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Transcript Model
Transcript Id
Harore.CG.MTP2014.S427.g02154.03.t
Possible name(s)
FUBP1; FUBP3; KHSRP
Gene model
Location
S427 [63,904 / 81,357]
Amino acid sequence
Length: 678
>Harore.CG.MTP2014.S427.g02154.03.p
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LQETISKAAGNMGVGMPAGLEEPLMGAQTVIQLMIPPDKCGLIIGKGGETIKAIQQNIGV
KMMLIQDTTQNTGMDKPLRISGEPMKVEQAKQHIEQIMAQRDLQQQQQQMQRGGGGGGGG
NGGGGGRMNFPSGPQKLIPVPKPAVGVVIGKGGDMITRIQNETGTRVQFKQEEEDPNVPH
RMCTITGPHENIQKAIEKIQELIQSVRDHDNSGMGGGQGDGSRGRNRPGGSFGQWEGGPG
GMVRGRSGPGMNTVEYNVPTNKTGLVIGKGGENIRQINQQSQAHVEIQRNPPPGSDQMYK
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GPQQNGAIPQDPNKPPDSNAAAWANYYNYYQNQGQQPAAAAAAVAAAYPQQAAAAPGTVV
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QSQAQQQYSTAPAAPAQQ
Nucleotide sequence
Length: 5,399
>Harore.CG.MTP2014.S427.g02154.03.t
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AAAGCTTTAGACTGCCAGACAAACTAGTCGGTTTGGTTATAGGGAAAGGTGGCGAGAACA
TTAGTAGAATGCAGGAGCAGAGTGGGTGTCGTATACAGATATCACAAGATTGTCAAGGAG
GTGAAGACAGACCATGCACATTGACAGGAACGCCAGAAGAAATAGGTCAATGTCGTGAAA
TGTTGCAAGAGACCATCAGTAAAGCAGCCGGTAATATGGGTGTCGGCATGCCCGCAGGCT
TAGAGGAACCATTGATGGGAGCGCAGACCGTCATACAGCTCATGATTCCTCCTGATAAAT
GCGGGTTGATCATCGGCAAAGGAGGAGAAACTATTAAAGCGATCCAGCAGAACATCGGAG
TGAAAATGATGTTGATTCAAGACACCACACAGAATACTGGGATGGATAAACCGCTGAGAA
TTAGCGGAGAACCTATGAAAGTTGAGCAAGCCAAACAGCATATCGAACAGATCATGGCTC
AGCGTGATTTGCAGCAACAGCAACAACAGATGCAGAGAGGTGGAGGAGGTGGTGGTGGTG
GCAACGGCGGAGGTGGAGGAAGAATGAATTTTCCCTCTGGACCCCAGAAACTGATCCCCG
TTCCTAAACCTGCAGTCGGAGTCGTCATCGGTAAAGGTGGAGACATGATAACTCGGATCC
AGAATGAAACTGGAACGAGGGTGCAGTTTAAACAGGAGGAAGAAGATCCAAATGTTCCTC
ACCGTATGTGTACAATCACCGGTCCGCATGAAAATATCCAGAAAGCGATCGAAAAAATTC
AAGAACTCATCCAGAGCGTTCGTGATCATGATAATTCAGGGATGGGAGGCGGTCAAGGTG
ACGGTTCCAGAGGTCGCAACCGTCCCGGTGGCAGTTTCGGACAGTGGGAAGGAGGGCCAG
GTGGCATGGTGCGCGGTCGATCTGGACCCGGGATGAACACTGTTGAATATAATGTGCCGA
CAAACAAGACTGGTCTCGTGATTGGAAAAGGTGGTGAAAATATCCGTCAAATTAATCAAC
AATCTCAAGCTCATGTTGAAATACAAAGAAATCCGCCACCAGGAAGCGATCAAATGTATA
AGACATTTATTATCAAAGGTACACCGGAACAGATTGCACTAGCTCAACAACTTATTCAAG
AAAAAGTTGAGGGTGGTCCCGGTGGCGGTGGTAACCATGGACATGGAGGGCCAGGCCACG
TTGGTGGCATGGGTATCATGGGCCATGGTCCTCCTGGAGCTCATCATGGACCAGGGCCAG
GTGGCCCTGGAGGGTATGGACCCCCGCCCCCACAGAACAATTTTGGAGCGCCTCCGCCAG
