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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S4...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S496.g09435.02.t

Possible name(s)

CCDC113; CCDC96

Location

S496 [57,152 / 61,605]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 286

>Phmamm.CG.MTP2014.S496.g09435.02.p
KLLRLSAEQKCDIAQRELEELREEIDKLKEEAERVLDNYRAGLEEAELRFSEIKKAVYEF
DRDICKGSVNPRTGKVVAEKVVRYFEDKLRWRDTLIEKLRLKNSTLKVQKKKLQLQLKQK
EEMGEVLHEVDFNQLKIENEQYLEKIDEKNQELLRLKLMAGNTLQVLNLYKKKLHTLTME
ADRLHNEIASRNEMLQKFDVETVTVEEEREVAEKKNIQLRRKLSDYKVPNVQEYVEKKAD
LCDLQKTVKNWERKVEIAQMALKTHKKSWHLILTQSQPGVWLPQDV

Nucleotide sequence

Length: 3,302

>Phmamm.CG.MTP2014.S496.g09435.02.t
AAACTGCTCCGCTTGTCTGCTGAACAAAAGTGTGATATTGCACAAAGAGAACTTGAGGAA
TTAAGAGAAGAAATCGATAAGCTAAAGGAAGAAGCTGAACGCGTACTTGACAACTATCGG
GCTGGTTTGGAGGAAGCTGAATTGCGTTTTAGTGAAATTAAAAAAGCTGTTTATGAATTT
GACCGGGACATCTGCAAAGGATCAGTGAATCCACGAACAGGAAAAGTTGTGGCTGAGAAA
GTTGTGAGATACTTCGAAGACAAACTGCGATGGAGGGATACCTTGATTGAAAAGTTAAGA
TTAAAAAACTCAACACTCAAGGTGCAAAAGAAAAAGCTACAGCTGCAGTTAAAGCAGAAA
GAAGAAATGGGAGAAGTTTTACATGAAGTTGATTTTAATCAGCTCAAAATTGAAAATGAG
CAGTATCTTGAAAAAATTGATGAAAAGAATCAAGAATTGTTGCGTTTAAAACTCATGGCT
GGAAACACATTGCAAGTTCTAAATCTGTACAAGAAAAAACTTCACACTTTAACAATGGAG
GCAGACCGCCTTCACAATGAAATTGCATCTCGCAATGAAATGTTACAAAAGTTTGATGTA
GAAACTGTGACTGTTGAAGAGGAACGCGAGGTGGCGGAAAAGAAAAACATTCAACTTCGG
AGAAAACTGTCTGACTACAAAGTTCCAAATGTTCAAGAATATGTGGAAAAGAAAGCAGAC
CTGTGTGACCTTCAGAAAACAGTTAAAAACTGGGAGCGAAAAGTTGAAATTGCTCAGATG
GCCTTGAAGACTCACAAAAAATCCTGGCATTTAATTTTGACACAAAGTCAACCTGGAGTG
TGGCTTCCACAAGATGTTTAACTTGTTTATATCTTCACAAACTTTTCACTGGTTGGGGGA
ATGAAGGAATCCCATAATTTATTCAAAAAAGTCAATAAAATTTTGAAAGGAATTTGATTT
GGAATTGGATGACATGCACAATATCATTGCAACAGCTTCAAACATGGTCAAAAATGCTTC
ACTAAAACGAAACCTTCAATGAAAAACAAAACCAACATACAAAACACCATTCATCAACCT
AACCCAACTTCTGAATGGGTACCAGCGATAAATAACTACAGAAATTTAGTCAGCTTCATT
TGATTTTCTTGTTACCCTTTTTCTTGGGGACCTCTTTGGGGATGGGGTAGCTTTGCCTAT
AAAAAGATATATTAATCCATAACACATCTTTAAGCACTATTAACTCAAAAGTTAAACTTA
CTCATGGCTTTTAAAGTCTCCTCTGGAATCCAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
GGGGGGGGGGGGGGGCCCATTAGCGGTTCCTGTTTCAAAGCTAGGACTATCAGCAGAAGC
