKD
QHSSQMVVNLLNALRYTTKHLKDDTTPKAIRRDLELDPVGKPSYLMRLKADRSVVSSNFL
RKDFILHLHNTVGTVSKRP

Nucleotide sequence

Length: 2,892

>Harore.CG.MTP2014.S2.g00392.01.t
AAGGTTAGGCTGGAAGAATATGGGAAATTTGCTACGTGTTCTTCACTGTAAAGATGAAGC
TTATGACGACTGTTTCCTGGATTTTGAAGATGCTCGACCTTGTGAAAGTGAAAAGGTGGT
CTATACACGGGTTTCACATGTGTTATCATTTGCACCTGGAATTGTAAAGGGCTTGGAGGG
TTATAAAGGAGCAGGAGTTTCCATCAAAGAGGCAATACAAAACGCATCTTCCGCAGAATC
ACAGAAACAAGCCTGGGATGCAATTATACCACTTGTTGAGCAGTTAAAAAAGTTTTTTGA
ATTTTCAGTTAATTTGGAAAAATGTCTCCATGAATTGTTAAAAGAATTGACGAGCTCAGA
CCAGACTCCTGTACAGAACCTTGAGACGAAACAAGCGCTTGCCAAGCAATTTGCGGAGAT
CTTGCAATACACTCTCAAGTTTGATGATCTTAAAATGAACAACCCCTCCATCCAAAATGA
TTTTTCGTACTTTCGAAGAATTATGTCAAGGCGGGGCATGAACAGTGCAAGCTCAGCGAT
AGACTACACCGAAGGAGAGTTTGTTTCCACAGAAATTGCCAATAAAATGTCTTTGTTCTA
TGCTGAATCAACTCCCATGTTGAAGACGTTAAGCGCTGGGACAATGAGGTTTGTTACAGA
GAATGAAGATGGTGAAACTGAGAGAACATCGGAAGTTCTTAGTACTATGTGCAACATCTG
CAAGGTTATGCTTGAAAACCCTGAGCATATTAAAAGATTTCAGATGGGCGAGGACACAGT
TCATTTCTGCCTACGTGTAATGGTCGGCGTCATCATCCTATACGATCACGTTCACCCGTC
GGGTGCTTTTTGTAAAGGTTCCAAAATTGATATTAAAGGTGCAATCAAAGTACTTAAGGA
TCAGCACTCCAGCCAAATGGTGGTAAACTTGTTAAATGCTCTTCGTTACACCACCAAGCA
TCTCAAAGATGACACCACTCCAAAAGCGATTCGGAGAGACCTAGAACTAGACCCCGTAGG
GAAGCCGTCTTACTTGATGAGGTTGAAAGCCGACAGATCTGTTGTCAGTTCCAATTTTTT
ACGCAAGGATTTCATACTTCATTTACACAATACTGTTGGCACTGTTAGTAAGCGACCATG
AGCAAATTTATCAGCAAGTTCCGTCAGGATATTAGTGTTATCATCACCTTATTATTGACG
TACTATAATTATGTTACACCCACATAGATTTCAAGAGGGTTGTTATCTTCCGTTTTTTGT
TTTGCTATATATAACCAGTAAACGTTGTTGTTGCCATATACCATCTTGATAATTTGAAAT
TGCCTTCAGTAATATTTCAAAAATGATAGAAAAGCATATTTTGTAGAAAACTACAATATA
TATTTCTACAGAATGGAATGAATAGGACATTGCTGCTCCCTAAACCAATATGGCATTGAA
ACAAGTAGGTTGTAACCATCTACTTCGAAAAGATAGCTAACGTATTTATATATCCTTTGC
ATAGCTTACAGTCTTTTTATCCATGGATGTGGACATACAAAAAATACTTTAGATATTTCG
ACGATAATACCGTATTCGTTTAATGCTTGTTTTTGTCATATGCCTATTGCAATCAAATTC
TGCATGAATATTCCAAATACATTTTGTATTTGGAATAATTCGTTGGACGCACATTATTCA
ATATTGCATGTACCTTTATTTACCTGGACTGCGGCCGTAAACGTGCTTGCATACAAAGTA
ACATGCCAACTTTGTAAATTGTCTATTGCTTTATCACTGTATTTGGCAACATTAGTAGCA
TAGAATCGGGCAGTACTCTGATCCCTTCGAATTATCCGGCAAGCTTTTAATTTTTGCTTT
TGTTTTTCTATTACTCAAGAAATTATTCATACTTTGCTATCTTGTCTCTTCATTGTTATT
ACTGTTATTTAAGTTTATGTGATTCATTCAACCCTGTGAGTTGCAACTTTGTTGATATTC
ACCAATGTCCAGTGGTCCGTTGATTCTTGTTCATGTATTTTTTTCATCTCGTTCTTCGCA
TACACAGTTAAAGTAAGACTAAACCCTGAAACGCAATATATGGTCCGGGCGCTGTATAAT
TAAAAAGTTTAACTATAGTACAAACCCAACTCCATAATCTCAGATTTTTAAAAACATCGT
TCATACCTCTCTTGCAAGACTTTGTAGACCTTGAGTTTTTCGAGCTTTGCATATGTTGTT
CATCTGTGAGTTGTAATGTACCTTAGCCTCTGTATGGTAACAATTTCATGTTTTACCATC
CTCCAGTAGCTAATTCTTAGCTAGCTATACATGGAATTGTCCCAAATCCAAGCTCCATTG
CCACAGCTAGTGCCAGCTACATGTAGGGACGAATTTCTATTTTGTATATCTTTGTCTATT
CCCAAAATTTCTGGCATGTGTCTGAACATACACATTGTTTCGTGATGATCATAATTTGGC
AGTGGCCCGCCCTCATTTTACGCAGTGCCGTCTCTTAAATATTTATTTCAAAATTGAACC
TTCGTAGCGTATGTATGTATGCCAAAATTTCATGCCATCATCAAAATATATTCAGTTTGT
TCACAGCAGTCATTTTCCAAATTTTTTTTTCTTATGTTAATCCAGTTGCTATATAGAGGT
GTTGGTTCCATATTGCAAGGGTTCTTCAGTTTGATAGAGAGGATCCAGAATCAACCTAGC
ATCAAGGCTTCTTTGCACTTTACTAATGAAACGGTTGAATTATTTTTATGACCCTATTTC
AAAATACAGGAGATTTTGTACCGTGCTGTTCTGTGTCCTTGAAGATTAAATTTTTCCGCA
AACAAATGTTCCAGACGTGATTTCTCAAAAGTAACATCAAAAGTTGTAGATGAGCTGTAT
TTTACAAGTTAG

InterProScan

Pfam
DUF1394 (IPR009828) - T[24-331] 3.0E-125

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
FA49B_HUMAN 58.912 % 377 1.15E-130
FA49A_HUMAN 57.143 % 370 3.61E-128