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  1. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S8...'

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Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S86.g13891.01.t

Possible name(s)

GREB1; GREB1L

Location

S86 [141,122 / 157,721]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 2,197

>Harore.CG.MTP2014.S86.g13891.01.p
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AGPRVSPQNALLPPLEINDETLDVKPDVSGLGRDLMLVTSSDGQTGSSPTTSSVTSIRTS
SVPVGSKEPSGVTPFVMQSRGPPPLLLSMPQSRMSTPVTSDTSTHATNGNRFMRPRLPTM
MPQGLQLEQFKQARAEQLKHLQQFQRWQLMHHQRQGQLALPQVPLFNPLMAQPVINRNIK
SIASGSINGSNAGHSSDPATYDPHSPTSPMFRKGFCKGGKDIRLSMLQRDGTAMTPYPAD
YALVAMSVSPTCQQVPTSLGTFQPPDIPSEVMVVVAINLKCLPPQQHEMSNPLLAMCIGC
GDGTLHSFSLLASHINLRTTLPSQPASNLLGLNPLQRHARNFVLRDVKLPHVCIRGAIIP
WKTDGNGNFEIGPRVPSSLTSSQATPFPSMYASNQASQARGNLPTMVQYPSRANIPLNLQ
KQVNYKLGARNSLRPNQTSFHPRHPLNTIGTASGTHDLQNKAQPTTSGQSSIVIGSPISS
PNSSPNSVRAPCDSSVQLPSSLVQQIGIPVLVVCWEWQRGQNDNKNVHISHSYKKCFEDC
LMMIPEQTITPALSKEMCYIATVHYLSSLESFEFPTVSSLSSFFGRTRLALATTEHGQLP
IIQALALARMAAINHPEKLGLVISQVSKAHAINKCVSKLTVNCPSYHLIAHISGEEIVDF
CILVTGPASRMTLEHLLSKEEYDNSISRQLKNPECILRKLKNTLSSKTLDECITKLSSTR
CHPLTVFRTSFTPPEFLPKPSSPSTSITSTNVLNRISDTHNNKTISTSTSPGFDVLSFPS
SRKHNLTDNTLHRFHVQNYKSNRLLSPRLKSANHIADKLLSHVSTLSGDHNKLDLLRFTN
VRCSFFVPPSPVCRSEVISDLKNSGMLQELGICSNSTNPSPREFFGLLFTTESKTKYRFN
ALREHINLNSATLFVLFHLDSHLHCDSSRSSDWITSLYGELVLNCCNVLLVSCSHIPQAL
LNQNTSIASENFLLCPRLEHKSANSYSLADHCLLLPQDMQDTMTFDPIHERESAALLKNL
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SSADGITILLRVPSESIAASFYSDLTEARNKLELQEAFEIMLYSSHTIPKLSEYFLETIR
NFKKKPDDWIPETLSEIDCIPLLIIYTGQDLTTHQMPSTLKYIDLRLVTNNSDSYNQSFM
LSELSLGHIESRVSSYRKILEPVSNVNDNEISEEPQQKKMKRDEQDSSPIDAMSTDGEQR
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CLDKTNKFFDLPTHSNCDWISQARPILSDSITTDQMLEHISKWTYPTSKHPHYNSSADAG
TQWIKPTVSPRHILLVSPPQAPVSLACCLFMKEMHRKLRKLLQVEVYNYKSSKKIQPCYP
LPNSEQFPEWPNLTAVYKMNFVSMIDDPSVNLAKSQITNGIKSPKSMNDDNVPSTATCTT
GKLCSFDLTHRSCSSCRMFERLQKPVAYELSVQNCGINLNTSSDNEMPLVVKFVIPESEL
DHFIFENLENNNHALECISLSQLNECGPKTPVFSLGLSGSKHGLYNLDHTLFQNIKVEPD
SDALEIDEGTNKEPQPLHIIVIRSKDEYEYKIDWPNHIFMVLPESFDDLSMGSMKYAVQC
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YMSLGSEVYVEFASSKLAAASWALNCEKSYSGLLLYCPSVALTQNFLQQFRFTPDSTVCI
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SSHKYIITYSVKIRIHLSFSKNKTITSRNTATPHLNY

