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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S7...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S799.g12027.01.t

Possible name(s)

GMDS; TGDS; UXS1

Location

S799 [38,326 / 47,282]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 400

>Phmamm.CG.MTP2014.S799.g12027.01.p
RRNFSFVLYPPVFLQFFVLIFIILIMADKRIGNGKHANGSDPMEIETKRSKKTALVTGIT
GQDGSYLAELLLQKGYEVHGIVRRASQPNTARIEHLYADRATHQEGNMHLHYGDLTDSSC
LVKIINQVKPNEIYNLGAMSHVKVSFDLAEYTADVDGVGTLRLLDAIRTCGMADKVRFYQ
ASTSEMFGKVQQIPQTETTPFYPRSPYAAAKVYAYWIVVNYREAYGMHASNGILFNHESP
RRGFNFVTRKITRSVAKIHLGLQEYVTLGNLDSKRDWGHAKDYVEGMWKMLQHDEPGDYV
LATNETHSVREFVEKSFKHVGIEIEWQGKGVNEIGVDASTGEKRVTISERYYRPTEVEFL
LGDYAKAKKTFGWEPAIKFDELVKEMVDADVALMKKNHNA

Nucleotide sequence

Length: 4,985

>Phmamm.CG.MTP2014.S799.g12027.01.t
CTAGGCGCAATTTTTCCTTTGTATTATATCCACCTGTATTTCTTCAATTTTTTGTGTTAA
TATTTATCATTCTTATAATGGCGGATAAAAGAATAGGGAATGGAAAACATGCAAATGGTT
CCGATCCTATGGAGATCGAAACAAAAAGAAGCAAAAAAACAGCATTAGTTACAGGAATTA
CTGGTCAGGATGGCTCCTATCTTGCTGAACTCTTACTTCAAAAGGGTTATGAAGTGCATG
GCATTGTACGAAGAGCAAGTCAACCTAACACTGCCCGAATTGAACACCTATATGCTGACC
GAGCTACACACCAGGAGGGAAACATGCATTTGCATTATGGGGACTTGACAGACAGCAGTT
GTCTTGTCAAGATTATCAACCAGGTAAAACCAAATGAAATCTACAACTTGGGTGCTATGA
GCCATGTTAAAGTGTCGTTTGACTTGGCTGAATATACTGCCGATGTTGATGGAGTTGGTA
CATTAAGGTTACTGGATGCTATCAGAACATGTGGAATGGCTGATAAAGTCAGATTCTATC
AAGCATCAACATCTGAAATGTTTGGAAAGGTGCAGCAGATTCCTCAGACTGAAACCACAC
CATTCTACCCCCGCTCGCCGTATGCAGCTGCCAAAGTTTATGCTTACTGGATAGTTGTCA
ATTATCGAGAAGCATATGGGATGCATGCGAGCAATGGCATTTTGTTTAACCATGAAAGCC
CAAGGAGAGGCTTCAATTTTGTAACAAGAAAAATTACAAGAAGTGTTGCAAAAATTCACC
TTGGCCTACAAGAATATGTCACTCTTGGAAACCTGGATTCAAAGAGAGATTGGGGCCATG
CAAAGGATTATGTGGAAGGCATGTGGAAAATGCTTCAGCATGATGAACCTGGAGATTACG
TTTTAGCCACAAATGAAACCCACAGTGTTCGAGAATTTGTGGAAAAATCATTCAAGCATG
TTGGAATTGAAATTGAATGGCAAGGGAAGGGAGTGAATGAGATTGGTGTTGATGCTTCAA
CTGGTGAAAAACGTGTGACGATCAGTGAGCGTTACTACCGACCTACAGAGGTTGAATTTC
TGCTTGGGGATTATGCAAAAGCCAAGAAGACGTTCGGATGGGAGCCAGCTATTAAATTTG
ATGAGCTGGTCAAAGAAATGGTAGATGCAGATGTTGCATTGATGAAGAAAAACCACAACG
CTTAAACCTTTTCAATATCCTTGCTATGCAATGTTCGTCCAAGGTCATTAAGTGACCTAA
