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Transcript Model
Transcript Id
Phmamm.CG.MTP2014.S208.g05382.01.t
Possible name(s)
AC011530.1; DMWD; WDR20
Gene model
Location
S208 [42,510 / 50,141]
Amino acid sequence
Length: 703
>Phmamm.CG.MTP2014.S208.g05382.01.p
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AQSRITGINFMEDCIITTCQDGYLQLWKRPNPRATSPSPDKPK
Nucleotide sequence
Length: 3,866
>Phmamm.CG.MTP2014.S208.g05382.01.t
TTTGGAGGGTGCAAGTAAAGACAATGATGTGAAAGTACGTTTCAACATCAGGGAGGGAAT
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GGGTCCAGCATCTACCTCAACAACTGTTAAAACCTCCATCACAAGAATTGATGATGGAGA
TGAAGATTGCGACAGAGTTTGCTTCACTGTTGGCCGAGAGCTGTTCTACTTTGGATACAA
GTCTCTTGTGCAGCCATCCCAGCACTTGGAGTTTCTCGACAAGAGAACTTACAAAGGTGT
TCAGCCCACATGTCATCACATAAACAAGTTTTCTGCATCAAATGAGACAGTGAAAGTGGC
TGTGGGTTTTACAGCTGGCCAGGTTCAAGTTATTGATGTGAAAACTAAACAGAGCCTCCA
AATTATGAATGAAGATAGGTCTGTTGAAAAGTCGAGGGTAACTTGTGTAAAGTGGCTCCC
AGAAAGTGAAAATGTTTTATTATCGGCCCATGCCAGTGGTAACATGTACACTTATGATGT
GTCACAACCATCTACCAATGCCCTGCCAATATTTCACACCCAGCCTCACATACTTGGTGA
AGGTTACACCATTTATGCCCTCAAGACAAAAACCACATCTTCCTCCACACCGTCAAATGG
AAATGGGAACAATGCCACAACCAAAAACCCACTGTTTAAGTGGATTATGGCCACAGATGG
TTCTGGCATTCATACATTTCAGTTTTCACCTTGTGGTCGCTTTGTCGCTGTGGCCATGCA
GAATGGCTACCTTCGAGTAATTAACCATTCCACCTTTGAAATGCACGGCTGCATGAAGAG
CTACTTTGGTGGATTACTTTCTTGTTCATGGAGCCCTGATGGACGCTATATAGTGACTGG
TGGTGAGGATGATCTGGTCAATGTGTGGTCATTCTGTGAGAAATGCGTTATAGCTCGTGG
CTATGGACATCGATCATGGGTTAGCGAAGTATCATTTGATCCTTTCTGTTGTTTTTATCC
AAATGACAGTGACATGAAAATGTTTTATGGTATGCCAAGTGTGGCAGACCTATATCCAAA
ACACAAAGCCCTGGCTGGACAAGACTGTGCTAATAATAACTCCTGTGAAAATGTTGACAA
CCCAACTCACAGTAGCACAGGTATGGGCGATTTCGTGCAAAGAAACAATTTTTCTGAGGA
CAGCAGACCACATTGCAATGGCGAAGTTGGTCTCATGCCTCACAGTAATATGAGGCGATT
AAGGACATATAGCAATGTTTCGAAGTTTTCAAGACTAAGTATTGGTCTTGATCCATGTTC
TCCACCCATATGCTATAGGTTTGGTTCAGTGGGCCAAGACGCTCACCTTTGCTTATGGGA
AATCGACGAAAACATTTTATTTAATTCTCGTAAAAACAGACCCACTGTCCTTACAACCAC
CCAGAAGAGAAGGCCAAGTGTGGGTAGCGGTGGGGACTGCTCTGCTGCTTATAATAGCAC
AACAGACAGTGGTTCCGAAGTACCCGTGAATGGGTCATCAAACTCTGAGTACAGCAGCAA
TGGGAGTTATGGACAGTATCACTATTACAATAATATTTCTGGTGGCAATATTGATGTTTC
CCAGTTGGTAACAACAGCCCAATCGAGTAATGCCAGTAACTCTGGTACATCTGCCACGCT
TAATCTGCAAAAAGACAAAAAGCATTCGAGACAAAATGCTTCCAATGGCGTTGCAAGCAA
GTTTGCAACACTTGGTTCCCACGAACGTAAAAACAAAGAGGGAAAAGAACACAAGCGGAA
TTTGAGCCTTCCTCATTTCAGCTTTAGAAGCACTTCAAATCAGAATGGTGGTGCTAGTAC
GAAGTATGGAATTTTGAACAAAAAGGCTCAACCACCCCAGCTGATCAAGACTCTTGGGAC
AACACTCTGTCCAAAGTTGGACGAAACCACACTGCTTGAACCCCTTGTGTGTAAAAAAAT
TGCCCAAAGTCGAATCACTGGCATTAACTTTATGGAAGACTGTATTATTACAACGTGCCA
