Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Transcript 'KH2012:KH.C11.501.v1...'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C9.82.v1.A...'
  3. Transcript 'Phfumi.CG.MTP2014.S6...'
  4. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S4...'
  5. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S4...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S446.g08825.01.t

Possible name(s)

GPM6A; GPM6B

Location

S446 [1,590 / 9,390]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 288

>Phmamm.CG.MTP2014.S446.g08825.01.p
MFFWSMLYFFGFIFSFEALKYSFYGIIPFMIIFTILLVCDNHRTSKALGRKRRSTSAGIC
FTSSLIAGTYILILAWIFFLAFTTLGVYYYRITMLRCSDLTERGFTPGVLSSICIDLVQL
GLIMFRNTNDPGFGKICGPGTGDTMRSFGQLQEYCDNYYSVYQCMLVCFAGCLLIIIAMI
NFLMILTSNYNNLTRKYSRPYRNDAPSSVASPSNRSTPAPASIPTRSVANSTVTGPPPYV
VPSQPRDYRDRRSSKDIELDYIIDDNSTVDRHREMDSHMGVNYYYNRR

Nucleotide sequence

Length: 2,709

>Phmamm.CG.MTP2014.S446.g08825.01.t
GGCGTTTCTTTACTTACAGAAGGTTTGGTGCCAGCATTTTACAACACCGAGAAGTAGTTT
GTTGTTAGTTAAACAGTTGTAATTTTATTTTAGACTACAGTGTAAAAAATAAGTTGTGTT
GTGTTTGCTTTGTCCTATGTTTGTTTTTGTTGTACACAAGATTTCGTTACAGCACGGACG
GTATTATAGACGGAATGTAATTTTTGTTGAAGTTAAGTGCAAATCATTTACAAGATCATA
TATATTATATAATACGGTTGTATTATATTACGGTTGTATTATATAATACGGTTGTACTTG
TACATAATCACTCATATTTTTAATTTTGACAAAAAGTTTGCAAAACAAAGTTTTAAACGT
TGCACACAATTTCTTTTCATATGTTAGTTGCCATACCATAAAAAATACTACAAAGCGAAA
TGTCCATCCATAGCCTGGATCATGATTCTGTTTTGACTGATCGTGGATACAAAGGCTATC
ACATTGACAAAACTGGTGAAGTCACTGAATTTTATGACCATCGCAGTGAAGAACCACCAC
CAAGCAGCATTGTAACAGCTCGCCAACCACTTGTCAATGGTTCAAGTGCAGTAAAATCTG
CTGCCCCTGCTAAGAGAAGAGTGAGATATCGGGATGCAGGATGTTGTGATAGCTGTGTCA
ATGGGTTGACATGGATTGGAACATTGCCATTGGCAACTGCATTTGCCTTACTTATAAGTT
GGATTGGGACAGCCATGTTTATTGGTGCTGGATGGACAGCCCTGGACGAAAGTTTGCTAC
TGTTTTCAAAATATGGACCATTTGAAGGCAATCCAGCAACAGACCCAGCTCCCCAATACA
TTTACACGGGGGGTACAGGGGACTTTACTTCAGGATTTGTTTTGATGAACAGTGAAAACT
TGGGAAATCGTGTCCCTCAAGTGTAAGTAGACTTTCCGTTCAAGGACATGTTGCGTCATG
TTTTTTTGGAGCATGTTGTATTTTTTTGGTTTTATTTTCAGTTTTGAAGCATTGAAGTAT
TCATTTTATGGCATTATTCCTTTCATGATCATTTTTACCATCTTGCTTGTTTGTGACAAT
CATCGTACTTCAAAAGCTCTTGGCAGAAAGCGCAGGAGTACCAGTGCAGGAATTTGCTTT
ACATCATCGTTAATTGCTGGTACCTACATTTTGATTTTGGCTTGGATCTTTTTTCTGGCA
TTTACAACACTTGGTGTATATTACTATCGCATCACCATGCTGAGGTGCTCAGACTTGACT
GAGAGAGGTTTTACACCTGGAGTTTTGAGCTCAATATGCATTGACTTGGTTCAACTAGGT
CTGATTATGTTCAGAAACACCAATGATCCTGGGTTTGGTAAAATTTGTGGACCTGGCACA
GGAGATACGATGAGATCATTTGGCCAACTCCAGGAATATTGTGACAATTATTACTCAGTT
TACCAATGCATGCTGGTGTGCTTTGCAGGATGTCTCCTTATCATCATTGCTATGATCAAC
TTCCTTATGATCCTCACGTCCAACTACAACAATCTGACGCGTAAATACTCAAGGCCGTAC
AGAAACGACGCACCGTCTTCCGTGGCTTCACCGTCAAACCGTAGCACCCCTGCACCGGCC
TCTATTCCCACTCGTAGTGTAGCAAATTCTACTGTTACTGGCCCGCCTCCCTACGTTGTC
CCTTCACAACCCAGAGATTACAGGGATCGCCGTTCCTCTAAGGACATAGAGCTGGATTAT
ATCATAGATGACAACAGCACAGTGGACCGTCATAGGGAAATGGATAGTCACATGGGGGTG
AACTACTACTATAACAGGCGATGAGGCTGTTGAATTGTTAGTTCCTGATGCGAGGTTGCA
GACATTGAGACACTTCAAAAAGTTGTATTTACTGTTTAATGCAGTTGGCCTATTTGTAAC
CAACAAGTCCCATACCACGGTTAAAAAAAGCATTTGTCATTTCAGTAATCTTAACTAGGG
GGGGGGGGGCGTTGTGATTACTGTTTAATGCAGTTGGCCTATTTGTAACCAACAAGTCAG
ATACCACGGTTAAAAAAAGCATTTGTCATTTCAGTAATCTTAACTAGGGGGGGGGGGGTT
TGAGGCATTTGTAATACCGTATGGCACAGTGGTACCAGCAACACAAATATATTTTTACTT
TCAGTGTTTTCATCTGCTAAGGGGGGGGGGATAGGTACAGTATTAGGGGTTTGTTACTGA
TTTGGGATGCTATATTTGCTACACAAATCTGGTAACGCCACGGTTTAAATTGAGTTAGTG
CAAATAGTCCAAGCGTTTTTCCCTTGATTTTTAACAATTTAAAACTGAAGTCGTAGTTTC
GTGTAAAACGTTTCTGTAAATTATCCGTTGCACCTTTCTCGTTACTTTTTACACATTGTT
TGAAACCCATTACCTTGCCTTGCTGAACTTGTATTACGTTTCATATTGTTTGATATTGCA
TTAGAATTGAGGCATTTGTAATACCGTATGTGATTTAGCACAGTGGTTACCAGCAACACA
AATATATTTTTACTTTCAGTGTTTTCATCTGCTAATGTACTACGCCTTTCGACTTCATAT
TGCTGTTAAAACTTTAATAATACTAGATATTATGAGTAATTTAATCGTTTTAAGGAATTT
TATCTGATTAATGAGCTAAGTGCTCAGAGGACAGGGAATCAAATAAATTGTAAAATATTT
TGTTTTCGC

InterProScan

PANTHER
Myelin_PLP (IPR001614) - T[15-196] 1.0E-30
Pfam
Myelin_PLP (IPR001614) - T[16-194] 9.6E-22

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value