AATTACTTAAAAATTACATGTCAGGTTTCATTTTCACTCTTCAACTTATTTTAAAGTTGT
CTTGTGTTACAAGACATTCATTTAGACACTAAAGTCTTCAAAATACCCAATTCTTCAAGG
GGTTTATTGTTTCTTCAAATTACTTTTATCATTTCTCACTCGTATTACTTACTATTTTTT
CGTTGCTGTTTTTTAGTTCTAAGTTTTGTGTGCTATCCAAAAAACGTTACAGTTTGGTGC
ATTGATAAATTTTGTGTGTAAATATTTTTTTTTCTTGCTATGTATTTTTGCAGTTGAGTA
TTTTTCCTATTTTACACGAGGATTGGTTATGCTTAAGGTAATTTTTGAAAACCTATACAT
TTACTTTTAGGATCAGCAATCTAATAACACATTCAAAACTTTTAATTTACGCAAACATGT
AAAACATTTTCAGTACCTTGCACATTCATTTTTTTAACAAGTTCCAACACTAAACACACA
GCAGGAATTAAATGTCTGCTAGCAGCTTGTAGTATGTTGATGCAGTATATAACCTAGCTG
AGATTTTAAACATCTAAAAACATCCTTTTTTACATGAAGCATACTACCCACATTCTACAC
ATGTGTGTATATGTGGAAAATTTTCATTGTGTATTCGTAGCTGTCACTATTGTTGTAAAT
TGCCTTTTTTCACGTACTTGGGACTTGATTTACTGGTCAAATGGCATTATTATATACTCT
CTACCGAACCAAATACGTTCCCTTGAAAGAGCGTTTGTATTTGACTTATTATATGGTTTA
AAGATTTAAAGAAAAATATTGGTTTTTAAATGCATAAAAATTAAAGTTACCACTGTTTTA
CTCATATCCATTCTATAGATGCTGGAGCTAGCTTTTGTGCATTTTTCAGTTACTTACGTC
TCTCCATATTCGACAAATTGGCACCTTGCCTATTGTGCATTTTTGTTTTATGCTGTAGTT
TTTGTTATGCAAATAATAGAGCATTTATTGGACCCTATTACATTTGGTGAATGTTTGTTT
TAGGAAGATGGTTGAAACAGTCTGTTTTATCACTCAATCTACAAAACCCTGCTACAAAGA
CATTATTACAAGTGTACAAGATTTTATTGCCACAAAAGTGCACAAATTTCAATTCAAACC
AATTTTCATCCTGTTTGTATATTAGGGCAATACAGCATATGCAACAAAACTGTGTTGAAT
CCAAGTTGACCCAAATAGGTAAACATTTCCCCATCCATATGTCCCTAATAATGAAGTCAA
CCAGCACAATCACTAATATGTAAAATTTTGTACAACTGAATGCCTGTTCACTATATGTAT
GCCAAACATACATATTAAAGCATCTAAGACCCTACTTTTCAGTTCTACCAACAAACCACA
AAGCAAAAGTACAAAGAAGAAAAAGTCAAACAAACTTCACACACAAGTGACAAAGACGCA
CTAGTTCCCATGCAAATGAGATAGAAGGCCACTATTCAACTTCTGGACTTTAAATCATTT
ACCCAACACTTAATTGACTTTTAATTGAGCACCAGGCCTCACAATAAAACCATATCATAC
AAAAACACATGGAACTTACAGCAAAAGATAAAAATTACTACTATGATTTTTCATGGTATT
CTATAATACTAGTTGATAAATGATAACCTTACCTTTTTGACAAAAACAGTATTTTTTGCT
GTAGGGATCATAAACTTTAAATCTCTAGTAGACTTACAAAGAAAGAAAAATCACAAATAA
CCAAATCTATTTACACCAGCATTAGCAAATGTACATGACCATATGCTTGTACAAAAGATA
AAATCATGTAGCATTCTGAGAAGTGCTTGTGACAAAAAGTGCAAAACTAAAATCAGTTTA
ACGACAAACAACCAATAACTGGACACTGCATTCAAGTAAAGATTTCAACTCTAAAACTGA
AAGTTTACCAAATGCAGAAATTGTGAAGCACAGTACTTCAAAACAAAGTCAATATAGACA
CAGTTTCCAGAGAAAAACACATTAAATCTCAAGCAAAAAATCCACCATTTCTATGTCTTT
