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Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S1911.g15884.01.t

Possible name(s)

MMS19

Gene model

Phmamm.CG.MTP2014.S1911.g15884

Location

S1911 [528 / 6,984]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,014

>Phmamm.CG.MTP2014.S1911.g15884.01.p
MDIFVEKYFSDSGLEREQLVSEAALNIQTGGNKILALVEALGVHLTSTDVAVRIKACELL
SAVLKKLPSAVLSASELNVIVNFLCCRLQDHYTLQPAVVDGLCWASSSTQLSNLSTEGML
KALFKEVHVQSCLQGERYKVYLLLTNIFDQHKIVCSTMGRDFLYNFIQAIDGEQDPRNLL
VIFQLATDIIKSGFNLANLAEDLFEVTSCYFPIDFNPSASNKKATITNKDLVLGLRAVLS
STRVFAKFCIPLMLEKLDSEVQGAKIDSMQTLTACLPEYAKADIEPFVSTIWKAVKREVV
HSVSEEAEKCGLQLLTQLVKSVSEWPIDEHDGRVDLYLFLSEIIDDCLSHIKEPIQDKLK
WMSVQMILACARASSDACSEVVKSVVPLILQQAFESGKEPSGVTPVRMDNAFDMLVQILI
ICKPFIFYEHPLLPFKAKLLELIKSMLVHKKSKNLQCSAVTASAALFAQKILSNDEVESM
AMLLLDILLDEHHDVSLRNDVKATVGYLATMQSHIVRRCMLPKVVEELKSIDVSCKQSQR
LKVLLECATALSGHFEIFQDVIKPLMTKVSECSLDEDHCIFLKEIMLGLKAITDCYLSDH
MYTEYMALNVCLPLLKLCVQGALSPSAPGQCCTSCEDSSSGYSQDCITLPLMQSAGTIMR
NVCQKLRPGNTANFVSSLISDLYVNNDLLAFDIKTKPTFPFLPLDASLYPLQTRTVCFLT
ASLCAFDRAVTIPNVDQLQHKLMSLAMHSPDLPTYVAAAKTFAGFINKQDQISTELLEKT
LDNVSKAFDKKQKAGAPSNKIQSMTLLIWTTKALAQRNHVRTMDFVDLIITQFGVAEIGE
MAAAGFSVLMRESEEVLNSASYAIMKMMYKQRFFLLVLLKIVNAFETMKLDNNAPQEEEN
QNRKANYLTAEMLVLIPKQVLLAQFSSLMPLLLQSLHSKVPSLLLSALSALLNLIQAVTC
IGALTLLPSPTLIPMKNSVIKSLCHMLDDHKRSVPTKAAKTRSEWCIVGTCLKV