GACCCGGCGGGTTTGGTGGACCCCCTCAAGGTCCACCACAGCAGGCTCAGCCTCCCCAGC
AATTCCAGAACCAGCAACCGTGGGCAGGTGCACCCAACCAGTATCAGTGGCCCCAGCCTG
GTGGACCCCAACAAAATGGGGCAATCCCACAGGACCCAAACAAGCCACCGGACAGCAATG
CCGCTGCATGGGCAAATTATTACAATTATTATCAAAACCAAGGTCAGCAACCTGCGGCAG
CTGCAGCAGCAGTCGCGGCGGCGTACCCACAACAGGCGGCAGCCGCACCAGGGACGGTCG
TACACACACAGACTGCTGCTGGGCAACCGGACTACACCAAAGCTTGGGAAGAGTATTACA
AGAAGCAAGCTGAAGCAGCAGCTCCAGCAGCTGTCAATCCTGCAGCTGCTTCACAGGCTG
GTGGAGCGGATTATAGTGCGGCTTGGGCAGAGTACTATCGTCAATATGCTCAGTATTATC
AACAATCGCAAGCGCAGCAACAATACTCTACAGCACCTGCAGCTCCTGCACAGCAGTAGA
TGGAAGGGGATATTTGTATCATAATAACACAACATCAGGCTAAACTAAAGATGGTTGGAG
GTGATTGGCAAACACCCGAACCAACGAGGGTATCGTCCGGTGGCCGAGGGGGGGTCCGGG
GGTTATGTTGACAGGACTTAGAACGGAACTCTTAGTAGTCTTAAGCGCGTCTGCGATAGC
TCTCGTCGTCCCGGTAACGGCGTTTTCTCGGTAACAGGTAGAGAACTATGAAATAGTCTT
TTATGTGTTCCCTGCGGGATTTTATCGGACTTCTGCGTAAGCCGTGCAATAGATGTAGGA
AATGACGTAAGTATGAAAGTGAACACTCAAATTGAAGTACACTTTGTTTTTAGCCTGTTC
TGTGCTGTAATATAATGTCTAGAAAGAATTTAAAACTTGCCCAGAGGTTTGTAAGGTGCT
TATTATTAATGAAATCTCGTGCTGTATGATAAGTTAAATTACGTGTATTTAGTAAGAGCT
GTGGTATCAGGTGTTTTATGTGTATTGTATTTTTTCCTTATATGCTTTGTATGAGACCAA
ATTCAGGAAATTTGAATTATTAATCCCATCACAGAAGTGAGCAAACCTGTCACATAAGCA
TTTGACAGCTTGCTAGGTAATTTTTGTGTTTTTCATTCAGCTGAAGGGCCAACCCTATTC
ATACAATTCAAATATAACTGAATTCAATGGTATTTCTTTCACAACCTCCGTGATCCCTCA
AATTATCTCCCCACTCAGCGACCTTCTTGATTAACAAAATAAACCATGTTATTCCTGCAA
TAAAATTGCGTGAGTGACAGCAAAATTGACCTTGTGTGTGACGCAGTGGTCTCATCTTTG
ACATATACTAAGGTTTGGTACTAGGCCACTACTAGATTTATAACATACCTAAAATGGGAA
TGTTTTTATGACCTGTTTGCCGGTGCTGTTACGTTTTTTTTTTATCATTTTCCCCCATGT
GCTCGATAATAATGCCTGATAACTCAGTTCTTGCAAGACCTTGTAAATATTTTGTAAATA
CTATTCTTTCCACAGTTGTAAATAACCTTGTAACTAGAGATCTTCAAGAGCTGATAATAA
TACCGCAGATTTTTTAACAGAAACGCCAGTAAAAATATGCATCATATTTTGCAATCATTA
TCTCAACTGTTAAATGTCTTGATAAAACCACTGTTCAATGCGTTTTTTACGTTATTTAAA
AACTTTCGATGCCTTTTATTGAACAATTTCACGAACAATAAGTTTAAATGCAAAAATTTA
ATCGTAGTTTTAAAGTATTGTGACGTATTTTCACAATTTTGCAACACAGTTTCGTGCTTG
TCTCCTGATATGTTTTGGTATCGTATTAATGGATGAATTTTCATCTCAAGCAAGTACTAT
ATCTCAGCGTTTATATATCTATTCCAAGTTAATGATTATTATAATGAAGTTAATTGAGTC
AGGTATTTGTATATATAATTCACCTTTTTTACTCAGATAGTGTGATTATAATAATTCTAT
TTGACGGCTGGAAGAAAAGTTTTGACAACATTAGTTGGCCTAGTCTTTAAACCTCACTGG
AAGCACGTGATTCAGAAAGAAATTTGTCAAATATAGTTAATAGTCCTAACTCCTCTTTCA
GCCAATGAAATTTCGGTATTTTAACGACATCTAAGTAAAGTAGATCGATTATTGTATAAC
AATGAAAGTAGTAAATTGCATAATGATGCTTCAATGTCATCATATTATTCACGATTGTCC
