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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S8...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S80.g02712.01.t

Possible name(s)

NOC3L

Location

S80 [149,346 / 159,924]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 616

>Phmamm.CG.MTP2014.S80.g02712.01.p
MQRKRKNNKSLEEEVFEKKPRFIKGHENAQKSRNVKSRHLLPIKIPSGKIVTQTVEVEQN
EESVDDVPSAPPTSTETESTSITKTNLAANRRVQIAKAKNKIAKLASAIVAEPQANIKYV
KQLRLMLEDETSPESCATTRKLVVASLACLFIDIIPGYRIRERTEKEKKVKLSKEVKSLT
DFEECLLHQYKLFLQYLEKLISKRKRPGKNHLLSAEAEHSLGNIAIQCLCDLYVKTSHFN
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IRPEFLNTLLFLRITKVDYSMVAHKKNKAERKKAKEMKKKMSRRQLKHMKKQKAVENELK
EAAATEDIEQKTQLHTETVQQVFLIYFRILKHKSEEMAQCRSVLPVVLEGLAKFSNLINI
DFFGDLLVHLQRLVSSGELSIRENLHCIFTAFQILTGQGEVLMIDPASFYQVMFTLLNEI
PFNNKLRKSNKDQEQNCASIAIECIEMMLNKRRKQVTIVALKSFIKRLYAITLHLQPSKF
PLAMLDEIRKLFNSNSKSVSLFDIESQSIGSYNAELDDPERTGSNSSVIWETHLLRRHYV
PLVSQTATRIVKDFAV