AGATGGTTACTTACAACTATGGAAAAGACCTAACCCGCGTGCCACCTCGCCTTCACCTGA
CAAACCAAAATGAAAATGTCAAAACTAACATCCCCTGCCACATCTTTTGGAAACTTGCGA
TGAAAGTTGGTTGTTTAATGGATCCACATAGTACAAACGAATATTTTTACAAACCTCCAT
ACCGTATCATAACACATAATGTCATCCAAAGTTATAGTGATTACTGAATATATATGTTCA
ATTTAAGAACAGCGTCACATTACTTAACTATTTAACTATTACATACTGGCATGTTATGAT
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AACACATTGTAATTGTACATGACGTTTAGCTTTTCTCGCTCCGGACGAGCTGACACATTT
TGAAGTTTTGGCACTTCCCTATTTCTTAAGCTTCAATTTGAATTTTCTAAGACACTTTAT
CAATTCATTTCCGTGTAACTGTCGCCGCTCTTATTGCCTTTCCACTAATGCAATGCCAGC
GTTATGTAATGGAAAGTATTTGTGTTTCACTGTGCATGCTGTTCAAATCACTTTGATTCC
TATCAATTGCTAATAAGCTATCGTGAGGTCTTCCATAAAGGTATTTCAAGGGCTTCTTAA
GTCAATTTCGACTGGTTGATGATTTACAGCAGTACTGACTTTAGTTACCTTGCTTGTGGC
GTTGGTGATGGGATAAAATGCATGGCATCTGTTGCGTGGAACTTCTTCAAAACGCAGAAA
ACTTTTTGCCCGCAAGTTTGTGTTTAGCTCAAGTGCTTGGTCGTTGGAGAGTTTAACTTT
TTGATTGTTCACAACTAGCGGCTCAGCTCTTTTCGTGCCTTAGTTCGCCGTATTCTTTTG
CCATGTCCTGTCCAAACTCGGGCATAATTTTTCACTTTATCCTGTACAACTCGAATTCAT
ACCCATACTGACCCTTTTGGCCCCAAATTATGTACTTACAAACATCAGTAAACTTTATAA
AACTTGATTTTGCCAGGGTGCGTTGTCAAGTAAACATAATAAACCAAGAAATATAGTCTT
AAAAAATTCTTGCCAATTTGTGACAACTTTTATTCAACATTTTGGATGACGGTATCACTT
ATCAGTGTGTCCTGGTTTCACCTAATGCTTCTCTCGCAGCTAAATGCCCGACTTTGTCAC
CTAAAAGCAGTGACGATCGATGCCAACGATTTTTCTGACCTTTAACGGCCCGTTTTTTCT
TGAAGCTAACTTTCGGTGGCTGAGCCATCTTTAATTCATTTGAAAACTATTTATGAAATC
TTATATCATCGATACCTTACCTGGACAGCTTCCTCATGGGCGGACCATGTATTTCAGAAT
AGTGAACCCTTTTTCAGTTTTTTTTGGACTGGGTAAAATTGCATCTTCGTGTACGTACAC
GGAGAAATTTTCAATGAGTAAATGACAAACCCTTAACAAATTGCTTTTTTAGGTTTTAAT
TTATACAGTAATGCGTGTTACAGAAATGGGTAATTAGACCACTATTTCGTGGAAGGACCA
TTCCCTTGAACATTCAGTATGCCAACATCAAGAATACAAATACAACTTGTTATTCATTTG
CCTAGCCATTTTTCCATGCACCTGCTGATTTGCTATAATCGCTTTTACGACATGAACATC
CCCAAAACAACCTTTTTTGTTTGTCAAGCACTGTTATACATAGTTATATGTATAATAGTG
ATCGCTTTAGACAGTTTTCTTCTTTTTTGGCTACTGACCCGTGTTGAATCGTAAATGCGC
AGTGTTTTCTTTCCTTGGTTTGTTTG
| SUPERFAMILY |
WD40_repeat_dom_sf (IPR036322) - T[106-338] 2.11E-29 |
| SMART |
WD40_repeat (IPR001680) - T[135-179] 0.71 - T[227-268] 7.1 - T[271-310] 1.5E-4 - T[653-688] 17.0 |
| ProSiteProfiles |
WD40_repeat_dom (IPR017986) - T[236-334] 12.631 |
| ProSiteProfiles |
WD40_repeat (IPR001680) - T[278-310] 11.411 |
| Pfam |
WD40_repeat (IPR001680) - T[285-310] 0.0016 |
| Gene3D |
WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf (IPR015943) - T[642-695] 2.0E-5 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| WDR20_HUMAN | 37.822 % | 407 | 1.98E-134 |
| DMWD_HUMAN | 47.101 % | 266 | 1.77E-79 |