Nucleotide sequence

Length: 8,600

>Harore.CG.MTP2014.S86.g13891.01.t
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GTTCCCGTACAGGTTATAGTACCTCAAAACCCAATGGGCAGTAATCATTCTGTGCAAAAA
GGTGCTTTCGAAGAAGCTCTGCAATCCACCATCGAGTCATCGCTTAGATCAAGAGGAACC
GCACCGAGTCATGTTTTCTCAGCTCTCTATCATCGTACCCGACATTGGTCAAATGAAGGT
GCTGGACCAAGGGTATCACCTCAAAATGCTCTTCTACCTCCCCTAGAAATCAATGACGAA
ACCTTAGATGTGAAACCAGATGTTTCTGGTTTAGGTCGAGATTTGATGTTGGTTACAAGT
TCGGATGGACAAACCGGATCAAGCCCGACTACATCATCTGTGACGTCAATTCGAACATCT
TCTGTACCAGTCGGTTCTAAAGAACCGTCAGGAGTGACCCCCTTTGTAATGCAATCACGG
GGACCCCCACCCTTACTCCTGTCAATGCCGCAATCCAGGATGTCGACGCCAGTGACTAGC
GACACGTCTACTCATGCAACTAACGGGAATCGTTTTATGAGGCCAAGACTTCCAACCATG
ATGCCGCAAGGATTACAGCTAGAACAATTTAAGCAAGCAAGAGCAGAACAGCTCAAACAT
CTTCAACAGTTCCAGAGATGGCAGTTGATGCATCATCAAAGACAAGGACAGCTTGCGCTT
CCTCAAGTTCCATTGTTTAATCCACTGATGGCACAACCAGTAATAAACAGAAATATTAAA
TCAATTGCAAGTGGCTCAATTAATGGCAGTAATGCGGGGCACTCGTCAGACCCAGCTACG
TACGACCCGCACTCACCCACTTCTCCGATGTTTCGGAAAGGCTTCTGCAAAGGAGGAAAA
GATATCAGGCTGTCAATGCTGCAGAGAGATGGTACTGCGATGACACCATACCCTGCCGAT
TATGCTCTCGTTGCTATGTCAGTATCACCCACCTGTCAACAAGTGCCAACGTCGCTAGGG
ACTTTCCAACCTCCTGATATCCCGAGTGAGGTCATGGTAGTCGTAGCGATAAACCTCAAA
TGTCTTCCACCTCAACAGCATGAAATGAGTAACCCATTGCTAGCAATGTGCATCGGGTGT
GGTGATGGAACCCTTCACTCATTCTCATTGTTGGCATCTCACATCAATCTGAGGACGACT
TTGCCCTCCCAGCCTGCCAGCAATCTCTTAGGGTTGAATCCTTTGCAAAGGCATGCTCGA
AACTTTGTATTGAGGGATGTTAAACTTCCTCATGTTTGCATCCGTGGAGCAATAATACCC
TGGAAAACTGATGGTAATGGAAATTTTGAAATAGGCCCCAGAGTACCCTCCTCCCTTACA
TCATCTCAGGCCACGCCATTCCCGTCCATGTACGCTTCGAATCAGGCTTCTCAGGCCCGA
GGAAATTTACCTACGATGGTCCAATACCCTTCTCGGGCCAACATTCCTTTGAACTTGCAA
AAGCAAGTGAACTACAAACTCGGTGCAAGAAATAGCTTGCGACCCAACCAAACGTCATTT
CATCCGCGACATCCACTGAACACAATCGGGACAGCTTCTGGTACCCATGACTTACAAAAC
AAGGCACAACCTACTACCTCAGGTCAATCATCAATCGTTATAGGGAGTCCGATTTCCAGC
CCCAACAGTTCACCGAACTCGGTACGTGCTCCTTGCGATTCCTCAGTCCAGTTACCAAGC
TCGCTCGTGCAACAGATAGGCATTCCCGTACTCGTCGTGTGTTGGGAATGGCAGAGGGGA
CAGAATGATAACAAAAACGTTCACATTTCTCACAGCTATAAAAAGTGCTTCGAAGATTGC
CTGATGATGATTCCTGAACAAACCATTACACCAGCACTGAGTAAAGAAATGTGCTATATT
GCGACCGTGCACTATCTCTCTTCACTTGAAAGCTTCGAGTTCCCAACTGTTTCCTCGCTG