Nucleotide sequence

Length: 6,536

>Phmamm.CG.MTP2014.S80.g02712.01.t
GTGAAGGCCATATAGTACACAAGGATGTCGCATCAGTTAACTAGGATTGTTCGGGGATTG
TCTGCTACTGGAATAAGATGTCTGTCAACAACAGCTGCCCAGAGTGGACATGCAAACTTT
AAAATTCATATTCCAACTTTCGTCAAAGCCACCATTTCAAAGCACAAAATCGATTATGAT
TTAGAAGCAAGAAAAGATCCAGATATGGAAACAATTGATTCCGAAACCCAAGCTGTACAA
CTTCAAATACCTACTACTGGCACAGATGCTTCATGTCTGACTGGTGTACCTGAAGAGCAT
ATTGTGTCTAGGAAGGTCCGCATTTTTCGTCCCGCTAAAAATGCAATGCAATCAGGAAAC
CAAAACACAAAGCTGTGGAAAATTGAATTTGACACAATGGAAAGATGGGAAAATCCAACA
ATGGGTTGGGGATCAAATGCTGATCCATTATCTAATATTTCGATGGCAATGAGTTTTAAA
ACCAAGGAGGATGCAATGGCATTTGTGGAAAGACAAGGTTGGTCTTGTTATGTGGATGAG
GCAAAGGAAAAACAAATGCAACCGAAGTCATACGGAGCAAACTTTTCGTGGAATAAACGG
ACTCGGAGGGCAATGAAATAAACAACGAACATGAAATAAAGTTTATTTTTGGTTTCATTG
AACATTATTTGTTGTCGCATCATACTTGATAAATAAAACACAGATACAAGTGTCAGGAAA
ACAAAAATCATTTCGAAGACAAAGTTTATACTAACACAGAAAACAACACAATTCGAGCTA
CACTGTTGCCATTATACTTGTGTATATACAGTGTTTAAAGTTGGTAGTTAAAGAAGAAGT
AACACGATGTGACCAGGTAGCAATAACGCCTAGTCAAAATTTGTCACAATTTAATGAGTA
GATTAGTATTTTCATTTTTTTAGTGGTTGAGCTGGGATGAAGCATTTTAAACCACTGTTG
TTTATTAAATAAAATACCAAAAATATAACCATAGTAACAATTTTTGTTGCTTAATTTAAT
TTGACCTGTTGTGATGTTTAAAATGTTGCAACAGCCAAAACCAATGTTGGACAACTGAGT
AAATCAAATGACAGGCTGGTAGTACAAAAATATTAATATTCCATGTTTTAGAGAACAAGA
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AACACACAACACACATACATTTTAAAGGAATGACAACTTTGTGTCTTGCAACAAACAAAA
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ATTTAAATGCTGCACAAAGTTCTAATAGCTGTGTAATTATCAAAACATGCTTTTTAAATG
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TTAATAAAATTTGACCAGCTTATTTTTAAGTTGTTGTGGTGTAATAATCTTAAAAACCCA
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GACAAGTAAATAGGTTCATCATGGTGCTGAAAAGTTTGCCGACCCCACGACTAAATTGTG
AAATACTACATTGACAAATGATCAAAACATGTTCCTGGTGTGGCTACGAAAATATAACAT
TTACTCACTCCTGCAACACTTCAATAACACTGGTTAAAAGTAGAATAATATGCATGAAAA
CAATCACGCTTTGTAAATAAAATTGGCAAATAGGTTTAAGGTAGTATACTTAAACGTTAT
ATTCTGCCGATTGGTTGCTGTTCATTTGAATAGTATTGTTTTAAGTGGTTTCCAAAACAC
TCAAAGCTTACGAACAAACCGTCCACATCAATTTTGGAACTTGATTTAACAATAATATGT
GGGTTTGTTTGCATTGCTTCACGTAAATGAAGCTCCTCAATGACCTAAAAACATTGTGGC
AAATATTTAAAGCAAGTCAGGTTTACATGTGTGTTTTTAAAATTGGCTCGGCAACCTGCA
ATAATATTGAGTTTGATCTTATTTTAATTGTGGCTTATATTGGGTATTTGGGAAAAACAC
TTATGAAAAACTTGTGCACACATAACATAATAAACCCATCGAACATTAATTAGGAGTACA
GCGAACATTTATTAGGCAGGTTGACTATTTAAATATATTTGATTAGCACCTCAATATTCT
GTTATCATTCCAAATTAAGCTAGGGTAACTATATGCCTAGGAAATGTGTCAACTATATCA
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AATCAAACTATTACAAATACAAGAAGTTTAAAGTAGGATTCTCTGTTAAGACGCATATTT
TATAACAACAAAAGTGCCCTTTGTAATACATATTTAAGAAACTAACCTTTGCATCAGTGC
TAGTCCCGTCCAAGTCTTGTTTGTTGCATAAAATTAACCATGGTAAAGTGTGTAGGTCTG
GGTGTTTTAAAGCTTGGTGGAGTTCAAGTCTTGTGTCTTCTAAACGATCGTGATTACAAG
ATCCGTCAATCACAAAAATTACTCCTTGTGCATTATTGTAGTATCGGTGCCAGTATGTGC
GAATGTTGTCACCACCTGAAATAATTTATGGGAAACATGGTTATGGCACCCACCAAACTT
TGTGTACATCACATACTTACCCCCAAGCTCTTTAACTTTTACGGTGATATTGGGAAGTCG
GATGTCCTTCATCAGAAATCCTTTGAACACAAAATTAGAAATGTACCAAAGTTATCATGT
TATTGTTACAACAATACACATGGGTATAATGTTGTTGCCAGGCAAATTTTATAAACCTTC
CTTCTTGCTCAACCATAAATTATAAACAACTACATATATTAACATTAAAAAGTATAAACA
ATAAACATGTTTCATTTTGACAAGAATTGTAAAAAAACAATGCTGTCCTTAAAAGCAAGG
AGTGAATAAATGATAAACTGCAGACAGTGTACACAGTTTCGACCTATAAGGTCTCATCAA
TGCAGCTGGTGATGAGTTGTGGCATCGCACAGACAAGGTGAGGCATGAGTTTTTACCCTG
TTACTCCCAACAAACTGGAGTTTCAATGGATGGCTACACTAACCTCTCTTCACCAACTGC
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ATTTACAAAATGTCAGGTTATATTACCCATTGTAGGAACAACAGTGTCAGAATTTTCATG