GTTGGCGCTGCTGAACCCTTTGCTGTGGCGGTCTAGCATTTCTCTCCTCCCTGTACAAAA
GTACTTGCACTGCTCTATTAATATCTCCCTCACATTCTGATAAGACGTTTCGATTTAAAT
CGAGGTCTTCAAACCCCATTTCAATCAGTACTTCCATTGGAGAGGGGTTGTAATAGGTTA
GGGAATCCTGTGGGGCATTAGGGGTGGCTGGGGCTTGTGGGGCCAGGGTGGGGGGGGGGG
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATTCTTCATCAT
TTGGGTCAGCATCGAGTTGGGGTGGATAGAGAATTTGTGGGTTGTCATCTTCTTCTGCGT
TGTCAATTTCCTCGTTATTGGCTGGCATAGGAGACGCTAAAAACAATATAACTTTTTTTC
TGAAACTGAAAGTCATTTGGAACAAATTCATGAAAAATACGGTAAAACTTGGTGTATCTT
GATTTGGGCCTAATTTGTAAAAAAATTGAGAAACAAATGATTTGTCATGTGGTAAGATTT
TACCTAGTCAACATCTGTTAATCTGGATCTTCACCTAACCCGGACTAATTGTTCGGTCTA
ATTTGGTCCAGATTAACCAATGTTTACTGTATGCCCTTTCCTTATGCTAAACTTAATGGC
ACATTAATGCAACTAGTTTCAAATACTACATCAGCAGTGATGCCATTAAGTAATAGTGGA
CAAAATATGTTCTAATCCAGTGAACTGCAGATTGTTATTAAAGGTCAAAATTAGGATAAA
ACTTTCTTGCATAAAATCCTAGCTTTTGTAATTTATGTTGTAGCCTTGTGCAGTATTGGC
TTAAATTATGTCAAAATGTATTCAACAAAAATGGAAATATTTTATCTACCTGCCATATCA
GATGTTGGTGCCATGTCTTCTACTGCCAGATTTTGTGCTTCCTGTATTTCAGCTGGTACT
GATGATTCTTGGGGCATTTCAGAAGCAGAGGATGTTGGGGTAACTACAGGCAAAGTGGGG
TACATAGATCCTGCTGCTGTTGTCGGTACCCATGGCTCATCAGCATTTAGGACACCTTGT
GGTAGAGTAATGGGATGTTTTATCCATGGCTGTTCTGCATCAATAGGAGCTTGCTCAGGA
ATCTCATAACCCTCAGAATAGTCCTGGACATCACATGGGTTGTCAATGTCCAAGACTGAT
TGTGGAACTGCTTTGGGCTGTGTTATAGACTCTGAGATGTTGGTAGAAGATTTGGATGTA
GATGGGGTTTCACTAGTAAGGCTCCGTTCATCTGTATCTGTTACCATTTTCTCTTGCACT
ATTTCGTCAACCTTTTTGATATCTTCGGAAGCATCTGGAGCATTTGAGACACTGACAGAA
TTGGATAAAACTTCAGGGGCTTCTTCGCTTGAAGAACTTTGCTCTTCTTCGTCAATGACC
ATCACTTCAGTAACAGGCAACACCTCTTCCTCATTCTGTTTAGCTTCGATGGATTGCTCT
ACTATTTGTTCCACCTGCTCTGCATCATTCAAGACCATCATTTCAGTTGTTTGCGATTCC
TGTTTTTCTGTCTTGTCTTCTGTTAGTGACGTTGGATTGGATTTGTCTGGAAAAATATCA
AAAAAATTGTATATTTCGTCTTTCAACTAGCAACAACAAGTAAGGTATTGGTGTAAAAAA
TATTT

InterProScan

PANTHER
GDP_Man_deHydtase (IPR006368) - T[39-398] 2.6E-176
Hamap
GDP_Man_deHydtase (IPR006368) - T[52-396] 56.518
TIGRFAM
GDP_Man_deHydtase (IPR006368) - T[52-393] 6.0E-180
SUPERFAMILY
NAD(P)-bd_dom_sf (IPR036291) - T[52-390] 7.75E-83
Pfam
NAD(P)-bd_dom (IPR016040) - T[55-386] 8.8E-158

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
GMDS_HUMAN 72.113 % 546 0