Nucleotide sequence

Length: 3,045

>Phmamm.CG.MTP2014.S1911.g15884.01.t
ATGGACATATTTGTGGAAAAGTATTTTTCTGATTCTGGATTGGAACGGGAACAGTTGGTA
TCAGAAGCAGCACTTAATATTCAAACTGGAGGCAACAAAATTCTGGCTCTTGTTGAAGCA
CTTGGTGTCCACCTAACAAGTACAGATGTTGCTGTTCGAATCAAAGCCTGTGAACTACTA
TCAGCTGTTCTTAAAAAGTTGCCCAGTGCAGTTTTATCAGCAAGTGAGCTTAATGTTATT
GTGAATTTCCTTTGTTGCCGTTTGCAGGACCACTATACACTGCAACCAGCTGTTGTTGAT
GGCCTATGCTGGGCTAGCTCTTCTACTCAACTATCAAACTTATCTACAGAGGGTATGCTT
AAGGCATTGTTTAAAGAAGTACATGTGCAGTCGTGTTTGCAAGGCGAGAGATACAAAGTC
TATTTACTTCTGACTAACATTTTTGACCAACACAAAATAGTCTGTTCGACAATGGGCCGA
GATTTCTTGTACAATTTTATCCAAGCGATTGACGGTGAACAAGATCCAAGAAACTTGCTT
GTTATTTTCCAGTTGGCCACGGACATCATAAAAAGTGGGTTTAACTTGGCCAATTTGGCT
GAAGACCTTTTCGAAGTCACCTCTTGCTATTTTCCTATTGACTTTAACCCTTCAGCTTCA
AACAAAAAGGCCACAATAACAAACAAGGATTTGGTTCTTGGTTTAAGGGCTGTACTTTCT
TCGACAAGAGTTTTTGCTAAATTTTGCATTCCCCTGATGTTGGAAAAACTTGATTCGGAA
GTTCAAGGAGCAAAGATTGATTCAATGCAAACCTTAACTGCCTGTTTGCCAGAATATGCT
AAAGCAGACATAGAACCGTTTGTGTCTACCATATGGAAAGCCGTAAAGCGGGAAGTAGTG
CACTCCGTCTCAGAGGAGGCTGAAAAATGTGGACTTCAACTTTTAACGCAGCTTGTAAAA
AGTGTATCTGAGTGGCCAATTGATGAACATGATGGAAGAGTGGATCTTTACCTTTTTTTA
TCTGAGATCATAGATGACTGCTTGTCTCATATCAAAGAGCCAATACAGGACAAATTAAAG
TGGATGTCAGTTCAAATGATTTTAGCCTGTGCGCGAGCATCGAGCGATGCATGCAGTGAA
GTTGTCAAATCAGTTGTGCCTTTGATTTTGCAGCAAGCCTTTGAAAGTGGAAAAGAACCC
AGTGGTGTAACTCCTGTGAGAATGGACAATGCTTTTGACATGCTTGTACAGATTTTAATT
ATTTGCAAGCCATTTATTTTTTATGAACATCCTTTACTGCCTTTTAAAGCCAAGCTCTTG
GAGCTGATTAAGTCCATGCTTGTTCATAAAAAATCCAAAAATTTGCAGTGTTCTGCTGTA
ACAGCAAGTGCTGCACTTTTTGCACAGAAAATTCTCTCAAATGATGAAGTTGAAAGCATG
GCAATGTTACTTCTTGATATATTGCTGGATGAACATCACGATGTTAGTCTGCGGAATGAT
GTAAAAGCCACAGTTGGTTACCTTGCTACCATGCAGTCACATATTGTGCGCCGTTGCATG
CTTCCTAAAGTTGTGGAAGAACTGAAAAGTATTGATGTCAGTTGCAAGCAGTCACAGAGG
TTAAAAGTTTTGCTTGAGTGTGCTACAGCTCTATCAGGCCATTTCGAAATCTTCCAAGAT
GTTATCAAACCTTTAATGACAAAAGTAAGTGAATGCTCGTTAGATGAAGACCACTGTATA
TTTTTGAAAGAGATCATGTTGGGATTAAAGGCGATAACTGACTGTTACTTGTCTGACCAT
ATGTATACGGAATACATGGCTCTTAATGTTTGCCTCCCATTACTAAAACTTTGTGTGCAA
GGGGCTTTAAGTCCAAGCGCTCCTGGACAATGCTGCACCAGTTGCGAAGACAGCTCTAGT
GGCTACTCACAAGACTGTATAACATTGCCTCTTATGCAGTCAGCGGGCACAATTATGCGC
AACGTTTGCCAAAAGCTAAGGCCAGGAAACACTGCGAATTTTGTTTCAAGTTTGATTTCC
GATCTTTACGTTAACAATGACCTTTTGGCATTTGACATCAAAACAAAACCCACTTTTCCT
TTCCTGCCACTTGATGCATCGCTGTACCCATTGCAAACAAGAACTGTGTGCTTCTTGACT
GCCAGCCTTTGTGCCTTTGATCGAGCTGTAACTATACCAAACGTCGACCAGTTGCAACAC
AAGTTAATGTCGTTAGCAATGCATTCGCCTGACTTGCCAACTTACGTCGCTGCTGCCAAA
ACTTTTGCTGGGTTCATCAACAAACAGGACCAGATTTCTACGGAGCTGCTTGAGAAGACA
CTGGACAATGTATCAAAAGCTTTTGACAAGAAACAAAAAGCAGGAGCACCCAGCAACAAA
ATACAGAGTATGACTTTGTTAATTTGGACAACGAAGGCATTGGCTCAACGGAATCATGTC
AGAACCATGGATTTTGTGGATTTGATCATAACACAATTTGGTGTTGCAGAGATTGGAGAA
ATGGCTGCGGCTGGTTTTAGTGTTCTTATGAGAGAATCAGAAGAGGTTTTAAACAGCGCG
TCTTATGCCATAATGAAGATGATGTACAAACAAAGATTCTTCCTTCTTGTTTTACTGAAG
ATTGTCAACGCCTTTGAAACCATGAAATTGGACAACAACGCACCTCAAGAAGAGGAAAAT
CAAAATAGAAAAGCAAACTACCTAACTGCAGAAATGCTTGTTCTTATTCCCAAACAGGTT
TTGCTGGCACAATTCTCAAGCTTAATGCCTCTACTACTGCAGTCACTTCATTCAAAAGTT
CCTTCACTTCTTTTATCTGCTTTATCCGCCCTTTTGAACCTCATTCAGGCTGTCACATGC
ATCGGAGCTCTGACGCTTCTTCCATCACCAACACTTATTCCAATGAAAAACAGTGTTATC
AAAAGCCTCTGTCACATGCTTGATGATCACAAACGCTCAGTGCCAACAAAAGCAGCTAAA
ACTAGATCGGAATGGTGCATTGTGGGAACTTGTTTAAAAGTTTGA

InterProScan

SUPERFAMILY
ARM-type_fold (IPR016024) - T[37-990] 2.31E-15
Pfam
MMS19_C (IPR024687) - T[522-956] 1.2E-48

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
MMS19_HUMAN 31.328 % 384 7.59E-117