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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S77...'
  2. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S1...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S1182.g14000.01.t

Possible name(s)

RNF111; ZNRF1; ZNRF2

Location

S1182 [12,685 / 17,425]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 232

>Phmamm.CG.MTP2014.S1182.g14000.01.p
QGECFDFTTMGGKLSTPNSPTSSRSGTITERAPPPSGLAGPTSSRSASLTVGSMNRAHRR
PFLHFDPSLIVDNPETVEAVRLARANSTDAGLRIPRTNYRWLYANHLQDSDSSPEGDAGS
SRPLPPVPAHSNVSRSLPHYFFSTVRDSKCPLCGKMIPAEDVEVHFVMCLTKPRVTYNED
VVSTESGECAICLEDLEEGEPIARLPCLCIYHKTCIDQWFLKSQTCPEHPPD

Nucleotide sequence

Length: 2,499

>Phmamm.CG.MTP2014.S1182.g14000.01.t
GCAAGGAGAATGTTTTGATTTTACAACAATGGGTGGAAAATTAAGTACCCCAAATAGCCC
CACCAGCTCAAGAAGTGGAACCATTACAGAGCGGGCACCGCCCCCCTCTGGCCTGGCAGG
ACCAACTTCATCTCGATCAGCATCATTAACAGTTGGTTCAATGAACAGGGCACACCGGCG
TCCTTTTTTACATTTCGACCCATCTTTGATAGTAGACAATCCTGAAACTGTGGAAGCTGT
TCGATTGGCAAGAGCAAACTCAACTGATGCTGGTTTGAGAATTCCCAGGACAAATTATCG
ATGGCTTTATGCAAATCATTTACAAGATAGTGACAGTTCACCAGAAGGGGATGCTGGTTC
ATCGAGGCCACTACCACCAGTTCCTGCTCATTCAAATGTTTCAAGGTCACTGCCACATTA
TTTCTTCAGCACAGTTCGAGATTCAAAATGTCCCCTTTGTGGAAAGATGATTCCTGCTGA
AGATGTTGAGGTTCATTTTGTGATGTGTTTGACAAAACCAAGGGTCACATACAATGAAGA
TGTCGTTTCAACTGAATCTGGAGAATGTGCAATTTGTTTAGAAGATTTAGAAGAGGGTGA
ACCGATTGCGCGATTGCCTTGCCTTTGCATCTATCACAAAACCTGTATTGATCAATGGTT
TTTGAAGAGCCAAACCTGCCCTGAGCACCCTCCAGATTAAGCATGGAAAACTTCCTAAAT
AGAATACATCCTGCCACTGTGAAAAAATAGACAATGGACTTGTTTGAGCATTGGATTATA
TGCTAGGGTTTATATAATCACTTTGAAACTGGTGTGATGTTAAAATGACATAACATAGTG
TTTTGAATACATCCACTGTTTAAAATTGATGTTTTACAATAGTTTAGATGTTTAACTGTA
ACATAGTAGTGTAGCAGCTAATCTACAGTTTTGCAATTTGATAATCAAAATAGTTATTGT
TTAAAGTCAATAAAAATGATTCACTGAGGTTTGAGGTGATTAAAACTGTTTAACCGAATA
TGCTGATGAGTGATGTATTTTTAATGCACAAAATCATCGCGTAATGTTTCCCAATATTAA
TTTGTATACTTTTGGTTTCCATTTCTTATTAAAATGCTAAAGTGATGAGTATACATTTTG
ATTTCAAGATATTGATTTTCATTTGTTTCAACCCTATTTCACTGCAATGTAAATGTTGAA
TGATTTTCGTCCGTTGTGAATTGTAACACCATTGCTTTTTCAGTTATTGCATTTTCAAAA
ATGAGGTCTATTTATGAAATGCTCATTTACTTGTAAATGTGTTATGTGGTCATTCTCACA
AAATAACATTGATTTGTCCTGTGTTAAATGTTCCCATTTTAAAATTATGCCAACTGCAGC
AATTCGTCCAAAGTTCAAAAATTATGACAATTACTAAATGTGTTGTATTTTTGAAAAGCC
ATTAATAACTTGAGATAATGTTGTTGCAGAGATCATAAGCTAACGTCTATTTAATCCTTA
CACTACTTGGCTATTAAATTAATCTCTATTTACATACCAGTTCTAAGTTTGTAATAGCCC
AGTAAATCCCTCAGATATGCATTGAATTTGAAATATTACATATGCAAAAGTAATTATATA
TTGTAAAAGTAAACAAATGTTAAAGTTTTTTTTCAGCAATATCCATGATTCTGGCTACAA
AAGATGACAATGGGTAGTAAATGTTTTTTAATTGTAACAGCACATAATGCCAGGAACAAA
ATAATTGTAATTGCAACAAAGCTTTTTACAGTTTCTCTATGCTTTCTGACAAACTATTTT
TATTTGAAACTTTTGTTTTGTTGATGTTTTTGCATTCACATGTGTCCTATTTTTTGACCA
ATTGTTGAACTCTATTATGTTTCACACAGTCTTTCTTATTACATTGATCTCATTTTTTTT
CTGTTTTTCACTGATTTGATGTGTTTGACAGCCCAGTCATATTAATATTTGCCTGTTTTT
GTGAAACTAGCAATTTTGTGATGCCAAAACGAAACACAAAGTTGTTCACAATTTTGTTCT
ATGGTTGTCTTTTCACACTGTTTTAGATTTTAATTGTCAACCAGCATGATTTTGCAGTTT
TAGATTAGGCGAAGCATTGAAATAATGTTTTGTGCACAACGCAAATAAAAATGTTTGTGC
CAAACTTAAGTGGTTGCTTTGAAGCAATTCACAAACAATGACATACACCACAATGCTTAT
AATGGCTCAGCTTTCATGTAAACAATGTGTTATTTTGTTATACTTGCCTGACAATGTATA
CATGAACTTTATAACGGCTGTATTTTTTTCAGTCTATTTAAAGCAAACTTCCCCATTCAA
AGTTTTGATACAATTGTTTAGTTTCTTAAGCGCACCTATTTCAAAATTCACTCACACTAT
ATTATCACTTGTACCAAATTATTGCAAAACAAATTTCTTCTAATGCAATCAACTTCTGCA
TGTTATTGTATTTACAAAAGCGTCTTTACTAAACTTGAG

InterProScan

Gene3D
Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[168-228] 3.8E-15
Pfam
Znf_RING (IPR001841) - T[188-227] 1.6E-9
ProSiteProfiles
Znf_RING (IPR001841) - T[189-229] 9.952
SMART
Znf_RING (IPR001841) - T[189-229] 0.002

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
ZNRF2_HUMAN 55.039 % 141 1.01E-41
ZNRF1_HUMAN 34.052 % 136 8.61E-40