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AAATACTGGTGGCGTTGGTGCTTCTTCTTTGCAGCAAACACATTGGTATAACTGAAAGAA
ACACAAATTAGTTAAGGCAAGAATGGAAAAGTAAATTATTAATGGTAGACAAAGTGATAC
TTCAAAAAACTACAGGTGACCTTAATACATTAAATATATTTACTTAGATAAAACAACCTT
ATAAGTTATAATACTTGGTAAAGTTTTGTAAACAAAACAAATTGATTTTGTAACATAAGG
TTTTACAAAACTATTATGACAAGAAATTCAAAAAAGCTGAAAACAATAAAAAAGTAGACA
ACACAACAATAGGACATATGTCCAAAAATGTGCTTGTATAAAGATTAAGAGCATTGTAAT
TATTTCAATTACATATTTCTTTTAATTGCACAATCATTTTCCTGTCATAACTCACAGTAT
AGCAACATATCCTGCAAAATCCACAGCATAGACCGCACGACTGGCTCATGTTTTGCTGGA
GGAGTGAAATAATTTCCCTCCCAATTCACAAATAAACAAATGAATCACTCCATACTAACA
TTTATCAGAAAACTTTCACTACACAAGTTTTAAGCTGTCAGTTATTGAAAAGGGTATGTT
ATTTAACTAACACACCTATTTTATTAAGTGTAATTTTCGGTTAAGAACAAGATAATACTA
CAACTCTACAACCACAAAACAACAAACAAACACAGTGGTATATATAACAAACGATACACA
GCAATATTTTAACACCATTGTCACATCATCACAAAAAACAAATAAGTAGCAACAAAAACC
CAGATTTACAATAAATTCTGATCGGGAACATTTCGAAGCTTGTTAATTAACGCCAAATCC
GAAAACTCTGCTAATGGATGAGACGAACTGCAAAGACAAGAGTTTTACAATGTTAGAAGC
ATGTGTTGTGTTTTAAGTGTTCAAATTTGATAAATATGTATTTAAGTGTTTGGATATTTT
AATTTTGTAATTTTACTTGCCTTTTGACTTTGTTTTATGGAGAAAATGTTTTATATATTT
TGCAAAGTGGATGAGAGAGAAGGATATTTGCCGACAACAACGTGGTTGACTTGGCCTGTA
CAAATGCATTGTTTTGTTGACAAAATAAGTTTTTTGCTTTTGTGAAGCATGCAGCGAAAG
CGCAAAAACAATAAGTCGCTCGAAGAAGAAGTGTTTGAAAAGAAACCGCGATTTATCAAG
GGACACGAGAATGCTCAGAAATCGAGAAACGTAAAATCTCGTCATTTACTCCCAATTAAA
ATTCCTTCGGGTAAAATTGTTACCCAAACTGTTGAAGTTGAACAAAATGAAGAGAGTGTT
GATGATGTTCCGTCTGCACCACCCACTTCTACCGAAACTGAAAGCACATCAATTACGAAA
ACAAATTTAGCTGCAAACAGAAGAGTGCAAATTGCCAAAGCAAAAAACAAAATCGCCAAG
TTGGCATCAGCCATCGTTGCGGAGCCGCAGGCCAACATAAAGTATGTAAAACAACTACGA
CTGATGTTAGAAGATGAAACGTCGCCTGAAAGTTGTGCCACCACGAGAAAGCTGGTTGTT
GCCTCACTTGCTTGTCTTTTTATTGATATCATACCAGGTTACAGGATTCGGGAGAGGACC
GAGAAGGAAAAGAAAGTAAAGCTAAGCAAAGAAGTAAAATCTCTAACTGATTTTGAAGAA
TGTCTTCTTCACCAATACAAACTTTTTCTTCAGTATTTGGAGAAATTGATTTCAAAGCGA
AAAAGACCTGGAAAGAACCATTTACTCTCCGCTGAAGCTGAACATAGTTTGGGCAACATC
GCCATCCAGTGTTTGTGTGATTTGTACGTGAAGACGTCACACTTCAACTTTCACAACAAC
ATATCCATCGTAATTGTGCCCATTGCGAATGATGATGCAGATCCCACCATCAGAAAATAT
TGCTGTGATGCGATCCAAACTTTATTTGCGACTGATAAACTGGGAGCTTCTACTTTTGCC
ACTGTTAGAGCAATGTCTAATGTTGCGAAGCAAAGAGGCCCCAAGAAAATCAGACCAGAA
TTTTTAAATACTCTGCTGTTTTTAAGAATCACGAAAGTGGATTATTCGATGGTGGCACAC
AAAAAGAACAAGGCAGAGAGAAAAAAGGCAAAAGAAATGAAGAAGAAAATGTCTAGGCGG
CAATTAAAACATATGAAAAAGCAAAAAGCAGTTGAAAATGAATTGAAAGAAGCAGCAGCA
ACTGAAGATATTGAACAAAAAACTCAACTTCATACTGAAACAGTTCAACAAGTGTTCCTT
ATCTATTTTAGGATCCTCAAACATAAGTCAGAAGAAATGGCCCAATGTCGTTCTGTTCTT
CCTGTAGTGTTAGAAGGCCTTGCTAAATTCTCAAATTTAATTAATATTGACTTCTTTGGA
GACTTGCTTGTTCATTTGCAAAGACTTGTGTCATCTGGGGAACTAAGCATTCGAGAAAAT
CTACATTGCATCTTCACAGCTTTTCAGATTCTCACGGGACAGGGTGAAGTCCTTATGATT
GATCCGGCAAGTTTTTATCAAGTTATGTTTACACTGCTCAATGAAATTCCATTTAACAAC
AAGTTACGAAAATCAAACAAGGACCAAGAACAGAATTGTGCATCGATTGCAATTGAATGC
ATTGAAATGATGCTCAACAAACGACGCAAACAGGTGACAATCGTGGCATTGAAGTCATTT
ATTAAACGACTTTATGCCATAACTCTGCACTTGCAGCCGTCCAAATTTCCTCTGGCAATG
TTGGATGAAATCCGTAAATTGTTCAACAGCAACAGCAAAAGTGTTTCTCTTTTCGACATT
GAATCGCAATCGATAGGTTCATACAACGCCGAACTGGACGACCCTGAAAGAACCGGTTCA
AATTCGAGTGTTATCTGGGAAACTCATTTATTACGCCGCCACTATGTGCCGCTAGTGAGC
CAAACTGCGACGAGAATTGTGAAGGATTTCGCTGTTTGACGCAAATAAATCTGGAA

InterProScan

PANTHER
Nucleolar_cplx-assoc_3 (IPR016903) - T[5-612] 6.3E-166
Pfam
Noc3_N (IPR011501) - T[98-193] 2.8E-25
Pfam
CCAAT-binding_factor (IPR005612) - T[445-607] 2.2E-16

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
NOC3L_HUMAN 40.357 % 388 1.82E-125