TCATCATTCTTTGGAAGAACGCGTCTCGCCCTGGCTACGACAGAACATGGGCAACTTCCC
ATCATACAAGCTCTTGCTCTTGCCAGAATGGCAGCTATTAATCATCCAGAAAAACTCGGT
CTTGTCATATCCCAGGTATCGAAAGCGCATGCAATAAACAAATGCGTATCGAAATTGACT
GTCAACTGTCCCAGCTATCACTTAATTGCTCACATAAGTGGTGAAGAAATAGTTGATTTC
TGCATTCTTGTTACAGGGCCTGCTTCTCGTATGACACTGGAACACTTGCTCAGTAAGGAG
GAATATGACAACAGTATTTCTCGTCAATTAAAAAATCCTGAGTGCATCCTGAGAAAATTG
AAAAACACATTATCAAGCAAAACATTAGACGAATGCATAACAAAGTTATCCTCTACCCGA
TGTCATCCTCTGACTGTTTTCCGGACCTCTTTTACACCTCCAGAATTCTTACCCAAACCG
TCCTCGCCGTCTACCTCAATAACCAGTACAAACGTACTAAATCGCATTTCGGATACTCAC
AACAACAAGACTATATCCACATCTACCTCCCCTGGTTTTGATGTTTTAAGTTTTCCGTCA
TCAAGGAAACATAACCTCACTGATAATACCTTACATAGATTTCATGTACAGAATTATAAA
TCCAACAGGCTCTTATCGCCTCGCCTCAAATCTGCAAACCACATTGCTGACAAACTACTG
AGCCATGTTTCAACCTTGTCTGGTGATCACAACAAACTCGATCTTTTACGATTTACGAAT
GTTCGATGCAGTTTCTTTGTTCCTCCTTCACCAGTTTGTAGAAGCGAAGTTATCAGCGAC
CTCAAAAATTCAGGTATGCTGCAGGAACTAGGTATCTGCAGCAATAGTACAAACCCTTCA
CCAAGAGAATTCTTTGGACTGTTGTTCACGACTGAATCAAAAACAAAGTATAGGTTCAAT
GCTTTACGAGAACACATCAACCTCAACTCTGCAACGCTGTTTGTACTTTTTCATCTCGAT
TCTCATTTGCACTGTGATTCAAGCAGGTCCTCTGATTGGATAACAAGCCTTTATGGAGAA
CTTGTGTTAAACTGCTGTAACGTTCTTCTTGTTTCTTGTTCTCACATTCCACAAGCCTTA
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AAGAGTGCCAACTCGTATTCGCTTGCCGATCACTGTCTTCTATTGCCTCAGGACATGCAA
GATACCATGACCTTCGACCCAATTCACGAAAGGGAATCTGCTGCCTTGCTCAAAAATTTG
CCCGACGTTCACTCATCTGTAGTTAATGCAAGACTCCTGCTGCGGCAGTACGTCGCTGCC
CTCGCTTCGATTATCGCTTCCCACGAAATATTTTCATCTGGTCAGAGCAGAATAGCTAAC
AACGATGGTTTGCGACGCTTGACAACACCGACAATCAATTCTATAGTGAAGGATCTTATG
TCTTCTGCCGATGGCATCACCATACTTTTGAGGGTGCCGTCTGAATCCATTGCCGCATCT
TTCTATTCTGATTTGACCGAAGCAAGGAATAAACTAGAGCTACAAGAAGCTTTTGAGATT
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AATTTTAAGAAAAAACCTGACGACTGGATACCTGAGACTTTGTCTGAAATTGACTGCATT
CCACTCTTGATAATTTACACCGGACAAGATTTGACAACTCACCAGATGCCAAGCACTCTG
AAGTACATTGATCTGCGTCTAGTAACGAACAATTCTGATTCGTACAACCAGTCGTTTATG
CTGTCTGAATTGTCTCTGGGCCACATAGAGAGTCGTGTATCCTCATATCGAAAGATTTTG
GAACCAGTTTCTAACGTGAATGATAATGAGATTTCAGAGGAACCACAACAGAAAAAAATG
AAAAGAGATGAGCAAGATTCCAGTCCGATTGACGCCATGTCGACTGATGGTGAACAGAGG
