Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S438.g08727.01.t

Possible name(s)

NENF; PGRMC1; PGRMC2

Gene model

Phmamm.CG.MTP2014.S438.g08727

Location

S438 [13,032 / 15,764]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 181

>Phmamm.CG.MTP2014.S438.g08727.01.p
MGEEGGEGIFVSLVTNPINLVLLSVCAYLLYKIVRGNSTEDFGPPPNPGLPKLKQQDMTI
SELKEFDGVKNDGRILMAVNGKVFDVTRGKAFYGPDGPYGVFAGRDASRGLAQFRLDKDA
IKDEYDDISDLNAMEMESVREWEMQFSEKYDFVGKLLKPGEEPTDYSDMSDSEADKDKKK
D

Nucleotide sequence

Length: 2,217

>Phmamm.CG.MTP2014.S438.g08727.01.t
ATTTTTGTAGCTGTATAATAATAACAAAATAGTTCACATTCCATATTGCTTTTTTGTTGC
CTGTATTTGTGTCAAAACTGCGTATTGATATTTGTTTCATCCATTTGTGTCAAAAAGTAT
TAAATAATAAACAGGAAATTGTTACATGTTCTACACATAAACTTCCTAACACTGGTATTG
TTTTTTGTAACATGGTCGCTGTATGTTTTTGTGCTTCCTGATATTTTTGCAGTACATTTG
TTTATCAATTTTGGATTTTACAGTAATATCGAACAGCATTTTCATTTAGACTTCTTCTGT
CGCAAAGAGTTTTACTGCGGTCCTACAATGGGTGAAGAGGGTGGAGAAGGAATCTTTGTT
AGTCTTGTAACCAATCCTATTAATCTTGTTTTACTATCGGTCTGCGCCTATTTGCTGTAT
AAAATAGTCAGAGGCAACTCTACAGAGGACTTCGGCCCTCCCCCAAATCCTGGATTACCT
AAGCTTAAACAACAGGATATGACAATAAGTGAACTAAAGGAATTTGATGGTGTGAAAAAT
GATGGAAGAATATTAATGGCTGTCAATGGAAAAGTGTTTGATGTAACCAGAGGAAAGGCA
TTTTATGGTCCAGACGGACCATATGGTGTATTTGCCGGACGGGATGCTTCTCGTGGTTTG
GCACAGTTTAGGTTGGACAAAGATGCAATTAAAGATGAATATGATGATATAAGTGATTTA
AATGCAATGGAAATGGAAAGTGTGCGAGAATGGGAAATGCAATTTTCAGAAAAGTATGAT
TTTGTTGGCAAACTGCTGAAACCTGGAGAGGAGCCAACCGACTACTCAGATATGAGTGAT
AGCGAAGCAGACAAAGATAAAAAGAAAGATTGATGTTGCTGTACTTCCTTATCCCCCTGG
CAGATGAGCTTTGTGATCTGCCCTAAACATTGCCTTAATTATTTTAGTACACTGGGCACA
ATTGCTCTTGCTGGGAGGTAGTTGCGTTTTGATATCAAATTTGCTTCTTAAACTGCACAG
TAAGTGTACATGCATATAATTTTAAAGTCTATCGTGTATGTCATGAACCATTGCCAAAAT
GTCATGTACAGCATTTGTTTGGTTTAATCCAACATTTAGTCTGTCACTCAATAATTGCTG
CCAGTCTGTAGCGTCAAATACTCAAAAACATAAAAAGGCATTTTTGCCAGTTTCCCAAGT
TGGGAACAGGGTAATTTGCTTCTAGCTTATGGGTCATTCAACCAGGCTGTACAGTAAATT
TAGTAATAATTAATCAACAAGTGCTAGCAGAGATAACCAAATGTGCTGTTTCGCACAATT
TTTGCCACCTTGTAACTGAACTTTAGGTTCAATCACTGTGAGTAATTTGGCCCAAAGACG
CTGGTTTTGCATTTAATTTTGAAGCAGTAGCTGTTGGGCCACCACTTGCAACTTTTTGTT
TTCTTTCTGTGCGCCTGCGTTTGTTGGCCGCATCAAACTTGTTTTACCAACACCCTTTTG
CCTACTAACGTCAGCGCATGGACTTTTCCGCAAACACGGTGTTGTTTGACATCCTGTTAC
GAGCATTACACTTAACATACGGTCCTGAATATGCTTAGTCAACGTTACACTGCTAACATG
ATGTTTAAAATTCGACATTTGCGTGACGTGTCCACACATAATGACGAAACACATATGCTG
TTTGTTTAAATGTTGAAACAAGGCAGTTGTAATTGGCTGTAAAGTAATTTTTGCAACTGT
TAGTACATTTTTACGCTTGTGTGCATTTTGCTATGGTACGTGAGTGCCATTCGATACGAC
ACGAATGTGGTAAAATCGGCACTTTGGCAGAAAAGCACGTCCGATTTACGTTTTAAATCA
TCGTTCATTGTACTACCCCTTCGAATTCCAAATCGACACCTATCTAAAATCAAATCATCT
TGTTCAAATAACACCGTTATCGACATCTTGTGCAAACAGTACCCGCCGATGTATGGCGCA
TAAACAAGCTCTGTCTGTGCATTAAACAGACAAGACACCGGAAAATTGCTGCTTCAAACT
AATTCTGGCGCCATTATGTTAGCCAATTGCAATGGATTATGTCGGTTTTCACCTAGCCGG
TCTTGAAACGGAACGTCGGCATTGGCGCATTAAATTTAAGGTTATCAATCGTTTAGCTGC
CGGAATTTTGTAATCCATTCGCCGCGTCTCTAGACTTCCGTACTGTATGTATATCCT

InterProScan

Gene3D	Cyt_B5-like_heme/steroid_sf (IPR036400) - T[51-159] 6.8E-40
SUPERFAMILY	Cyt_B5-like_heme/steroid_sf (IPR036400) - T[51-157] 1.07E-26
SMART	Cyt_B5-like_heme/steroid-bd (IPR001199) - T[58-157] 4.3E-23
Pfam	Cyt_B5-like_heme/steroid-bd (IPR001199) - T[60-129] 4.7E-13

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
PGRC1_HUMAN	58.333 %	186	1.55E-60
PGRC2_HUMAN	67.188 %	191	5.59E-62