CGGTTTGTTTGGGTTTATCCTCTTTCCTCTCTTCTTGCTTCCAGCAACATGATACAAACC
TAATAATCCCAAAGCTCCCAATGCCAACAACATCATGTACATAAAAAATCTAAAACATAT
GTTCAAAATTTTACAATGGAAACAATACCTTGTTAAGATTACCAAACACTATGTTAAATA
CACTTACGTTTCAGTGTCAACGCCCTCTTCATTTTCAAGTACTTGTATGGTTTGATTGTA
CACAGCATCTTTATAAATGTTATCCTCCTAAATAAAACCATTACTGTTTCACTTTTTGCC
TTAAATAAAATGTTCAAATAAATTTATCAACAAAGGTATGCTTTGTGTATTTAAAAAAAT
GGTGAAAGGGAAAAAAACACAAGGCATTTTTTAAGCAAAAATTAAATTCCTAATGTTTCC
CACACTTACAGTGTCCTTGTAATTTATATTGATCAAAAGTCCAAACGATCTCCCACCAGA
CAATTCTCCTGGTGTAAAGTCATATCGGAAAGAACCTTGTTTTCCAGCATCAATCATTTT
GTTTGGAGAACTTACTGTAAACTGTGCATGTATATATATTGATAGAATGAATGATTTACT
TGCTAATAATGATTCACTTAAAAAGCAAATACATACATTTTGGATAACATAGGAAAAATC
CTGAGGATATCGAAATGACCCATCAATGCTGGTAATGATAAAGTTGTTGGAACCAGTATT
GGAAAAATGAATGTAACCACTTTCCTTTTTGCCTGCAATCACCGATGCTGCAAACAACAA
AAACAATTTTATTACAAGGTGTATTGATTAATTTACAATTTAACAAAAAATCTTTACAAT
AACAGCAACATAACTTACGTTCAGCTCCATCATCGAATATTATAGCTGTCTCAGTTTCTT
TGTGGGCAGTTATAGGCTCAACCTCATCTTCTGCTTCACCCTAAAAAAACAATAGAAGAC
GATAAAAAATTTCAAATAACTTTAAATAAAATTCTAGGGTCGTAAAAAGCATGTAGCTGT
TTTTTCAATCAAACTGTTTGTAGCCCTATGCTTAAACAGCTGGATCATTTGTGTTAAGCA
TTTGTGAGGACTATCTTCAAACAACTAAATATGTGTAAATTAAAAAAAGGTTGAGCATTT
TTATGACCAAAGGGGTGAAACCAAACCAGCTTTAGACAAAAATGATTGTTGCTTTCGTTA
AAGAGTACCTATATTCTTAAAATAATAATATTAAATAAACCTACAATGACTCAAATGTAA
ACTCATTTTACCTATGAATATACCTTTTAAAATAAAATCCTATATTGCCACTTTTTAATT
CAACCATATTGGCCAAAATTAAATTAATATGCTTAAGTTGCATTTAATAGTTAAGTGTCT
TCTGTGTTTTTTACCCCAGCTGGATAAGCTCCATCCTCAGATTCTTCAACAACTTCACCC
TCATCCTCTTCATCTTCTACCTCACCTTCATCATCTTCAACATCAACAATATCTTCTTCT
GCCTTTGCAAGACCTTGAACAATAAACAATGGTTACCTTTGTTGTCACATTTACTTTGAC
AATGGGATCACTTATCCCTAATCCTCTAAATTTATTTTTAAACCCACTGCTGATGTTGCC
TTACGTAAGGTTACACCAAAAAGACATCAATGGAAACAGCCTGCCATATTTAAAGTCTTT
CTTCTCAACAAAGTTTAAGCAGATGTGGCAGAGAAACAATAGTTTTAACTACAAAACTTA
GTGTACATTTATAGGCAATTGAGCTTGCAGTAAATACTTCCGATAAACTTTTACCTTCAC
TTCCGAAAAGGGGCACAATCGGCAAAAGAAGGAAAAACAACAAAAATAACTTGTAAGGAA
ACTTAAACATTATTATTATTATTTGACCTATACAGTTGCGCACTAAACCGAGTCAAAAGT
TA

InterProScan

Pfam
DUF4201 (IPR025254) - T[92-263] 4.6E-48

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
CC113_HUMAN 49.064 % 244 4.55E-79