AGTAGTAATGGTGAAATCACAAATGATGTGGACAGTCAAAGCAGCTCCTCTCAAGGCGAT
GAGTCCCCCACATATGCAGAGAATGACAAAGAAGAAACTGAAGAATATCAAACAATTTCA
GATGAGCTTAAAAGACCACAAGTCATATTACCAAAATGGATGCTCTCTTATGCAGAAGGT
TGTTTGGATAAAACAAATAAATTCTTTGATCTTCCCACGCATTCCAATTGTGATTGGATA
TCGCAAGCAAGACCGATACTCAGCGATTCCATTACGACAGATCAGATGCTGGAACACATC
AGCAAATGGACGTATCCTACCTCGAAACATCCTCACTACAACTCTTCCGCTGACGCAGGG
ACACAATGGATCAAGCCCACCGTGTCACCTCGCCATATTCTACTCGTCTCCCCACCACAA
GCACCGGTGTCTTTGGCATGTTGTCTCTTCATGAAGGAAATGCATAGGAAACTGAGAAAA
TTGTTACAAGTTGAGGTATACAACTATAAGTCTTCCAAAAAGATTCAGCCTTGCTATCCC
TTGCCAAATTCTGAGCAATTTCCAGAATGGCCTAATCTAACAGCAGTCTACAAAATGAAT
TTCGTCTCTATGATTGACGATCCCTCGGTCAACCTCGCCAAAAGCCAAATCACAAATGGG
ATCAAAAGCCCGAAGTCAATGAATGATGATAATGTGCCTTCAACTGCTACCTGTACTACT
GGAAAACTGTGCTCGTTTGATCTCACTCATAGGTCTTGCAGCAGCTGCCGAATGTTTGAA
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ACAAGCAGTGACAATGAGATGCCTCTTGTAGTCAAGTTTGTCATCCCAGAATCAGAGCTT
GATCATTTCATCTTTGAAAACTTGGAAAATAACAACCATGCTCTGGAATGTATTTCATTA
TCGCAACTGAACGAATGCGGTCCAAAAACTCCAGTTTTTAGTCTGGGTTTGAGCGGTTCG
AAGCATGGTCTGTACAACCTCGACCACACACTCTTCCAGAACATCAAGGTGGAGCCAGAT
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GTCATACGAAGCAAGGACGAATACGAATACAAAATAGATTGGCCGAATCATATATTCATG
GTTTTACCAGAAAGTTTTGATGATCTTAGCATGGGTTCTATGAAATATGCTGTCCAGTGT
GTAATGCAGCATTGTGTTGAAGTTATGCAAAACAGGATGAACGTTTATGATGAAGAAGGC
AATATGGAACAGGTCTGGCCCTTCGCTTTGCTCCTGGATGATTCAGCTGTCGTATGGACG
TCCTGTAGTTCCGAGAATGTCGAACGAATGTCTCCTAGTTCCGACATCGATCCGGTTGAA
AAACGTTACTCTACCGAATGGAAAAATATCTCGCTGTTGGACGTGCTCAAGAGAATTGAG
TCTATTCCGATAGCCGATCAGTATGCGGCCATAGGCATCAGACCGTGGGCGTCCGAGATG
GATATTCCAATATGCGAGGAAGACATGAACTATCAAGTTTACAGCTCTGCGTTTTCAAAA
TGCACTCTCAACACATGCATTGCGATTAATGCCACATTGACGAAGGATGTAAAATATGAT
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CCCTTGTTTCGTTTCAACGACATGGCTGTGGCGAAAAAGGTCATTCAATCAGAAAGTAAC
AGAGAGACCGTGCTGTGTGTTGATGACAACCTTGCCTTGGTCAGCCTTGCTGATTCTGAG
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GACATAGTATTTCCCAAATCCAAATGTAACCCTAACCATCCTGTTCTTGTGATTGACCAC
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TCTTGGGCATTGAACTGTGAAAAGAGTTACAGTGGTCTCTTATTGTACTGTCCCTCGGTT
