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  1. Transcript 'KH2012:KH.C2.36.v3.A...'
  2. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S1...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S100.g03180.01.t

Possible name(s)

ECHDC2; ECHS1; HIBCH

Location

S100 [121,461 / 129,405]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 405

>Phmamm.CG.MTP2014.S100.g03180.01.p
MLPARSIFRVQVISKHLSSPLKQRTSTVGLCMPCKLYRIPCFRSMSSKYVEDDVLFDKVG
GAGIITLNRPSALNALNLSMIQKILPKIKEWEDDPRTTMIIMKGSGDKAFCAGGDIRSIT
DEARMGNYAPGQEFFHSEYHLNYRIATCLVPYIAIIDGITMGGGVGLSVHGEHRICTERT
LFAMPETGIGLFPDVGGSHFLPRLSQHLGLYLALTGYKLKGRDVYKAGVATRMVDSTMLP
KLEKELVSMETPTQQDIIDILRKYHEECQTGRERDYLILRDREDDIKRIFCADTVEEIFQ
NLEADGSEWAKQQLDTLKKMSPTSLKVTHQQIQMGASLELDECLEMEYRIGCNCLRNNDF
QEGVRALLVDKDKNPKWNPNTLSGVTDEILNSYFTLPEGLEELEL

Nucleotide sequence

Length: 2,799

>Phmamm.CG.MTP2014.S100.g03180.01.t
GTTGAATTTGTGTTATACTACACTAATATTGCTGTAAATACTGCATTTAAACAAAACTTC
CTGCCAATGGGAGCACTATTTCAGTACCAAAGCCGACTCTTCAAGCCAGTAATTTGTTCA
ACAAGAACTTTATCAAGTAACAACAACAAACTGAACCCACATATAAAGACTTTCATAACT
TGGATTGCTGCAATTCCAGTGGCAGTGTCAGGCTTTTTGTGGTTAAGAAACAGAATCATC
AAGCGCCGTAAAGAAGAGCTAAAAAAGTTGCAACGAATGCAGAGAGCTCTGTAGAACACT
CATTGCATAGAACCATGTTACCTGCTAGGAGCATTTTTCGTGTCCAAGTGATTTCAAAGC
ATCTCTCATCACCTTTGAAGCAACGGACAAGCACTGTTGGCTTATGCATGCCATGCAAAC
TTTACAGAATACCGTGTTTTCGGAGCATGTCTTCCAAATATGTGGAGGATGATGTATTGT
TTGATAAAGTTGGAGGAGCTGGGATTATAACGCTCAATCGACCATCTGCTTTAAATGCTT
TAAACCTGAGCATGATACAAAAGATACTGCCAAAAATTAAGGAATGGGAGGATGACCCAC
GTACAACCATGATCATCATGAAGGGAAGTGGGGATAAAGCATTTTGTGCTGGAGGTGATA
TAAGGTCCATCACTGATGAGGCACGAATGGGAAACTATGCTCCTGGACAAGAATTCTTTC
ATTCTGAATACCACCTGAACTATCGCATTGCCACTTGTCTTGTTCCTTACATTGCCATTA
TTGACGGCATCACCATGGGTGGAGGAGTTGGACTCTCAGTTCATGGAGAACACAGAATTT
GCACCGAACGGACACTTTTTGCCATGCCAGAAACAGGCATCGGCTTGTTTCCGGATGTTG
GGGGCTCCCATTTCCTGCCACGACTAAGCCAACATCTTGGTCTGTACCTTGCTCTTACTG
GTTATAAGCTAAAAGGCAGAGATGTGTACAAGGCTGGTGTGGCTACCAGAATGGTGGACA
GCACTATGTTACCTAAACTGGAAAAAGAACTGGTTTCAATGGAGACCCCAACACAACAGG