ATTTCTGCTGTTACACCTCCACGGTCCAAGTAAAAATATTATACAAATCTTAATACTGCT
AATAATGGTTCTAAAGTTCAATTTACTCAGTGTTTTTAAATCTGTTTTTAAACTGTTGTT
GGTGCACAGCTGCTTCAAGTTGAAATATATTTGCTAGTCGTATACTATTAGATATAAATA
AGTATAAATTGCTCGCATGCAATTGAATATCGTTTGTTTCACTTAAGATTTTATGTGACG
TCGGCAATAACTTTTTCTTGACCTCCGATAGTATCGTAATCAAGTTCTGTCGATTTTTAT
TGGATTGATGAATTCATTTCAATTCTGCAACTGTGTTTCGCAGTTTTTGAGAAATAATGG
CGTTCACAATCGTTCGTCAGTACACCATCTTCTCGATTCACGAGAATTCCTTTGACACAA
AACAAGTACTTTGCTCCTCAGTCTCATTCAGAAATAAATAAATAATACAGAAGCTTGATG
TCATGGGCCCCAGCCTAAGCCCAGAGAAGTGTTTTGATACTGTATTATGACCAAGAATGA
ATGATGTGAATTATTTTATAACATTATGAATGAATAATCAAAATAATAACTTAATTTTGT
AGAAGTGTAACCTCGTGAGCAAAGTTAAACAAGGTGATAGTTCTTCTATTCATCATCAAA
CTACCTTTAATCATATTTTTACTCGTCACATACCTCCCAGTAACCCAGTAGCAAATGTGC
TTCAATTCATGAATTTTTGAAAGTGACTCATCAGTTCAAATTACAAATAATTGCCTTGTA
GTTTTTCATGCCAATTCTGATTATCCACTGCGTCGTAAGTTGTTCTATACAAATAGTGCT
GTATTCAGGAATGGTATTCGTTGTTATTGTATACAGAATATGGTTAATACCGCATCATCA
TTATTCCTCGACATATATCATTCGCATTGCTAGTTATTTATTGTCTTGTGTCAGCATCTT
AGGCTTCGTATCTAATCAGTAATGCTCGTTTTGCCGCCCAGTTCTGTTGTTGAATCGATA
AAATTTGCCAACCACTGTGAAACTGTTTTTCAGCTAATTTTCTACTCCAGTGTCAAGGTA
ATGTATTTTTCCTACCGAACGTTTCCATGCGAAAATTCACAAACTATTTCTACTAGCTTC
TGTCGTTTAACCCTTCTTGTTGTTCATATGCATTTGTTTATTACAGAATAATGCTTCCTT
TATTATGTGATAATTGCCACAAGTGATGAATGAACTACTCCAAGCTTCTTGAAGATCATG
GGATTCCAACGATGACCCTTAACCTTTAAACCCAGGATTTGTATATATATTTCTCTGTGT
TATGTGTATATATATATGTGTAGATTGAATTTTGTGTGCTGGGAGCTGAGCTTTCCCGTT
TTTCCTGAAATTATCTGCCGTTACTGCGCCATGTAATTATTTCTCTTCCTCGTGGAATTA
AACTTTGACCGTAATTTTTCAATGCTAAAGTTTTAAATTTTGATGAACGACTTATTTTAT
GTAACTTCAAACGCAATATCTGTCTGTTCTCCTGTTTGTTGAATGCTTAGGTTTAGTAAT
ACGATTTTTATTTTGCTTTAGTTCAAATACAGTCATTAAATAAAGCACACCAGAAAATG
| Gene3D |
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[42-131] 8.8E-25 - T[141-220] 2.2E-23 - T[249-351] 6.7E-26 - T[366-446] 1.5E-27 |
| SUPERFAMILY |
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[50-127] 1.33E-18 - T[147-245] 2.48E-17 - T[250-326] 4.82E-19 - T[369-469] 7.01E-17 |
| SMART |
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| Pfam |
KH_dom_type_1 (IPR004088) - T[59-123] 2.9E-17 - T[151-216] 9.8E-15 - T[258-321] 3.3E-16 - T[373-440] 1.7E-16 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| FUBP1_HUMAN | 45.133 % | 318 | 1.43E-99 |
| FUBP2_HUMAN | 42.92 % | 307 | 1.14E-94 |
| FUBP3_HUMAN | 36.176 % | 321 | 2.29E-101 |