GCCTTGACGCAAAATTTCCTGCAACAATTCAGATTTACACCCGATTCGACGGTTTGCATC
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CTCTATTACTTGACTGGGACTTTAATTTTTTTTTTCGTATGCCTTAATTTTAACTGTTCA
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TATTATTATTTGTCGTGAGATCACGACCTCTTTATTATTTGGAATTTTATGTTATCTCAG
GAAATTTAACTCTATACTGACCAAAACTATAATATGCTAACCCCGTGACATACATTGTGA
ACAGTGCTTACGAGATAGGAGCTCGGCAGTCAAGTTATGTGCGACAATGCTGTTTAACGT
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GTTTTTCTTCATCTTTTATTTTTCTCGTTCTTTCTCCGGAAGTTTTGTAATGTCAACCAG
CCCTGTAACGTGTCAGGAAATGTTCCTTGGTCAGTCAGTAGCTTTGTTGCTTAATTCCTT
ACCTACTAATCGTTAGTAGCCTTTAACTCTTCATTAATATTCAGTTGCGGTTGAGAAGCG
TCAGAATAATTTTATGTTTTATTTCTATTTTGTGCATTTTGCTGGTTAAGGTATTTGGTT
ATCTGTGTTTCTATGTTTTGATTACTGATTATGATACTTGGTATCTTGCACCTTCGATCA
GAATGTTCCAAAATGAGTATGCTGTGGCAGAACGTATATACTATGCACAGATGATAGTTG
GTGTTTGTGTTATTTCAAGTAATAAGAATTTGTTCTACTAAGTAATCAGAATCAAAGGAG
TTTATCGAGGGATATCTCCTGGGTTAATAACAAAATTTTACTCTTTATCAAAGAGATACA
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CTGGAGTTGGAAGTGATTTGCTATATTCATTTTGGAACTTCTGTATCACATTTAGTCTGT
GTTGTTGGTCCTTTTTGTTTATGTGGTATTGTAATGAAATCCATGAAATGTTTATTATAT
CTCTTATGTGTATAATTAATTCCTCAGACACCATCTCTAATATAACTTTTTTTTTATTTC
AATTATGAAACCGTACTCAAAGCATCTACCTCAAAGGCAGTCGTATCCAGAATAATAAAG
TGGACTGAAACACCCAACAATTTATCTCTTTGGTTTCCATTTCAGTTATGTTGTGATGGT
GCTAGAGCTTACGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTGTAGTTTCACTTTTACCAACCCTTGACA
GTTTGCCCAATTAGTATTTTGCAATGTTATTCTCTGACCCGTCTACCTTTGTTTGCTTCA
TGTCACCTACATACTTTATGTATTTTCCCTCCATGACAAGCAAGCCTCAACACGACGATA
CCTATCAAAGCCATTTCTATTTTTTTTATGCCTACATCTTCGCTAACAAGGAAATTATTG
TTTGGTTGACATCATTGCTCATTATCACCATTTTGGATACCTATTTGTTTTCTAATCATA
ATTTGAAAACGAATTTGATTTTTTACCAATAGACGTAGTACCATGCATTGATAAGATTGT
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CTACCTATGCATTATGTAAGTTGGATTAATTTTAATTGAGAAAGAACTGCCGTGTATTGT
GTACTTAATAACAATGTTGT

InterProScan

Pfam
GREB1 (IPR028422) - T[314-1406] 5.0E-67 - T[1342-2147] 7.3E-106

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
GREB1_HUMAN 29.032 % 273 1.44E-73
GRB1L_HUMAN 30.279 % 309 1.64E-84