ATATAATTGATATTTTGAGAAAATACCATGAGGAATGTCAAACAGGAAGGGAGCGTGATT
ACCTCATACTACGAGATCGAGAAGATGACATCAAAAGAATATTTTGTGCAGATACTGTAG
AAGAAATATTTCAGAATTTGGAGGCTGATGGTAGCGAGTGGGCGAAACAGCAGTTGGACA
CTTTAAAAAAGATGTCTCCAACCTCACTGAAAGTTACACATCAGCAAATACAAATGGGTG
CAAGTTTGGAACTGGATGAATGCTTGGAAATGGAATACAGGATCGGTTGCAATTGTTTAA
GAAACAACGACTTTCAGGAAGGTGTGCGTGCACTTTTGGTGGATAAAGACAAAAATCCAA
AATGGAACCCTAATACACTTAGTGGTGTTACAGATGAAATTTTAAACAGCTACTTTACTC
TGCCAGAAGGTCTTGAGGAACTTGAACTTTAAACTCCAATATATGTTTACCTTCAACTGT
GCCATGGTTGTACAGAGCTAAAATCCTGTTTCGAAGTTTCAAAAGTTTTCCAGAAAAAAA
TAGCATGTTAAAAAATTAAAATTGAATCTTTTATTTGAACTGACTTTAAAGGGGGGGGGG
GGGGAAAAATTAAAATTGAATTTTTGAACTGACTTTAAAGTTTGTGGACAGACTTTTTGC
AGCCAGCATTATCAGGTTTTTGAATTTCATATTAATCATTCAAAGTTGCCAGAAATCTAA
ATCAGAAAAAAATGTACATATTATTCTTCCTTGTCCAAATACCATTACCTGTGCAAAACT
GTGTTTTAGTTGACTGCATTAAGCCTGCATGCAAAACTTCCTACAAACATTGGCTAAAAG
AGCATGTTATTTTTCAAAAACAGCAACATTATTGTACTATGGCATATTGTATCTTGACTA
TACAGTACTAGTATTAGCATAAACATATATCTCTATTTCAGGTTTAAACCTGTGTTCAGT
TTTATTTTTTGTCTGCAATAAGGTGTGCATTCTATTAATCCAAGCATCAATGCAACATGC
AAAACGTTTCAGGTGATAAATGAAAGTTTGGGCTTTTTTGTTGCCATACAAGCATAAAAA
AGTGCCACTGTACATTTGTAGTGAAAAACAGCAGCAAATTTTAATAATGTAGTGCATTAT
TGTGATCCGATACAATGGCAAAAGGTACCATGTAACATAGTTGTTACACCAAACAGTAAA
AATGCATTGAAATCTTAAATTTCGTCTTTTGGATATAAAAGTAAACTTTTTGCTTTGCTA
CAATGAGCATTGAATGGCAAATAGAGTTACAATTTATAGCTTAACTATTTGATCAAAGAA
ACAGTGCATATTCTTTACACATGGTTTTGTGGAACACTACAAAAATCTACTTTGCTACAA
ATGCTTCCAGTTTTTTCTTTACCTCAAATCTTAAAGCAAAGCAGTTTCCCTTAGTCTTGG
TATACCACTTAAACCATGTTTGAAAATGTGGAGCTGTATATTGCAGCTTTTGCTTAATTC
ATGCTGGACTTCAATTGTTGCGTCATAATTGCGGTTGTTCTGAAGTTAATTTTGCTGGAA
TAAAGGTTTTCGTTCATTTGTTGTGTGTTCAAACAGTCAGGTTTGAGTGTTTACTGTTAT
TTGTTTGTTGCAATAACAGCAAAAGTTTGTCGGCAAATGCTGGACTTTTTGAAAAGTCTG
CTGGCAAATTGAAACATTAAAGAGTTTAGTAAATGTGGT

InterProScan

SUPERFAMILY
ClpP/crotonase-like_dom_sf (IPR029045) - T[51-377] 1.79E-65
Pfam
HIBYL-CoA-H (IPR032259) - T[63-394] 6.5E-134

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
ECHM_HUMAN 32 % 98.6 2.61E-23
HIBCH_HUMAN 54.519 % 394 3.36E-136